More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1608 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  37.69 
 
 		 4268 aa  814    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  42.69 
 
 		 2006 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35.21 
 
 		 3173 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  40.85 
 
 		 2174 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  40 
 
 		 1862 aa  673    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  34.27 
 
 		 2345 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  41.67 
 
 		 1825 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  37.87 
 
 		 2310 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  41.07 
 
 		 3021 aa  825    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 		 1424 aa  732    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  38.33 
 
 		 2258 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  38.71 
 
 		 1514 aa  844    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  38.73 
 
 		 2350 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  35.82 
 
 		 3163 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  43.08 
 
 		 1646 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  41.95 
 
 		 2230 aa  884    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  42.76 
 
 		 2084 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  41.33 
 
 		 3002 aa  844    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  100 
 
 		 3194 aa  6609    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.18 
 
 		 3252 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  42.24 
 
 		 1574 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  42.84 
 
 		 2023 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  42.89 
 
 		 1894 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  36.2 
 
 		 3293 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  40.33 
 
 		 1884 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.72 
 
 		 4165 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  40.97 
 
 		 2604 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  38.18 
 
 		 1104 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  35.19 
 
 		 1158 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  44.63 
 
 		 1835 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  41.1 
 
 		 1845 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1909 aa  722    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  44.51 
 
 		 3739 aa  854    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  42.23 
 
 		 1837 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  42.63 
 
 		 1809 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.01 
 
 		 1487 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 		 1653 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  34.27 
 
 		 2336 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  34.8 
 
 		 2896 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  41.6 
 
 		 1157 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  35.99 
 
 		 3875 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  42.34 
 
 		 2706 aa  781    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  43.5 
 
 		 1911 aa  651    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  39.34 
 
 		 2619 aa  750    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  43.43 
 
 		 1734 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  33.99 
 
 		 2338 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  42.52 
 
 		 2090 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  41.46 
 
 		 4646 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  41.79 
 
 		 1157 aa  829    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  43.58 
 
 		 2498 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  42.75 
 
 		 1809 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  41.51 
 
 		 1824 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  41.56 
 
 		 1825 aa  636  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  40.7 
 
 		 1582 aa  636  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  41.56 
 
 		 1825 aa  636  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  42.73 
 
 		 1466 aa  635  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  42.27 
 
 		 1520 aa  632  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 		 1408 aa  629  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  41.24 
 
 		 1302 aa  628  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 		 3089 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  40.95 
 
 		 3090 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  34.21 
 
 		 1131 aa  626  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.64 
 
 		 1113 aa  624  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  36.15 
 
 		 1317 aa  619  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  40.27 
 
 		 1795 aa  616  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38.45 
 
 		 1897 aa  615  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  37.8 
 
 		 1888 aa  615  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  36.12 
 
 		 1321 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.62 
 
 		 2462 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  40.09 
 
 		 3130 aa  612  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 		 2710 aa  613  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  40.07 
 
 		 2176 aa  613  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 		 3275 aa  612  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  37.79 
 
 		 2057 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  41.53 
 
 		 2684 aa  610  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 		 1193 aa  610  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  39.6 
 
 		 2150 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.47 
 
 		 1087 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  40.31 
 
 		 3108 aa  603  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 		 3093 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  34.4 
 
 		 1678 aa  598  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 		 2551 aa  599  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  38.18 
 
 		 1833 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 		 2762 aa  600  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  39.6 
 
 		 4186 aa  597  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 4647 aa  597  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  37.5 
 
 		 1457 aa  597  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 		 1354 aa  597  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  37.5 
 
 		 1457 aa  597  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  34.38 
 
 		 1174 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  40.55 
 
 		 1535 aa  596  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  36.79 
 
 		 1612 aa  591  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  36.9 
 
 		 1612 aa  592  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  41.2 
 
 		 3335 aa  592  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  40.25 
 
 		 2454 aa  590  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 		 1587 aa  590  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  38.69 
 
 		 1489 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  38.93 
 
 		 2093 aa  589  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 		 1470 aa  590  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  36.76 
 
 		 2200 aa  589  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>