More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0683 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  34.92 
 
 
4268 aa  897    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  36.14 
 
 
2057 aa  1096    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  33.09 
 
 
2336 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  32.84 
 
 
2345 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  35.73 
 
 
3739 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  34.96 
 
 
2230 aa  719    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  97.44 
 
 
3875 aa  6442    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  36.74 
 
 
3021 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  34.65 
 
 
1514 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  100 
 
 
3293 aa  6765    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  40.76 
 
 
2350 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  37.46 
 
 
3002 aa  725    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  41.74 
 
 
2310 aa  804    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  36.28 
 
 
3194 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  34.66 
 
 
3252 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.49 
 
 
4165 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  42.79 
 
 
2174 aa  853    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.4 
 
 
1113 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  39.53 
 
 
2258 aa  831    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  36.72 
 
 
2035 aa  1057    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  35.6 
 
 
2200 aa  1051    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  33.01 
 
 
2338 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  29.27 
 
 
1497 aa  636  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  39.07 
 
 
1734 aa  619  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  32.57 
 
 
1463 aa  618  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  35.62 
 
 
1131 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.1 
 
 
1436 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  38.38 
 
 
1835 aa  613  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.25 
 
 
1438 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  35.64 
 
 
1157 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 
2619 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  36.83 
 
 
2706 aa  604  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  32.31 
 
 
1489 aa  600  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  35.48 
 
 
1157 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  35 
 
 
2896 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  31.93 
 
 
1501 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38.45 
 
 
1897 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  38.96 
 
 
1457 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  38.96 
 
 
1457 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  35.38 
 
 
1174 aa  590  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  37.53 
 
 
1837 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  37.98 
 
 
1469 aa  582  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  36.95 
 
 
1888 aa  583  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  31.81 
 
 
2006 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  38.55 
 
 
1457 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  32.94 
 
 
1511 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 
1193 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.32 
 
 
1845 aa  577  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  36.21 
 
 
1678 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  29.4 
 
 
1862 aa  570  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  38.76 
 
 
1884 aa  570  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  38.96 
 
 
1321 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  30.72 
 
 
1809 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  31.13 
 
 
1809 aa  553  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  35.58 
 
 
1317 aa  550  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.79 
 
 
1487 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  34.25 
 
 
1104 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  34.34 
 
 
1158 aa  544  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  35.43 
 
 
1167 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  35.43 
 
 
1167 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  35.53 
 
 
1167 aa  533  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  35.6 
 
 
1149 aa  533  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 
1889 aa  523  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  33.76 
 
 
1414 aa  520  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  38.04 
 
 
1326 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  32.7 
 
 
1152 aa  513  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  35.84 
 
 
2084 aa  513  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  35.4 
 
 
1894 aa  512  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  35.84 
 
 
2023 aa  514  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  34.17 
 
 
1163 aa  507  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  35.61 
 
 
2090 aa  507  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  33.69 
 
 
1042 aa  499  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  33.3 
 
 
1084 aa  496  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  29.82 
 
 
1824 aa  493  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  30.34 
 
 
1825 aa  490  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  30.34 
 
 
1825 aa  490  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  30.1 
 
 
1825 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  30.66 
 
 
1837 aa  486  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  25.58 
 
 
3695 aa  410  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.06 
 
 
1699 aa  384  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.11 
 
 
5328 aa  377  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  28.47 
 
 
5149 aa  367  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  28.34 
 
 
3650 aa  365  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  27.8 
 
 
3291 aa  364  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  27.89 
 
 
3348 aa  360  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.86 
 
 
8646 aa  359  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  27.39 
 
 
4747 aa  357  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  24.35 
 
 
1922 aa  355  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  25.2 
 
 
4196 aa  355  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  28 
 
 
2154 aa  353  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.3 
 
 
2151 aa  352  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  26.42 
 
 
3086 aa  351  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  25.12 
 
 
3395 aa  351  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  26.69 
 
 
3498 aa  349  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  26.51 
 
 
3086 aa  349  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  26.96 
 
 
4572 aa  348  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.16 
 
 
6889 aa  348  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  27.73 
 
 
6081 aa  348  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  26.4 
 
 
6403 aa  347  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  27.6 
 
 
3470 aa  346  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>