More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3965 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  29.07 
 
 
1888 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  31.37 
 
 
4268 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  30.01 
 
 
2006 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1889 aa  3923    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  29.88 
 
 
1809 aa  818    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  29.27 
 
 
1824 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  32.92 
 
 
1734 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  33.19 
 
 
1845 aa  1020    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  32.15 
 
 
1884 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  30.79 
 
 
4165 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  29.53 
 
 
1825 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  29.36 
 
 
1825 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  30 
 
 
1809 aa  815    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  34.25 
 
 
1837 aa  985    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.35 
 
 
1487 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 
1825 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  40.45 
 
 
1862 aa  1464    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  34.16 
 
 
1835 aa  1075    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.39 
 
 
2023 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  33.45 
 
 
2084 aa  612  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.1 
 
 
2090 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  33.74 
 
 
1894 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  36.82 
 
 
2230 aa  592  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  35.05 
 
 
3739 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  34.58 
 
 
1514 aa  581  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  29.37 
 
 
2035 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.84 
 
 
3002 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  35.86 
 
 
3021 aa  573  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.32 
 
 
3252 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  36.53 
 
 
1104 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  35.33 
 
 
2350 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  34.09 
 
 
1157 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  29.51 
 
 
2200 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  36.61 
 
 
2706 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  35.15 
 
 
3194 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  28.97 
 
 
2057 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  34.79 
 
 
2336 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  34.9 
 
 
2338 aa  532  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  32.53 
 
 
1897 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  34.58 
 
 
2345 aa  529  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  34.3 
 
 
1321 aa  512  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  28.37 
 
 
3875 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  28.2 
 
 
3293 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  27.06 
 
 
1497 aa  499  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  34.33 
 
 
1131 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  34.11 
 
 
1678 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  33.37 
 
 
2258 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  33.88 
 
 
1326 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.16 
 
 
1113 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  33.97 
 
 
2896 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  32.68 
 
 
2174 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  32.91 
 
 
2310 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  29.88 
 
 
1084 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  33.19 
 
 
1193 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  32.02 
 
 
1837 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  31.22 
 
 
1158 aa  439  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  31.02 
 
 
1174 aa  435  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  31.32 
 
 
1317 aa  435  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  31.94 
 
 
1469 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  31.89 
 
 
1436 aa  417  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  31.82 
 
 
1438 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  30.98 
 
 
1457 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  31.39 
 
 
1489 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  31.24 
 
 
1457 aa  406  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  31.24 
 
 
1457 aa  406  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  31.39 
 
 
1501 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  31.39 
 
 
1511 aa  393  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  30.27 
 
 
1167 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  30.35 
 
 
1167 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  30.35 
 
 
1167 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  30.47 
 
 
1463 aa  380  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  28.45 
 
 
1042 aa  377  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  30.27 
 
 
1414 aa  370  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  29.66 
 
 
1149 aa  365  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  28 
 
 
1152 aa  355  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  28.93 
 
 
1699 aa  350  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  29.94 
 
 
2454 aa  337  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  32.61 
 
 
1157 aa  319  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  33.05 
 
 
2619 aa  284  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09690  Non-ribosomal peptide synthetase, with condensation, AMP binding and thioesterase modules  27.34 
 
 
1388 aa  276  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1801  nonribosomal peptide synthetase VibF  25.08 
 
 
2417 aa  273  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  25.55 
 
 
1574 aa  263  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  34.19 
 
 
1567 aa  262  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  33.99 
 
 
1567 aa  261  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  33.99 
 
 
1567 aa  261  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  25.87 
 
 
2883 aa  256  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  24.28 
 
 
2193 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  24.92 
 
 
1405 aa  255  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  24.97 
 
 
4332 aa  254  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  24.53 
 
 
4336 aa  253  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  23.28 
 
 
3308 aa  252  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1766  condensation domain protein  30.52 
 
 
921 aa  252  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  24.86 
 
 
2151 aa  251  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  25.24 
 
 
4336 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  25.55 
 
 
1369 aa  251  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  24.82 
 
 
2164 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  25.4 
 
 
4968 aa  249  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  25.95 
 
 
4136 aa  246  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  25.79 
 
 
4502 aa  246  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  26.01 
 
 
3470 aa  245  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>