More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2806 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  37.81 
 
 
2230 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1317 aa  2595    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  42.26 
 
 
2350 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  35.85 
 
 
3194 aa  628  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  43.75 
 
 
1734 aa  610  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  38.76 
 
 
3739 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  41.67 
 
 
2258 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  37.88 
 
 
3002 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.17 
 
 
3252 aa  596  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  38.2 
 
 
3021 aa  589  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  35.05 
 
 
1157 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  34.74 
 
 
1157 aa  589  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  43.24 
 
 
1835 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  39.5 
 
 
2619 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 
1514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  40.84 
 
 
2706 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  35.56 
 
 
3293 aa  552  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  33.49 
 
 
2345 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  35.47 
 
 
3875 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  39.21 
 
 
1884 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.2 
 
 
1487 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  33.3 
 
 
2336 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  35.47 
 
 
1862 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  33.2 
 
 
2338 aa  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  42.52 
 
 
1845 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  40.08 
 
 
4268 aa  539  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  38.69 
 
 
1174 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  35.79 
 
 
1104 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  41.56 
 
 
2174 aa  536  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  35.12 
 
 
2896 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  35.46 
 
 
1158 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  37.32 
 
 
1131 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  39.5 
 
 
2310 aa  523  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  39.43 
 
 
2006 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  39.37 
 
 
2200 aa  520  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  37.72 
 
 
2057 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  40.9 
 
 
1837 aa  513  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  35.21 
 
 
1414 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  38.77 
 
 
2035 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.63 
 
 
1113 aa  506  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  34.21 
 
 
1193 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  35.43 
 
 
1084 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  39.59 
 
 
4165 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  36.98 
 
 
1149 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  32.89 
 
 
1837 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 
1678 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  35 
 
 
1152 aa  489  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  38.52 
 
 
1321 aa  486  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  36.87 
 
 
1167 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  36.87 
 
 
1167 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  36.68 
 
 
1167 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  39.32 
 
 
1326 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  32.08 
 
 
1042 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  38.77 
 
 
1894 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  34.54 
 
 
1897 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  36.56 
 
 
2023 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  37.5 
 
 
1163 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  37.83 
 
 
1825 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  39.19 
 
 
1489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  34.11 
 
 
1888 aa  449  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  36.57 
 
 
2084 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  39.19 
 
 
1501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  32.14 
 
 
1497 aa  445  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  37.79 
 
 
1469 aa  446  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  38.12 
 
 
1825 aa  445  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  38.12 
 
 
1825 aa  445  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  36.43 
 
 
2090 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  31.32 
 
 
1889 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  38.96 
 
 
1463 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  38.56 
 
 
1457 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  38.56 
 
 
1457 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  39.19 
 
 
1511 aa  439  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  37.2 
 
 
1809 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  38.54 
 
 
1457 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  38.19 
 
 
1824 aa  436  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  37.34 
 
 
1809 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.28 
 
 
1436 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.59 
 
 
1438 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  31.37 
 
 
6661 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  32.27 
 
 
1405 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.03 
 
 
1699 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  43.4 
 
 
1567 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  43.4 
 
 
1567 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  33.89 
 
 
1336 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.26 
 
 
6676 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  33.33 
 
 
888 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  43.24 
 
 
1567 aa  390  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  34.68 
 
 
1574 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.41 
 
 
7712 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  37.89 
 
 
1314 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.39 
 
 
3432 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.23 
 
 
4531 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.14 
 
 
3308 aa  376  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.76 
 
 
3176 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.13 
 
 
2385 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
3291 aa  373  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  32.9 
 
 
2454 aa  370  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.38 
 
 
1363 aa  370  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  30.82 
 
 
1334 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.8 
 
 
2385 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>