More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1811 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  44.59 
 
 		 2258 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  42.05 
 
 		 4268 aa  814    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  100 
 
 		 2006 aa  3963    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  38.06 
 
 		 1514 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  45.03 
 
 		 2706 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  40.09 
 
 		 1157 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  35.87 
 
 		 2057 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  43.6 
 
 		 3021 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  41.44 
 
 		 3739 aa  744    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  40.76 
 
 		 2230 aa  711    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 1862 aa  846    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  29.95 
 
 		 1889 aa  718    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  41.19 
 
 		 1835 aa  966    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  44.77 
 
 		 1837 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  35.68 
 
 		 2035 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  37.03 
 
 		 1825 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  44.48 
 
 		 3002 aa  705    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  34.04 
 
 		 1888 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  36.22 
 
 		 1824 aa  737    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  42.69 
 
 		 3194 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  41.72 
 
 		 3252 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  43.22 
 
 		 2619 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.15 
 
 		 1845 aa  852    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  44.56 
 
 		 1884 aa  1281    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  41.01 
 
 		 4165 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  37.01 
 
 		 1825 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  40.7 
 
 		 1157 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  35.6 
 
 		 1809 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  46.45 
 
 		 2350 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  42.86 
 
 		 1113 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  37.33 
 
 		 1734 aa  829    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 		 1825 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  40.48 
 
 		 2200 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  35.5 
 
 		 1809 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  43.69 
 
 		 2310 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  27.77 
 
 		 1497 aa  624  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  45.7 
 
 		 2174 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  42.39 
 
 		 1894 aa  622  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  41.16 
 
 		 2084 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  41.13 
 
 		 2023 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  40.96 
 
 		 2090 aa  606  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  41.86 
 
 		 1174 aa  602  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  39.58 
 
 		 1104 aa  603  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38.97 
 
 		 1897 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  40.83 
 
 		 1131 aa  588  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  42.4 
 
 		 1438 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  39.5 
 
 		 2896 aa  582  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  41.81 
 
 		 1469 aa  583  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  34.15 
 
 		 2338 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  42.08 
 
 		 1436 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  41.27 
 
 		 1321 aa  579  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  42.31 
 
 		 1457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  42.31 
 
 		 1457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  34.04 
 
 		 2336 aa  577  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.86 
 
 		 1487 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  33.83 
 
 		 2345 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  42.1 
 
 		 1457 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  42.59 
 
 		 1463 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  40.49 
 
 		 1678 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  38.14 
 
 		 3875 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  37.82 
 
 		 3293 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  40.78 
 
 		 1414 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  40.7 
 
 		 1326 aa  539  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  37.89 
 
 		 1158 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  36.38 
 
 		 1193 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  39.45 
 
 		 1317 aa  532  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  40.19 
 
 		 1167 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  40.19 
 
 		 1167 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  39.98 
 
 		 1167 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  37.16 
 
 		 1152 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  34.78 
 
 		 1837 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  37.74 
 
 		 1149 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  40.02 
 
 		 1163 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1042 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 		 1084 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  36.92 
 
 		 1699 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  34.06 
 
 		 2454 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  45.75 
 
 		 3275 aa  344  8e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  43.78 
 
 		 3173 aa  338  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  37.73 
 
 		 2243 aa  322  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  31.09 
 
 		 1405 aa  318  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  40.44 
 
 		 3163 aa  317  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  38.93 
 
 		 2226 aa  308  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  28.92 
 
 		 3308 aa  294  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  40.24 
 
 		 1574 aa  290  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  39.39 
 
 		 1567 aa  290  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  39.39 
 
 		 1567 aa  290  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  39.2 
 
 		 1567 aa  289  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  41.79 
 
 		 3650 aa  271  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  26.59 
 
 		 2006 aa  270  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.78 
 
 		 4991 aa  269  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  24.43 
 
 		 1556 aa  267  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.43 
 
 		 3404 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.9 
 
 		 4502 aa  266  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  23.69 
 
 		 3695 aa  265  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09690  Non-ribosomal peptide synthetase, with condensation, AMP binding and thioesterase modules  30.39 
 
 		 1388 aa  264  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  25.14 
 
 		 3086 aa  263  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  24.89 
 
 		 1556 aa  263  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.07 
 
 		 3235 aa  262  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  24.87 
 
 		 3086 aa  262  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>