More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3473 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  45.37 
 
 		 1017 aa  727    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 		 3711 aa  2595    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.88 
 
 		 1402 aa  695    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.46 
 
 		 3645 aa  796    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  57.25 
 
 		 1071 aa  888    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  43.83 
 
 		 3148 aa  1343    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.47 
 
 		 3033 aa  1030    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  46.91 
 
 		 7210 aa  2839    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.38 
 
 		 2078 aa  1033    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 		 2880 aa  757    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 		 3874 aa  1381    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.72 
 
 		 2719 aa  1022    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.78 
 
 		 2066 aa  1172    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.66 
 
 		 2230 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.89 
 
 		 2376 aa  916    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.04 
 
 		 1924 aa  1117    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.99 
 
 		 1602 aa  1077    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  46.3 
 
 		 4111 aa  2148    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.7 
 
 		 4882 aa  2147    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 		 1789 aa  1214    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 2551 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 1874 aa  899    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.37 
 
 		 1656 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.7 
 
 		 3930 aa  1457    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.51 
 
 		 1587 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  42.71 
 
 		 4930 aa  2214    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.8 
 
 		 1548 aa  840    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  50.91 
 
 		 1143 aa  742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  39.73 
 
 		 2277 aa  1299    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.88 
 
 		 3176 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.28 
 
 		 3254 aa  1202    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.08 
 
 		 1867 aa  1228    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.66 
 
 		 3493 aa  1072    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 7110 aa  2719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  46.47 
 
 		 2060 aa  946    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  52.39 
 
 		 2081 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  46.73 
 
 		 6768 aa  1259    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 		 1837 aa  1150    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  31.07 
 
 		 1966 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  46.24 
 
 		 3400 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 		 2232 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.12 
 
 		 1822 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  41.04 
 
 		 3693 aa  897    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  40.13 
 
 		 3508 aa  2154    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.13 
 
 		 3670 aa  1519    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  52.44 
 
 		 2113 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 		 1816 aa  1380    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.53 
 
 		 2890 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  50.66 
 
 		 2367 aa  1145    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  55.01 
 
 		 1955 aa  961    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.06 
 
 		 2551 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  42.97 
 
 		 1820 aa  1189    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.05 
 
 		 1354 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.83 
 
 		 1305 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.73 
 
 		 2126 aa  1005    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.36 
 
 		 2762 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  51.32 
 
 		 2024 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.35 
 
 		 2846 aa  1495    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.59 
 
 		 4478 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  49.5 
 
 		 1601 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.07 
 
 		 5255 aa  2352    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  41.04 
 
 		 3693 aa  897    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.62 
 
 		 5154 aa  1287    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.25 
 
 		 2107 aa  1139    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.66 
 
 		 4607 aa  899    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.54 
 
 		 2090 aa  1213    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.92 
 
 		 1349 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  45.59 
 
 		 3494 aa  2532    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.52 
 
 		 3676 aa  897    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  44.16 
 
 		 2108 aa  964    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 		 3696 aa  880    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  46.87 
 
 		 3408 aa  1917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.61 
 
 		 1909 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.71 
 
 		 3355 aa  1655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 		 5400 aa  2734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.74 
 
 		 4575 aa  1268    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  45.15 
 
 		 3158 aa  1103    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.53 
 
 		 3427 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.28 
 
 		 7279 aa  3439    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  51.12 
 
 		 1584 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  47.13 
 
 		 3463 aa  2581    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  54.64 
 
 		 2374 aa  923    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  40.63 
 
 		 2020 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  48.21 
 
 		 4151 aa  1397    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.34 
 
 		 1593 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.45 
 
 		 2333 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.91 
 
 		 3702 aa  894    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 1832 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.91 
 
 		 2966 aa  1736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.53 
 
 		 1087 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.18 
 
 		 1101 aa  901    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.09 
 
 		 1349 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 		 3092 aa  1147    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  43.4 
 
 		 1831 aa  1185    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.38 
 
 		 4080 aa  2547    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.66 
 
 		 1939 aa  757    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 		 3679 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 4840 aa  9360    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.67 
 
 		 1114 aa  751    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.67 
 
 		 3449 aa  1313    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>