More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0977 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  40.77 
 
 
4268 aa  733    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  41.9 
 
 
2006 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  42.31 
 
 
2706 aa  1184    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.13 
 
 
6889 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  30.43 
 
 
2336 aa  788    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  34.5 
 
 
2230 aa  1064    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  49.56 
 
 
1514 aa  1067    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.3 
 
 
4960 aa  762    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  29.92 
 
 
2258 aa  824    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  31.13 
 
 
2710 aa  890    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.37 
 
 
2345 aa  780    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  30.97 
 
 
2310 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  49.73 
 
 
1157 aa  937    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  43.51 
 
 
3021 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  26.89 
 
 
2156 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  26.82 
 
 
4747 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  26.3 
 
 
6403 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.11 
 
 
6676 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  27.91 
 
 
3308 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.05 
 
 
4960 aa  755    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  45.25 
 
 
1734 aa  814    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  31.72 
 
 
2350 aa  872    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  41.26 
 
 
1862 aa  713    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
3739 aa  7730    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  36.76 
 
 
1786 aa  1153    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  30.3 
 
 
2174 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  38.61 
 
 
2619 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.9 
 
 
4968 aa  751    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  40.72 
 
 
1321 aa  670    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  53.34 
 
 
1272 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  39.09 
 
 
2090 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  39.29 
 
 
2084 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.02 
 
 
4502 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  38.45 
 
 
1888 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  30.29 
 
 
2682 aa  793    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  36.84 
 
 
3002 aa  1259    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  50.21 
 
 
1157 aa  947    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  38.97 
 
 
1104 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  45.31 
 
 
3194 aa  837    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  41.4 
 
 
3252 aa  914    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  29.92 
 
 
3335 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  29.17 
 
 
3044 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  36.51 
 
 
3875 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  39.16 
 
 
1894 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  32.76 
 
 
4354 aa  1610    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.01 
 
 
3291 aa  712    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  33.57 
 
 
3099 aa  912    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  34.77 
 
 
2684 aa  847    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  39.77 
 
 
1884 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  41.75 
 
 
4165 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  26.99 
 
 
3718 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  49.08 
 
 
2508 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  41.34 
 
 
1326 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  31.03 
 
 
2679 aa  860    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  35.73 
 
 
3293 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  42.92 
 
 
1845 aa  764    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  39.29 
 
 
2023 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  27.24 
 
 
2193 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.31 
 
 
4478 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  30.35 
 
 
2338 aa  782    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  39.75 
 
 
2896 aa  713    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  27.17 
 
 
2189 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  26.11 
 
 
2448 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.94 
 
 
1487 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  51.29 
 
 
1613 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  41.91 
 
 
1837 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38.77 
 
 
1897 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  43.95 
 
 
1835 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  26.87 
 
 
2156 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  26.88 
 
 
2156 aa  636  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  38.96 
 
 
1824 aa  636  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  39.6 
 
 
1825 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  49.68 
 
 
3695 aa  633  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  26.83 
 
 
2154 aa  633  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  27.27 
 
 
4991 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  39.81 
 
 
1825 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  38.64 
 
 
1809 aa  632  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  39.81 
 
 
1825 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  33.63 
 
 
3133 aa  630  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  33.74 
 
 
3148 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  33.27 
 
 
3157 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  26.41 
 
 
5230 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  48.74 
 
 
2006 aa  624  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  26.73 
 
 
3639 aa  621  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  28.14 
 
 
2943 aa  623  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  29.31 
 
 
1837 aa  624  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  38.59 
 
 
2035 aa  623  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  38.1 
 
 
1809 aa  619  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  26.68 
 
 
3470 aa  617  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  36.34 
 
 
2200 aa  612  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  26 
 
 
4317 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  26.05 
 
 
4317 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  35.62 
 
 
1158 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  26.21 
 
 
6661 aa  606  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  26.04 
 
 
4196 aa  607  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  25.9 
 
 
4336 aa  603  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  26.25 
 
 
4317 aa  603  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.81 
 
 
1113 aa  603  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  26.3 
 
 
4336 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2385  Beta-ketoacyl synthase  48.29 
 
 
1298 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0539638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>