More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3675 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.71 
 
 
3291 aa  843    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  32 
 
 
3470 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  31.74 
 
 
2155 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  29.72 
 
 
2174 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.31 
 
 
4317 aa  793    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  45.04 
 
 
4268 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  43.15 
 
 
2006 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.34 
 
 
5953 aa  906    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.59 
 
 
6889 aa  875    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.94 
 
 
2385 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.5 
 
 
4336 aa  830    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  32.46 
 
 
2151 aa  856    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  32.74 
 
 
2187 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.3 
 
 
3639 aa  734    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  31.97 
 
 
6999 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.72 
 
 
5929 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.15 
 
 
8914 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.5 
 
 
3432 aa  828    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.54 
 
 
4531 aa  804    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.8 
 
 
2385 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  29.28 
 
 
2345 aa  912    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.8 
 
 
2385 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  27.96 
 
 
2385 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  29.52 
 
 
2338 aa  912    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  34.72 
 
 
2125 aa  819    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  39.82 
 
 
3021 aa  1273    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.57 
 
 
4336 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.37 
 
 
2154 aa  862    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  46.3 
 
 
1734 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  35.1 
 
 
3875 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.81 
 
 
5926 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.38 
 
 
9498 aa  881    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.32 
 
 
5372 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  32.46 
 
 
2137 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.42 
 
 
13537 aa  797    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.54 
 
 
6676 aa  909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.38 
 
 
3629 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  33.3 
 
 
2201 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  26.2 
 
 
6404 aa  658    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  31.4 
 
 
6661 aa  823    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.57 
 
 
3308 aa  947    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.76 
 
 
3498 aa  898    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  31.47 
 
 
4991 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.12 
 
 
2370 aa  846    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  29.17 
 
 
6274 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.67 
 
 
6072 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.08 
 
 
2385 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  28.92 
 
 
3291 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.29 
 
 
8915 aa  760    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.94 
 
 
4968 aa  895    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.58 
 
 
4502 aa  938    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.36 
 
 
4317 aa  825    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  38.17 
 
 
1157 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.62 
 
 
5422 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.18 
 
 
4882 aa  810    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  38.86 
 
 
3002 aa  1275    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.11 
 
 
4332 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  30.98 
 
 
5230 aa  722    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.55 
 
 
2571 aa  849    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  39.49 
 
 
3194 aa  781    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.32 
 
 
3252 aa  1051    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.8 
 
 
2385 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  30.82 
 
 
4037 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.29 
 
 
2156 aa  768    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.88 
 
 
5328 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  41.12 
 
 
2174 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  31.06 
 
 
4290 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.58 
 
 
4489 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  30.83 
 
 
3102 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  25.91 
 
 
2581 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  44.57 
 
 
4165 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  30.51 
 
 
1837 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.86 
 
 
2386 aa  680    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.73 
 
 
8646 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  29.55 
 
 
5596 aa  780    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  28.85 
 
 
3348 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  31.95 
 
 
6081 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.52 
 
 
4317 aa  831    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  30.46 
 
 
4342 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  29.16 
 
 
5620 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  44.23 
 
 
2706 aa  793    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  30.48 
 
 
4342 aa  808    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.19 
 
 
5149 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  31.92 
 
 
2189 aa  758    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.11 
 
 
2448 aa  870    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  26.15 
 
 
3086 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.81 
 
 
4960 aa  914    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  34.87 
 
 
3293 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  32.6 
 
 
7785 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.01 
 
 
4317 aa  796    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.33 
 
 
6176 aa  729    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.12 
 
 
2385 aa  688    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.38 
 
 
2386 aa  734    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  41.44 
 
 
2200 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.69 
 
 
2156 aa  766    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  27.23 
 
 
2164 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  29.19 
 
 
6272 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  29.2 
 
 
6271 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  26.67 
 
 
2138 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.19 
 
 
3331 aa  769    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>