More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1334 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  36.4 
 
 
4268 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  39.62 
 
 
2230 aa  800    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  41.99 
 
 
1104 aa  755    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  38.06 
 
 
1157 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
2896 aa  5915    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  44.01 
 
 
1835 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  38.96 
 
 
3021 aa  745    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  39.83 
 
 
2258 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  43.52 
 
 
1734 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  35.54 
 
 
1514 aa  732    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  39.3 
 
 
2619 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  39.75 
 
 
3739 aa  730    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  39.29 
 
 
3002 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  34.77 
 
 
3194 aa  828    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  37.06 
 
 
3252 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  38.06 
 
 
1157 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.59 
 
 
4165 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  38.96 
 
 
2350 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  39.06 
 
 
2706 aa  637  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  41.38 
 
 
2174 aa  630  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  38.49 
 
 
1321 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.37 
 
 
1113 aa  617  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  41.46 
 
 
1845 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  39.53 
 
 
2310 aa  613  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  35.44 
 
 
1158 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  34.92 
 
 
2338 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  34.7 
 
 
3875 aa  606  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  41.53 
 
 
1837 aa  603  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  34.83 
 
 
3293 aa  600  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  34.82 
 
 
2336 aa  600  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.06 
 
 
1487 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  41.3 
 
 
2084 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  41.3 
 
 
2023 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  34.63 
 
 
2345 aa  590  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  41.41 
 
 
2090 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  40.96 
 
 
1825 aa  587  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  40.96 
 
 
1825 aa  587  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  40.85 
 
 
1825 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  40.84 
 
 
1809 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  41.06 
 
 
1894 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  40.68 
 
 
1809 aa  584  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  36.87 
 
 
1862 aa  583  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  38.4 
 
 
1326 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  40.35 
 
 
1824 aa  580  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  39.4 
 
 
2006 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  36.96 
 
 
1131 aa  557  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  36.01 
 
 
1678 aa  543  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  36.95 
 
 
2200 aa  542  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  37.53 
 
 
1884 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  31.78 
 
 
1837 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  34.95 
 
 
1317 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  35.49 
 
 
2057 aa  529  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  35.85 
 
 
2035 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 
1193 aa  529  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  35.19 
 
 
1888 aa  523  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  35.35 
 
 
1897 aa  523  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  31.67 
 
 
1497 aa  511  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  34.79 
 
 
1174 aa  512  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  32.43 
 
 
1084 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  36.3 
 
 
1436 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  36.27 
 
 
1438 aa  493  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  35.53 
 
 
1457 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  35.53 
 
 
1457 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  36.27 
 
 
1457 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  35.89 
 
 
1469 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  33.58 
 
 
1889 aa  483  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  32.77 
 
 
1149 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 
1152 aa  471  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  36.63 
 
 
1489 aa  459  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  33.75 
 
 
1167 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  33.84 
 
 
1167 aa  461  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  36.63 
 
 
1501 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  32.07 
 
 
1042 aa  461  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  33.84 
 
 
1167 aa  461  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  34.04 
 
 
1414 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  36.63 
 
 
1511 aa  451  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  33.03 
 
 
1699 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  44.34 
 
 
1909 aa  450  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  36.51 
 
 
1463 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  37.07 
 
 
1163 aa  437  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  45.51 
 
 
1488 aa  425  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  48.59 
 
 
2380 aa  424  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  44.66 
 
 
1424 aa  421  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  47.16 
 
 
2257 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  45 
 
 
2498 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  43.07 
 
 
1653 aa  413  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 
1470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  44.42 
 
 
1466 aa  403  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  44.25 
 
 
1489 aa  400  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  47.48 
 
 
1911 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  44.79 
 
 
3335 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  43.94 
 
 
3163 aa  400  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  43.48 
 
 
2604 aa  396  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  31.92 
 
 
3173 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  24.95 
 
 
2508 aa  397  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  44.08 
 
 
3235 aa  397  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  49.3 
 
 
1302 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  43.19 
 
 
2710 aa  396  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  41.62 
 
 
4186 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 
1574 aa  394  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>