More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1029 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  36.3 
 
 
2619 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  41.09 
 
 
2706 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  44.9 
 
 
4268 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  37.17 
 
 
2230 aa  1311    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  41.84 
 
 
2035 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  46.33 
 
 
1174 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  43.65 
 
 
2057 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  47.37 
 
 
1414 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  31.44 
 
 
2345 aa  807    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  50.05 
 
 
1131 aa  796    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.59 
 
 
3021 aa  853    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 
1157 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  43.54 
 
 
2200 aa  688    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  40.55 
 
 
3875 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  50.58 
 
 
2174 aa  1598    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
2310 aa  4477    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  36.78 
 
 
1157 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  47.21 
 
 
1835 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.06 
 
 
3002 aa  870    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  50.89 
 
 
2350 aa  1667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  37.97 
 
 
3194 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.57 
 
 
3252 aa  1115    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  46.7 
 
 
1845 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  36.04 
 
 
1514 aa  710    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  40.79 
 
 
3293 aa  834    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 
3739 aa  756    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  45.15 
 
 
4165 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  45.3 
 
 
1167 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  45.64 
 
 
1167 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  44.49 
 
 
1734 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  48.94 
 
 
1678 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  49.78 
 
 
2258 aa  1610    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  47.98 
 
 
1163 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  42.83 
 
 
1113 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  28.76 
 
 
2338 aa  815    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  45.64 
 
 
1167 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  31.74 
 
 
2336 aa  823    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  39.6 
 
 
2896 aa  635  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  43.29 
 
 
1152 aa  635  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  43.65 
 
 
1149 aa  627  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  43.94 
 
 
2006 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  45.77 
 
 
1436 aa  619  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  44.58 
 
 
1469 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  38.19 
 
 
1862 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  46 
 
 
1837 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  45.78 
 
 
1438 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  30.98 
 
 
4383 aa  610  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  29.88 
 
 
1837 aa  598  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  42.01 
 
 
1321 aa  600  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  42.32 
 
 
1457 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  44.53 
 
 
1457 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.43 
 
 
1487 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  42.32 
 
 
1457 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.06 
 
 
9498 aa  595  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.99 
 
 
8646 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  33 
 
 
1497 aa  593  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  33.86 
 
 
3650 aa  591  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  45.09 
 
 
1463 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  36.05 
 
 
1193 aa  582  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.2 
 
 
6676 aa  583  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.16 
 
 
4747 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  30.55 
 
 
6403 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  44.22 
 
 
1501 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38.31 
 
 
1897 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  44.22 
 
 
1489 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.89 
 
 
2370 aa  573  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  29.43 
 
 
2448 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  27.84 
 
 
4502 aa  570  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  37.01 
 
 
1888 aa  569  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  34.22 
 
 
1042 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.31 
 
 
3432 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  26.17 
 
 
3308 aa  563  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  44.19 
 
 
1511 aa  563  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  42.44 
 
 
1894 aa  563  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  32.47 
 
 
2106 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  28.97 
 
 
13537 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.51 
 
 
5422 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  40.46 
 
 
1884 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.28 
 
 
6889 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  27.05 
 
 
7168 aa  556  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  30.36 
 
 
3331 aa  553  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  42.34 
 
 
1326 aa  552  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  25.87 
 
 
4960 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.91 
 
 
8914 aa  550  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  28.73 
 
 
2154 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.93 
 
 
5213 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  41.96 
 
 
2084 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  35.47 
 
 
1158 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  36.75 
 
 
1104 aa  546  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  41.96 
 
 
2090 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  28.22 
 
 
4332 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.27 
 
 
5738 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  41.96 
 
 
2023 aa  543  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  32.66 
 
 
5149 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  25.82 
 
 
2193 aa  539  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  25.94 
 
 
4960 aa  538  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.01 
 
 
3470 aa  536  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  25.89 
 
 
4968 aa  536  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  41.63 
 
 
1825 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  41.63 
 
 
1825 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>