More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1883 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.01 
 
 
3470 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  34.76 
 
 
2883 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1314 aa  2664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  34.87 
 
 
3086 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  38.88 
 
 
1990 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  37.8 
 
 
2878 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  35.47 
 
 
4960 aa  750    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  34.62 
 
 
2156 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  36.81 
 
 
1069 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  36.6 
 
 
1870 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  35.42 
 
 
4960 aa  749    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  34.81 
 
 
2156 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  32.29 
 
 
1436 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  36.6 
 
 
1870 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  34.97 
 
 
3086 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  37.68 
 
 
1454 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 
2151 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  36.45 
 
 
4968 aa  768    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  34.53 
 
 
2156 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.94 
 
 
4747 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  36.52 
 
 
4991 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  38.83 
 
 
3942 aa  629  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  38.65 
 
 
4136 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  37.37 
 
 
5213 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  32.05 
 
 
1345 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.63 
 
 
6403 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  30.75 
 
 
1331 aa  618  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  35.1 
 
 
2571 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  32.8 
 
 
4080 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  35.1 
 
 
2571 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.32 
 
 
2883 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  35.29 
 
 
1786 aa  608  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  38.45 
 
 
5149 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  38.62 
 
 
5467 aa  601  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  37.83 
 
 
5654 aa  602  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  34.47 
 
 
2875 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  36.2 
 
 
1315 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  37.84 
 
 
7712 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  36.71 
 
 
2606 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  34.37 
 
 
1078 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  33.18 
 
 
1556 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  33.18 
 
 
1556 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.6 
 
 
5230 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  36.51 
 
 
4037 aa  589  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.78 
 
 
6661 aa  585  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.59 
 
 
4531 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.04 
 
 
6676 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  36.04 
 
 
2596 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.9 
 
 
4502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  36.94 
 
 
3018 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.3 
 
 
3498 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  37.37 
 
 
2626 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  39.37 
 
 
2614 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.63 
 
 
3291 aa  571  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  31.5 
 
 
1336 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.59 
 
 
2561 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  36.43 
 
 
3962 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.5 
 
 
2370 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.13 
 
 
2164 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.9 
 
 
5328 aa  563  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.61 
 
 
4318 aa  559  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  35.83 
 
 
2625 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.73 
 
 
4342 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.05 
 
 
6176 aa  555  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.51 
 
 
4342 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  35.56 
 
 
3018 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  34.52 
 
 
3328 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.37 
 
 
2666 aa  552  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  33.05 
 
 
6202 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  35.61 
 
 
9175 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.6 
 
 
6006 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  36.82 
 
 
2651 aa  553  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  34.52 
 
 
3352 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.76 
 
 
5953 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.79 
 
 
7541 aa  549  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  35.51 
 
 
13537 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  35.93 
 
 
1344 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  35.34 
 
 
2448 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.44 
 
 
6081 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  37.06 
 
 
2365 aa  544  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.71 
 
 
2033 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  34.44 
 
 
6072 aa  546  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  34.96 
 
 
1661 aa  546  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.99 
 
 
1833 aa  545  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  34.55 
 
 
2845 aa  546  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.35 
 
 
2385 aa  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.58 
 
 
3432 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.35 
 
 
2385 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  36.26 
 
 
888 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  33.75 
 
 
1405 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.8 
 
 
4332 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.99 
 
 
2385 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 
2386 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.35 
 
 
2385 aa  540  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  33.45 
 
 
1383 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.2 
 
 
2385 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  36.08 
 
 
3224 aa  536  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  33.07 
 
 
5929 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.9 
 
 
1839 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.99 
 
 
3308 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>