More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11682 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  100 
 
 
1017 aa  2008    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  45.41 
 
 
4840 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  48.3 
 
 
4151 aa  712    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  48.44 
 
 
1402 aa  817    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.89 
 
 
1602 aa  740    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  42.64 
 
 
7279 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.21 
 
 
1101 aa  699    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  42.87 
 
 
2666 aa  633  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.66 
 
 
1087 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  40.18 
 
 
2376 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  39.63 
 
 
2374 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.91 
 
 
1337 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
5400 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
1816 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.1 
 
 
3092 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.19 
 
 
2126 aa  612  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.21 
 
 
1126 aa  612  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 
7210 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  42.55 
 
 
5154 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.49 
 
 
1354 aa  605  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  42.48 
 
 
2846 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  45.3 
 
 
4080 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.16 
 
 
3254 aa  601  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
2551 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  44.01 
 
 
1548 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  39.82 
 
 
1909 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  37.9 
 
 
2551 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  42.52 
 
 
3158 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.82 
 
 
3176 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
2367 aa  589  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
7110 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
1874 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 
1587 aa  579  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
2762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  44.36 
 
 
3494 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  44.29 
 
 
3148 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.32 
 
 
1656 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  43.84 
 
 
3033 aa  572  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.23 
 
 
3930 aa  569  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  42.71 
 
 
3711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  38.86 
 
 
2477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.25 
 
 
2113 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 
2462 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 
2060 aa  559  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  42.84 
 
 
3670 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  41.58 
 
 
2604 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  41.57 
 
 
3424 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  37.14 
 
 
1424 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 
1408 aa  552  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
1837 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42.04 
 
 
3463 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  41.31 
 
 
3045 aa  551  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 
1653 aa  552  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  39.11 
 
 
1574 aa  549  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  42.05 
 
 
2847 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.5 
 
 
1349 aa  546  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  39.51 
 
 
4264 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.49 
 
 
1349 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.96 
 
 
1305 aa  542  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  43.15 
 
 
4575 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 
1939 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.57 
 
 
2232 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.55 
 
 
2066 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.36 
 
 
4478 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.02 
 
 
1559 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  41.81 
 
 
1789 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.25 
 
 
1559 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 
3645 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  39.62 
 
 
4882 aa  527  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 
3693 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 
3693 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  41 
 
 
3408 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 
3702 aa  529  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  39.7 
 
 
2081 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  40.74 
 
 
3508 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.29 
 
 
1372 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
3874 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 
1646 aa  523  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  40.55 
 
 
2544 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  40.55 
 
 
2544 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  36.81 
 
 
3337 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 
3099 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  35.51 
 
 
3252 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  39.06 
 
 
4165 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
2498 aa  519  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  38.75 
 
 
1071 aa  519  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  40.2 
 
 
2545 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  39.37 
 
 
2943 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 
3089 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  37.34 
 
 
3130 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.17 
 
 
3676 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.52 
 
 
3679 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  39.75 
 
 
3427 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  40.07 
 
 
2545 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 
2047 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 
1472 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 
1472 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  41.92 
 
 
1831 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  36.77 
 
 
1472 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  37.58 
 
 
3449 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>