More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2832 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  43.99 
 
 
1560 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  42.38 
 
 
2454 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  37.46 
 
 
2176 aa  667    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  42.44 
 
 
1424 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.37 
 
 
1466 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 
1646 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  37.99 
 
 
995 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  42.78 
 
 
1653 aa  735    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  42.49 
 
 
4647 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  45.28 
 
 
1574 aa  770    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  37.99 
 
 
995 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  44.79 
 
 
4646 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  40.3 
 
 
1833 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  43.69 
 
 
3108 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  43.92 
 
 
3093 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 
2498 aa  720    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  41.46 
 
 
2150 aa  660    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  43.19 
 
 
3090 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1472 aa  2971    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  39.86 
 
 
2273 aa  683    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  44.62 
 
 
1520 aa  716    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  41.96 
 
 
1909 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  40.62 
 
 
1302 aa  723    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  42.64 
 
 
3089 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  43.78 
 
 
2093 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1472 aa  2971    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  45.4 
 
 
1795 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  58.9 
 
 
1470 aa  1703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  37.7 
 
 
1408 aa  700    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  41.29 
 
 
1582 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  42.74 
 
 
2684 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  45.78 
 
 
1911 aa  701    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  43.59 
 
 
1535 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  46.21 
 
 
1466 aa  694    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  57.34 
 
 
1489 aa  1656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  99.73 
 
 
1472 aa  2967    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  38.7 
 
 
2710 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  57.9 
 
 
1488 aa  1694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 
3130 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  40.8 
 
 
4186 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  39.44 
 
 
2682 aa  632  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  38.52 
 
 
2679 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  42.51 
 
 
2604 aa  628  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  40.6 
 
 
1486 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
974 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  41.11 
 
 
1416 aa  606  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  37.67 
 
 
2316 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.1 
 
 
3335 aa  599  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  35.63 
 
 
1612 aa  585  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  35.63 
 
 
1612 aa  585  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  41.71 
 
 
1497 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.52 
 
 
6889 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 
1465 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.73 
 
 
3194 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 
2551 aa  552  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.94 
 
 
4239 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  40.94 
 
 
4265 aa  549  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  40.94 
 
 
4265 aa  549  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.04 
 
 
1656 aa  542  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.9 
 
 
3133 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 
1587 aa  536  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.9 
 
 
3127 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  37.08 
 
 
3163 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.27 
 
 
1087 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  36.89 
 
 
3173 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.38 
 
 
1337 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  36.67 
 
 
1017 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 
3275 aa  522  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1000 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  38.01 
 
 
1524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  38.96 
 
 
2243 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 
2477 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
2551 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  39.59 
 
 
2943 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  38.45 
 
 
1528 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 
2762 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 
2226 aa  512  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  38.28 
 
 
1530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  38.28 
 
 
1530 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 
1354 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.11 
 
 
3693 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.11 
 
 
3693 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 
3702 aa  502  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 
3676 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.71 
 
 
3176 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.18 
 
 
3424 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.54 
 
 
2462 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 
3463 aa  492  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.19 
 
 
1101 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.09 
 
 
1939 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.55 
 
 
1559 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37 
 
 
2880 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
1874 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.44 
 
 
1559 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.97 
 
 
1372 aa  486  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.21 
 
 
3679 aa  483  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.22 
 
 
4478 aa  483  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
3696 aa  483  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  46.91 
 
 
3235 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  37.42 
 
 
3711 aa  475  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>