More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3342 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.27 
 
 
2385 aa  789    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.64 
 
 
2385 aa  794    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.73 
 
 
2385 aa  800    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.54 
 
 
2385 aa  795    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  39.64 
 
 
2385 aa  795    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  39.96 
 
 
2385 aa  804    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.37 
 
 
2385 aa  791    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  41.15 
 
 
3710 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.54 
 
 
2385 aa  797    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  39.29 
 
 
2386 aa  800    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  34.53 
 
 
1317 aa  756    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.54 
 
 
2385 aa  795    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  43.63 
 
 
1336 aa  1140    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  100 
 
 
1334 aa  2724    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  38.11 
 
 
1296 aa  656    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  38.13 
 
 
1304 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  44.65 
 
 
1498 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  43.45 
 
 
1449 aa  778    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  40.67 
 
 
2386 aa  824    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  34.76 
 
 
1310 aa  634  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  34.49 
 
 
1325 aa  622  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  36.83 
 
 
1082 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.74 
 
 
1082 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  32.72 
 
 
1419 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.84 
 
 
1082 aa  612  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.74 
 
 
1071 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.74 
 
 
1082 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  36.65 
 
 
1082 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.74 
 
 
1082 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  38.51 
 
 
4090 aa  599  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.52 
 
 
6403 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.63 
 
 
4489 aa  586  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.43 
 
 
9498 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.89 
 
 
2365 aa  582  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 
5596 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 
3235 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.83 
 
 
7310 aa  579  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  36.63 
 
 
2561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  32.07 
 
 
1336 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  33.31 
 
 
1290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  32.96 
 
 
1315 aa  572  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  32.97 
 
 
1294 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  32.97 
 
 
1293 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 
3291 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  32.77 
 
 
1294 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  32.91 
 
 
1293 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.21 
 
 
6676 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  32.77 
 
 
1294 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  32.85 
 
 
1294 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  34.47 
 
 
8211 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.7 
 
 
5953 aa  563  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  32.91 
 
 
1293 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  32.91 
 
 
1293 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  32.91 
 
 
1293 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.34 
 
 
4531 aa  559  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  37.73 
 
 
6999 aa  558  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  41.38 
 
 
888 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  33.14 
 
 
1293 aa  559  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  32.91 
 
 
1293 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  32.68 
 
 
1294 aa  559  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  32.72 
 
 
1293 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.71 
 
 
2581 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.06 
 
 
6889 aa  555  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  32.62 
 
 
1282 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.74 
 
 
5750 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  32.83 
 
 
1293 aa  552  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  33.79 
 
 
1344 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  34.14 
 
 
1483 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.26 
 
 
3308 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  32.37 
 
 
1481 aa  549  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  34.14 
 
 
1528 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  34.14 
 
 
1520 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  34.14 
 
 
1483 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  36.22 
 
 
2691 aa  545  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.09 
 
 
2370 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.14 
 
 
3291 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.33 
 
 
6006 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.62 
 
 
5372 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.56 
 
 
1870 aa  542  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.85 
 
 
1870 aa  543  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.05 
 
 
3348 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  30.3 
 
 
1331 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 
1550 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  31.66 
 
 
1142 aa  529  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.7 
 
 
2033 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  33.03 
 
 
2877 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  35.39 
 
 
4520 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.03 
 
 
6661 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  31.04 
 
 
6113 aa  526  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.84 
 
 
1769 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  32.86 
 
 
1518 aa  526  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.82 
 
 
4968 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  32.76 
 
 
1518 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.09 
 
 
1839 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  33.25 
 
 
2875 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  30.68 
 
 
2274 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.36 
 
 
4960 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32 
 
 
3498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  43.12 
 
 
8914 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  36.15 
 
 
4747 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>