More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3152 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  45.55 
 
 		 1584 aa  1091    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  55.31 
 
 		 3711 aa  923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.23 
 
 		 3355 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  45.37 
 
 		 1601 aa  1083    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  55.6 
 
 		 7210 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  56.15 
 
 		 3463 aa  914    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  52.28 
 
 		 2376 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.3 
 
 		 1372 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.07 
 
 		 1816 aa  923    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 		 7110 aa  934    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  45.2 
 
 		 2719 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  48.02 
 
 		 2066 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  53.74 
 
 		 2374 aa  847    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  47.17 
 
 		 1402 aa  718    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  46.13 
 
 		 3493 aa  1064    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  54.08 
 
 		 3148 aa  832    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 2762 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 2551 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 1874 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  44.43 
 
 		 1656 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.89 
 
 		 1559 aa  897    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.51 
 
 		 1587 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  55.27 
 
 		 3494 aa  870    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  52.56 
 
 		 4882 aa  838    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  50.85 
 
 		 3158 aa  1264    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  48.92 
 
 		 2277 aa  787    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  45.3 
 
 		 5154 aa  1039    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  56.05 
 
 		 2113 aa  901    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  46.07 
 
 		 3449 aa  725    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.8 
 
 		 3930 aa  726    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  45.38 
 
 		 2024 aa  1072    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.4 
 
 		 1924 aa  704    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.6 
 
 		 3033 aa  1166    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.47 
 
 		 2126 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  47.03 
 
 		 2081 aa  1171    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.17 
 
 		 3092 aa  1295    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  36.36 
 
 		 4165 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  44.52 
 
 		 1337 aa  712    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  48.14 
 
 		 1955 aa  1197    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.47 
 
 		 4607 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.36 
 
 		 1071 aa  810    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  50.96 
 
 		 3508 aa  807    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 		 3693 aa  843    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  54.63 
 
 		 4151 aa  902    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 		 1520 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  50.33 
 
 		 3408 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 1580 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.57 
 
 		 1349 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  47.11 
 
 		 4111 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.27 
 
 		 1831 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.76 
 
 		 2551 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  46.89 
 
 		 2020 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.24 
 
 		 1354 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 1559 aa  904    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  59.03 
 
 		 4080 aa  966    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.49 
 
 		 2966 aa  805    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  46.13 
 
 		 1143 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  58.14 
 
 		 3254 aa  935    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  45.26 
 
 		 4478 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 		 3130 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.49 
 
 		 1087 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 		 3693 aa  843    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  41.39 
 
 		 1349 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 		 1520 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.95 
 
 		 3874 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 1580 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.38 
 
 		 1837 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.15 
 
 		 1820 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 		 3676 aa  825    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.33 
 
 		 1867 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 		 3696 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  50.05 
 
 		 4930 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  53.79 
 
 		 3670 aa  822    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  51.79 
 
 		 2107 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  34.87 
 
 		 1581 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.12 
 
 		 5400 aa  952    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  49.89 
 
 		 2847 aa  778    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  67.81 
 
 		 2367 aa  1154    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 		 2462 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  45.48 
 
 		 1593 aa  1001    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  52.99 
 
 		 4840 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1548 aa  3024    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  52.44 
 
 		 1789 aa  811    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  46.73 
 
 		 1114 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  55.78 
 
 		 1602 aa  909    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  58.28 
 
 		 2060 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.07 
 
 		 3702 aa  841    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 		 2880 aa  822    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  52.09 
 
 		 4575 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  34.02 
 
 		 1580 aa  636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.64 
 
 		 2846 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.05 
 
 		 1101 aa  930    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  52.21 
 
 		 5255 aa  755    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  45.32 
 
 		 3427 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.47 
 
 		 7279 aa  1268    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 		 3679 aa  831    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  45.09 
 
 		 3176 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.78 
 
 		 1305 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  45.32 
 
 		 6768 aa  1041    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  44.97 
 
 		 3400 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>