More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1672 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  47.82 
 
 
1911 aa  729    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.52 
 
 
6889 aa  1040    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  45.2 
 
 
2604 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  39.54 
 
 
2176 aa  1471    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  46.32 
 
 
1466 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  39.63 
 
 
1174 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.97 
 
 
3133 aa  824    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  35 
 
 
2316 aa  912    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  38.7 
 
 
4186 aa  859    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  41.71 
 
 
995 aa  685    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  43.72 
 
 
3093 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  38.34 
 
 
1612 aa  675    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  39.83 
 
 
1153 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 
3130 aa  720    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  49.39 
 
 
2710 aa  2594    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 
1582 aa  743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  40.61 
 
 
2273 aa  1493    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  45.87 
 
 
1424 aa  805    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  35.98 
 
 
1786 aa  1105    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  39.11 
 
 
1153 aa  720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  45.69 
 
 
1646 aa  1374    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  44.28 
 
 
3090 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  45.82 
 
 
3089 aa  756    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.13 
 
 
4239 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  35.73 
 
 
3099 aa  864    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  49.45 
 
 
2498 aa  770    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 
1408 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  46.94 
 
 
1574 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  32.18 
 
 
3044 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  39.29 
 
 
3235 aa  746    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  45.58 
 
 
1560 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  42.57 
 
 
1833 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  38.44 
 
 
1612 aa  677    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  33.48 
 
 
2943 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  27.27 
 
 
3718 aa  1086    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  44.77 
 
 
2150 aa  716    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  48.04 
 
 
2679 aa  2459    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  42.83 
 
 
1909 aa  721    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 
995 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.22 
 
 
4478 aa  1454    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  49.26 
 
 
2684 aa  2352    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  46.75 
 
 
4646 aa  750    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  41.41 
 
 
2093 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  42.12 
 
 
4647 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.95 
 
 
1520 aa  729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
3335 aa  6752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  46.14 
 
 
1653 aa  801    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 
1535 aa  725    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  28.59 
 
 
3739 aa  791    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.97 
 
 
3127 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  45.68 
 
 
2682 aa  2230    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  42.33 
 
 
2454 aa  1484    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  43.97 
 
 
3108 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  40.07 
 
 
4265 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  39.99 
 
 
4265 aa  851    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  47.02 
 
 
1795 aa  732    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 
1416 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  43.94 
 
 
1302 aa  788    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  31.49 
 
 
3157 aa  637  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 
1489 aa  630  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  31.26 
 
 
3133 aa  629  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  42.36 
 
 
1486 aa  625  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  38.25 
 
 
1488 aa  626  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  31.3 
 
 
3148 aa  626  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  40.51 
 
 
1470 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 
974 aa  619  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.33 
 
 
1656 aa  620  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
2376 aa  618  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  33.65 
 
 
2374 aa  616  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  41.09 
 
 
3194 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  44.29 
 
 
1497 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  38 
 
 
1472 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.12 
 
 
2832 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  37.9 
 
 
1472 aa  597  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  37.9 
 
 
1472 aa  597  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  33.12 
 
 
2832 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 
1466 aa  593  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  32.82 
 
 
1093 aa  591  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  33.21 
 
 
2835 aa  594  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.18 
 
 
1587 aa  590  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.31 
 
 
2792 aa  590  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.85 
 
 
2839 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.85 
 
 
2839 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.47 
 
 
1087 aa  584  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.49 
 
 
1160 aa  579  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.28 
 
 
1337 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  33.7 
 
 
1740 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 
2462 aa  576  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.28 
 
 
6403 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.32 
 
 
2762 aa  573  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.11 
 
 
2551 aa  565  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.73 
 
 
3432 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
2551 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.44 
 
 
1874 aa  560  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  41.74 
 
 
2226 aa  560  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  28.59 
 
 
4354 aa  556  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  34.83 
 
 
1668 aa  552  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 
2063 aa  553  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.5 
 
 
2033 aa  553  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.43 
 
 
4747 aa  549  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>