More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3294 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  34.23 
 
 
2108 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 
2230 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.92 
 
 
2966 aa  1142    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  49.84 
 
 
1071 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.11 
 
 
1559 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  49.36 
 
 
3493 aa  1168    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  47.25 
 
 
4882 aa  1231    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 
3645 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.32 
 
 
3101 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.77 
 
 
1820 aa  1039    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  35.37 
 
 
1577 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.98 
 
 
2719 aa  1555    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.23 
 
 
2066 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.84 
 
 
2880 aa  762    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  35.1 
 
 
2101 aa  797    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.91 
 
 
3158 aa  1217    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.06 
 
 
2376 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  49.05 
 
 
3254 aa  1357    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  46.17 
 
 
1616 aa  1062    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 
1837 aa  918    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  45.42 
 
 
4111 aa  1136    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
2551 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
1874 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 
1656 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
1144 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.48 
 
 
1587 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  49.37 
 
 
4840 aa  1189    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  45.38 
 
 
2847 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  31.68 
 
 
3080 aa  747    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  100 
 
 
6768 aa  12950    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
5400 aa  1280    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  55.53 
 
 
1584 aa  1439    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
7110 aa  1546    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  57.16 
 
 
1143 aa  904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  50.05 
 
 
4151 aa  3313    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
2333 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  47.48 
 
 
3670 aa  1134    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
2081 aa  1046    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  53.32 
 
 
1114 aa  909    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  39.21 
 
 
3045 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.2 
 
 
2024 aa  956    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  50.78 
 
 
4930 aa  1943    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.17 
 
 
1939 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  52.95 
 
 
3148 aa  979    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 
3693 aa  1038    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.16 
 
 
7210 aa  1515    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.03 
 
 
1520 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.75 
 
 
2846 aa  1066    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.55 
 
 
3355 aa  1135    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.52 
 
 
2085 aa  835    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.24 
 
 
3508 aa  1196    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  51.4 
 
 
4607 aa  1608    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.53 
 
 
1867 aa  1066    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  53.21 
 
 
1789 aa  1196    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  58.19 
 
 
3408 aa  1399    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  53.22 
 
 
5255 aa  1513    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  50.57 
 
 
5154 aa  1377    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  53.53 
 
 
1831 aa  1229    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  51.62 
 
 
1924 aa  1083    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  39.41 
 
 
1832 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  49.21 
 
 
3449 aa  1216    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.48 
 
 
4478 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.86 
 
 
3874 aa  2874    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  49.04 
 
 
3463 aa  1284    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 
3693 aa  1038    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  50.1 
 
 
2374 aa  812    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.03 
 
 
1520 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.21 
 
 
4080 aa  1115    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53.08 
 
 
1593 aa  1222    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.52 
 
 
2085 aa  835    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.5 
 
 
1548 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 
3676 aa  1041    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  46.7 
 
 
2107 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 
3696 aa  807    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  53.84 
 
 
1601 aa  1406    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 
1805 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  50 
 
 
2090 aa  1096    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.24 
 
 
1581 aa  685    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.17 
 
 
2890 aa  727    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.15 
 
 
3494 aa  1516    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.76 
 
 
3092 aa  1436    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.03 
 
 
2232 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  48.53 
 
 
3033 aa  1376    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.47 
 
 
4183 aa  818    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  49.28 
 
 
4575 aa  2552    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.04 
 
 
7279 aa  1387    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.5 
 
 
1602 aa  1225    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.75 
 
 
2762 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 
3702 aa  1042    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.96 
 
 
3711 aa  1261    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.28 
 
 
2113 aa  905    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
1816 aa  1056    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  35.56 
 
 
2085 aa  834    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  48.15 
 
 
2367 aa  1511    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.45 
 
 
1955 aa  1030    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  36.18 
 
 
1537 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 
3176 aa  955    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.81 
 
 
3679 aa  1026    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  46.99 
 
 
2060 aa  1346    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.78 
 
 
2126 aa  1642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>