More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3282 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.36 
 
 
1402 aa  755    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  51.51 
 
 
3033 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  52.17 
 
 
3711 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  42.68 
 
 
4264 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  85.26 
 
 
2376 aa  3958    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  50 
 
 
1584 aa  751    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.83 
 
 
2966 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  46.28 
 
 
1114 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  49.16 
 
 
2108 aa  750    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  45.39 
 
 
2719 aa  744    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  50.81 
 
 
2066 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  54.17 
 
 
2367 aa  836    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  48.11 
 
 
5255 aa  797    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  53.61 
 
 
7210 aa  980    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  54.72 
 
 
4080 aa  957    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  46.34 
 
 
2277 aa  788    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.99 
 
 
1349 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.75 
 
 
7110 aa  947    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
2551 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.84 
 
 
1874 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.3 
 
 
1656 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.35 
 
 
1126 aa  847    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 
1587 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.84 
 
 
1337 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.58 
 
 
5154 aa  1338    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.1 
 
 
1101 aa  974    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  53.51 
 
 
3148 aa  835    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.65 
 
 
3254 aa  990    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  53.28 
 
 
4840 aa  909    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  37.09 
 
 
3252 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  51.98 
 
 
1955 aa  855    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.88 
 
 
3508 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  41.17 
 
 
3645 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.77 
 
 
3463 aa  887    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  50.18 
 
 
2081 aa  873    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.33 
 
 
1559 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.1 
 
 
4165 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
3092 aa  962    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47.55 
 
 
3930 aa  821    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  100 
 
 
2374 aa  4737    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.49 
 
 
2880 aa  671    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  43.32 
 
 
3693 aa  722    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
5400 aa  970    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.01 
 
 
4607 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.4 
 
 
2846 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  49.1 
 
 
1601 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.59 
 
 
1867 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  54.67 
 
 
2060 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  49.55 
 
 
1593 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  50.1 
 
 
4882 aa  881    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.77 
 
 
2090 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
1354 aa  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  56.92 
 
 
2113 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  41.44 
 
 
3427 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.67 
 
 
2020 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  43.95 
 
 
1143 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.26 
 
 
4478 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  53.79 
 
 
1548 aa  854    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.63 
 
 
1924 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.54 
 
 
2126 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  43.32 
 
 
3693 aa  722    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.6 
 
 
3408 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  51.75 
 
 
3670 aa  876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.21 
 
 
1820 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
1816 aa  883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.65 
 
 
1087 aa  751    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  41.22 
 
 
1349 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.8 
 
 
3676 aa  716    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.2 
 
 
2477 aa  663    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.15 
 
 
3696 aa  685    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.11 
 
 
1559 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  44.79 
 
 
3400 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  50.45 
 
 
6768 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
1837 aa  814    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  51.4 
 
 
2107 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  39.92 
 
 
1017 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.89 
 
 
4151 aa  914    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  48.42 
 
 
1831 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.56 
 
 
3158 aa  906    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.21 
 
 
4930 aa  757    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  50.84 
 
 
1789 aa  760    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  47.66 
 
 
3449 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  46.91 
 
 
3493 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.52 
 
 
2078 aa  726    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  55.35 
 
 
3494 aa  846    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  44.19 
 
 
3702 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  55.02 
 
 
7279 aa  927    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.82 
 
 
2847 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.71 
 
 
2762 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  45.7 
 
 
3281 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 
4111 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.96 
 
 
1071 aa  871    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.76 
 
 
1305 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  51.51 
 
 
4575 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 
3679 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  56.31 
 
 
1602 aa  877    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  47.84 
 
 
2024 aa  792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.62 
 
 
3176 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
3874 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  49.94 
 
 
3355 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>