More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1874 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 
7210 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  33.98 
 
 
4268 aa  1113    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.12 
 
 
6889 aa  1191    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  32.33 
 
 
3089 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.12 
 
 
4080 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  50.33 
 
 
1349 aa  885    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.85 
 
 
1372 aa  767    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  55.18 
 
 
1087 aa  1015    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 
5154 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  28.48 
 
 
2316 aa  688    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  46.85 
 
 
1559 aa  1264    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  32.37 
 
 
2024 aa  768    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  50.96 
 
 
2791 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  33.97 
 
 
1653 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  33.35 
 
 
3108 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
2551 aa  1044    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 
1874 aa  955    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  55.04 
 
 
1656 aa  1765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.45 
 
 
1144 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  53.36 
 
 
1587 aa  952    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  33.38 
 
 
1833 aa  648    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.07 
 
 
2376 aa  720    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  32.4 
 
 
4101 aa  759    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  40 
 
 
1804 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.38 
 
 
2890 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.01 
 
 
3092 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  43.63 
 
 
3252 aa  782    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 
1574 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  47.66 
 
 
3099 aa  829    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  31.92 
 
 
2081 aa  797    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 
3176 aa  844    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 
7110 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  33.32 
 
 
4165 aa  1137    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  49.18 
 
 
2462 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  33.96 
 
 
3718 aa  823    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  29.73 
 
 
4647 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.69 
 
 
1955 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
3693 aa  969    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  32.76 
 
 
3033 aa  683    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  32.53 
 
 
1582 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.16 
 
 
2230 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  56.66 
 
 
1337 aa  995    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  49.78 
 
 
2103 aa  1252    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  41.07 
 
 
2047 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.31 
 
 
7279 aa  764    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  51.07 
 
 
614 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  52.01 
 
 
991 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35.21 
 
 
1795 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 
2551 aa  892    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  48.1 
 
 
1909 aa  817    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  49.45 
 
 
1354 aa  901    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 
2985 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.44 
 
 
1349 aa  888    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  39.01 
 
 
3254 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
1816 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.43 
 
 
4478 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  45.6 
 
 
1474 aa  1152    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.92 
 
 
1559 aa  1272    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  46.65 
 
 
3337 aa  865    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
5400 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
3693 aa  969    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.32 
 
 
2604 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  32.66 
 
 
4646 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  41.29 
 
 
1939 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  53 
 
 
725 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  31.37 
 
 
1612 aa  698    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.27 
 
 
3099 aa  995    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.72 
 
 
3676 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.15 
 
 
2477 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.11 
 
 
3696 aa  794    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  51.54 
 
 
2997 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  31.27 
 
 
1612 aa  696    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  53.16 
 
 
725 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  32.09 
 
 
1581 aa  731    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  31.73 
 
 
1520 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  31.78 
 
 
3158 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.59 
 
 
3427 aa  990    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  55.35 
 
 
866 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
3130 aa  843    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 
3093 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.11 
 
 
4151 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  44.42 
 
 
3424 aa  752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.9 
 
 
2232 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2762 aa  5687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  34.72 
 
 
2727 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 
3702 aa  969    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  45.63 
 
 
3645 aa  759    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  42.07 
 
 
2333 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  38.06 
 
 
3045 aa  705    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  43.6 
 
 
1208 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.31 
 
 
2880 aa  946    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 
3090 aa  690    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.32 
 
 
950 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  31.35 
 
 
1537 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.87 
 
 
3679 aa  900    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  39.16 
 
 
1402 aa  690    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 
1548 aa  802    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.61 
 
 
2374 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 
1577 aa  738    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  30.42 
 
 
2176 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>