More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2682 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.83 
 
 		 1114 aa  770    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  55.19 
 
 		 7210 aa  1210    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.48 
 
 		 1584 aa  1308    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  54.1 
 
 		 4575 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  55.64 
 
 		 1601 aa  1491    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  49.68 
 
 		 4111 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  46.39 
 
 		 2719 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  49.24 
 
 		 2066 aa  819    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  53.38 
 
 		 1789 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  52.36 
 
 		 3463 aa  1124    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  33.39 
 
 		 3089 aa  924    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  44.77 
 
 		 3508 aa  872    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  33.16 
 
 		 3108 aa  947    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 		 2880 aa  816    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  47.53 
 
 		 4607 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 		 2551 aa  1149    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 		 1874 aa  736    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.13 
 
 		 1656 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.04 
 
 		 2846 aa  715    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 		 1587 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.59 
 
 		 1837 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.88 
 
 		 4183 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.71 
 
 		 5400 aa  1300    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  44.73 
 
 		 3449 aa  1727    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  48.56 
 
 		 3494 aa  980    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.27 
 
 		 1087 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.77 
 
 		 1559 aa  844    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.01 
 
 		 2762 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  51.52 
 
 		 1831 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  53.13 
 
 		 4840 aa  1076    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  49.43 
 
 		 3711 aa  1121    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  44.65 
 
 		 1402 aa  741    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.03 
 
 		 2081 aa  1189    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  40.7 
 
 		 1349 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  50 
 
 		 1820 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.21 
 
 		 1337 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.21 
 
 		 3355 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  50.38 
 
 		 2126 aa  787    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  54.75 
 
 		 2060 aa  824    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.22 
 
 		 3693 aa  1549    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.31 
 
 		 1372 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.75 
 
 		 1520 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  45.7 
 
 		 3400 aa  718    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 1580 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  50.15 
 
 		 2847 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  51.17 
 
 		 1548 aa  1232    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  55.27 
 
 		 4151 aa  1155    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.62 
 
 		 2551 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.13 
 
 		 1867 aa  790    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  43.53 
 
 		 1354 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  47.49 
 
 		 5255 aa  953    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 3092 aa  6009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  47.28 
 
 		 1955 aa  1246    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  54.2 
 
 		 2374 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 		 3874 aa  967    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.03 
 
 		 3176 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.67 
 
 		 4478 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  54.52 
 
 		 4080 aa  1159    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  33.45 
 
 		 3130 aa  1123    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.22 
 
 		 3693 aa  1549    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.47 
 
 		 6768 aa  1435    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.75 
 
 		 1520 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  55.07 
 
 		 2107 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 1580 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  53.69 
 
 		 3670 aa  1040    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.96 
 
 		 3930 aa  937    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  41.89 
 
 		 3676 aa  1482    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  45.32 
 
 		 2477 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.72 
 
 		 3696 aa  1501    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  44.29 
 
 		 2024 aa  1105    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  56.23 
 
 		 2113 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.23 
 
 		 3408 aa  907    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  33.29 
 
 		 1581 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  33.53 
 
 		 3093 aa  972    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 		 3645 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.69 
 
 		 3158 aa  1924    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  49.36 
 
 		 1143 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  57.2 
 
 		 3033 aa  3000    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  53.53 
 
 		 2376 aa  920    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  47.82 
 
 		 1924 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  47.89 
 
 		 3254 aa  1445    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.12 
 
 		 1071 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 		 1559 aa  854    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.33 
 
 		 4930 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 		 3702 aa  1546    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.87 
 
 		 1537 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 		 7110 aa  1197    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  36.25 
 
 		 1580 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.58 
 
 		 2966 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  57.08 
 
 		 1602 aa  938    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  46.4 
 
 		 3493 aa  1777    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  49.45 
 
 		 1593 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 5154 aa  1244    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 		 3679 aa  1533    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  58.7 
 
 		 2367 aa  922    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 3090 aa  943    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  50.28 
 
 		 2090 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.78 
 
 		 1816 aa  1124    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.92 
 
 		 1349 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.66 
 
 		 7279 aa  2496    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>