More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1806 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  100 
 
 		 4268 aa  8442    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  41.68 
 
 		 2006 aa  832    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.76 
 
 		 6889 aa  869    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  38.26 
 
 		 2057 aa  1126    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  42.25 
 
 		 1157 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.12 
 
 		 1337 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  44.63 
 
 		 3021 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 2551 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 		 1874 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 		 1656 aa  1075    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  44.77 
 
 		 1587 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.19 
 
 		 3427 aa  709    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  44.42 
 
 		 3002 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  28.49 
 
 		 1497 aa  643    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  36.77 
 
 		 1824 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  37.53 
 
 		 3194 aa  806    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  42.37 
 
 		 3252 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  38.65 
 
 		 1837 aa  803    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 		 2880 aa  758    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  42.09 
 
 		 1157 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  40.4 
 
 		 1884 aa  897    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  47.8 
 
 		 4165 aa  3384    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.37 
 
 		 3718 aa  721    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  45.95 
 
 		 2619 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  36.7 
 
 		 1825 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.16 
 
 		 3693 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  34.88 
 
 		 3293 aa  925    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 		 1825 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  44.72 
 
 		 2706 aa  739    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  39.22 
 
 		 1514 aa  775    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  43.4 
 
 		 2258 aa  656    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  40.63 
 
 		 3739 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.27 
 
 		 4478 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.91 
 
 		 1474 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 		 1889 aa  733    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.68 
 
 		 1845 aa  758    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  45.65 
 
 		 2350 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  36.7 
 
 		 1825 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.49 
 
 		 1862 aa  796    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  38.59 
 
 		 2035 aa  1155    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.16 
 
 		 3693 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 1559 aa  772    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  34.6 
 
 		 3875 aa  911    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  42.61 
 
 		 1131 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 		 3676 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 		 3696 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  42.46 
 
 		 2230 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 		 2243 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  36.4 
 
 		 2896 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  39.61 
 
 		 1835 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  38.72 
 
 		 2200 aa  1115    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.92 
 
 		 1559 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  40.25 
 
 		 1734 aa  872    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.16 
 
 		 3702 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  45.22 
 
 		 2310 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  40.61 
 
 		 2103 aa  793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  34.3 
 
 		 1888 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  48.21 
 
 		 2174 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.64 
 
 		 3679 aa  735    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 2762 aa  1189    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.9 
 
 		 3337 aa  636  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 		 1581 aa  636  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  35.78 
 
 		 1809 aa  636  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.32 
 
 		 1087 aa  633  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 		 1354 aa  633  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 		 2985 aa  630  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 		 1580 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  35.75 
 
 		 1809 aa  626  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 		 1548 aa  627  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 		 1580 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.72 
 
 		 3099 aa  626  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.71 
 
 		 1349 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 7279 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.71 
 
 		 1349 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  39.77 
 
 		 1897 aa  623  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  33.31 
 
 		 1577 aa  622  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  33.29 
 
 		 4101 aa  620  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  35.6 
 
 		 1955 aa  620  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 2081 aa  616  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 3176 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.01 
 
 		 3130 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  41.14 
 
 		 1894 aa  613  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 2374 aa  613  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.23 
 
 		 1113 aa  613  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  33.48 
 
 		 1580 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  41.38 
 
 		 2084 aa  610  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  41.38 
 
 		 2023 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 		 1520 aa  607  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.84 
 
 		 2376 aa  607  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 		 1520 aa  607  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  35.33 
 
 		 3033 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  35.14 
 
 		 2336 aa  603  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  34.84 
 
 		 2338 aa  599  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  40.97 
 
 		 2090 aa  600  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  35.04 
 
 		 2345 aa  598  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.12 
 
 		 2890 aa  596  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 		 2230 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  40.71 
 
 		 1321 aa  593  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.97 
 
 		 2551 aa  593  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.8 
 
 		 950 aa  591  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>