More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5942 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  48.58 
 
 
1163 aa  822    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  40.58 
 
 
2057 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  47.08 
 
 
2174 aa  892    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1678 aa  3262    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  44.71 
 
 
2258 aa  808    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  49.08 
 
 
2310 aa  735    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  46.49 
 
 
1167 aa  879    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  38.35 
 
 
2230 aa  790    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  45.7 
 
 
1152 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  47.89 
 
 
2350 aa  884    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  39.62 
 
 
2035 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  46.57 
 
 
1167 aa  883    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  48.18 
 
 
1414 aa  925    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  35.35 
 
 
1193 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  53.49 
 
 
1131 aa  1091    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.61 
 
 
1113 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  46.57 
 
 
1167 aa  883    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  46.24 
 
 
1149 aa  869    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  41.65 
 
 
2200 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  49.31 
 
 
1174 aa  991    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  40.87 
 
 
1469 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  41.28 
 
 
1457 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  41.28 
 
 
1457 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  41.99 
 
 
1436 aa  619  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  42.86 
 
 
1438 aa  620  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  41.49 
 
 
1457 aa  616  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  41.89 
 
 
1489 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  35.79 
 
 
3194 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  43.14 
 
 
1734 aa  612  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  41.41 
 
 
1501 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  42.01 
 
 
1463 aa  606  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  40.39 
 
 
4165 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  41.02 
 
 
1511 aa  599  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  32.87 
 
 
1497 aa  596  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  33 
 
 
1157 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 
1157 aa  580  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  39.72 
 
 
2706 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  34.58 
 
 
3252 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  36.31 
 
 
1104 aa  572  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  31.23 
 
 
1514 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  33.81 
 
 
3293 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  36.18 
 
 
1862 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.19 
 
 
1487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  40.18 
 
 
4268 aa  562  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  33.69 
 
 
3875 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.67 
 
 
3002 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  36.32 
 
 
2896 aa  556  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  41.9 
 
 
1835 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  35.14 
 
 
3021 aa  552  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  40.61 
 
 
2006 aa  546  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  37.62 
 
 
2619 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  39.44 
 
 
1884 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  37.93 
 
 
1888 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 
1897 aa  543  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  42.81 
 
 
1845 aa  539  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  34.59 
 
 
3739 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  33.86 
 
 
1158 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  29.59 
 
 
2338 aa  532  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  40.56 
 
 
2084 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  29.67 
 
 
2336 aa  533  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  40.35 
 
 
2023 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  29.33 
 
 
2345 aa  526  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  41.67 
 
 
1837 aa  526  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  40.22 
 
 
2090 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  37.26 
 
 
1321 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  40.17 
 
 
1894 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  32.3 
 
 
1042 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  34.42 
 
 
1889 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  39.83 
 
 
1809 aa  506  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  30.76 
 
 
1837 aa  502  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  36.69 
 
 
1317 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 
1084 aa  499  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  39.19 
 
 
1809 aa  497  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  38.89 
 
 
1825 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  38.01 
 
 
1824 aa  489  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  38.87 
 
 
1825 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  38.87 
 
 
1825 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  37.23 
 
 
1326 aa  483  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.7 
 
 
1699 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  27.78 
 
 
3291 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  28.03 
 
 
3308 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.01 
 
 
3235 aa  366  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  27.3 
 
 
1093 aa  362  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  33.29 
 
 
1405 aa  359  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  25.84 
 
 
3498 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.02 
 
 
4531 aa  359  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  29.05 
 
 
4747 aa  358  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  26.53 
 
 
4968 aa  357  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  47.22 
 
 
994 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
973 aa  355  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.73 
 
 
3470 aa  354  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  29.68 
 
 
4336 aa  354  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.21 
 
 
7168 aa  352  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.51 
 
 
6676 aa  349  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  32.78 
 
 
2454 aa  347  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.08 
 
 
2581 aa  347  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  25.7 
 
 
4960 aa  346  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  29.79 
 
 
4332 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.69 
 
 
6072 aa  345  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  27.62 
 
 
4502 aa  345  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>