More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0751 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  32.93 
 
 
2336 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  35.73 
 
 
2057 aa  1083    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  35.59 
 
 
2200 aa  1043    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  42.54 
 
 
2174 aa  855    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  32.68 
 
 
2345 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
3875 aa  7981    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  36.3 
 
 
3021 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  97.47 
 
 
3293 aa  6461    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  40.7 
 
 
2350 aa  876    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  36.68 
 
 
2035 aa  1052    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  41.89 
 
 
2310 aa  803    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  39.56 
 
 
2258 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  37.19 
 
 
3002 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  32.61 
 
 
2338 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  36.07 
 
 
3194 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  34.66 
 
 
3252 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  36.95 
 
 
3739 aa  685    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.29 
 
 
4165 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  34.82 
 
 
2230 aa  719    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.5 
 
 
1113 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 
1514 aa  685    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  29.14 
 
 
1497 aa  632  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  32.74 
 
 
1463 aa  622  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  35.65 
 
 
1131 aa  616  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  39.11 
 
 
1734 aa  616  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.19 
 
 
1436 aa  616  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.25 
 
 
1438 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  38.48 
 
 
1835 aa  609  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  34.87 
 
 
1157 aa  609  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  34.86 
 
 
2896 aa  606  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  34.72 
 
 
1157 aa  603  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  35.12 
 
 
2619 aa  603  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  36.63 
 
 
2706 aa  599  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  32.27 
 
 
1489 aa  599  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  31.89 
 
 
1501 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.95 
 
 
2762 aa  596  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  41.15 
 
 
4268 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  38.96 
 
 
1457 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  38.96 
 
 
1457 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  37.84 
 
 
1897 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  35.41 
 
 
1174 aa  586  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  38.08 
 
 
1469 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  31.46 
 
 
1884 aa  587  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  37.45 
 
 
1837 aa  580  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  36.77 
 
 
1888 aa  579  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.01 
 
 
1845 aa  580  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  32.96 
 
 
1511 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 
1193 aa  574  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.46 
 
 
1656 aa  574  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  38.34 
 
 
1457 aa  573  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  32.07 
 
 
2006 aa  569  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  35.42 
 
 
1862 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  38.63 
 
 
1321 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  35.92 
 
 
1678 aa  565  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
2103 aa  564  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 
1474 aa  561  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  30.92 
 
 
1809 aa  556  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  30.98 
 
 
1809 aa  556  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.58 
 
 
1487 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  35.48 
 
 
1317 aa  545  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  34.22 
 
 
1104 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  33.85 
 
 
1158 aa  533  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  34.67 
 
 
1167 aa  533  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  34.67 
 
 
1167 aa  533  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  35.63 
 
 
1149 aa  533  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  34.76 
 
 
1167 aa  531  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  28.24 
 
 
1889 aa  524  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  37.91 
 
 
1326 aa  517  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  33.76 
 
 
1414 aa  516  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  33.3 
 
 
1152 aa  517  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  35.76 
 
 
2023 aa  510  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  35.76 
 
 
2084 aa  511  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  35.44 
 
 
1894 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.5 
 
 
6889 aa  503  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  35.54 
 
 
2090 aa  503  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  33.92 
 
 
1163 aa  501  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  30.07 
 
 
1824 aa  493  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  33.19 
 
 
1042 aa  493  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  29.95 
 
 
1825 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  32.75 
 
 
1084 aa  492  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  29.95 
 
 
1825 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  30.26 
 
 
1837 aa  489  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 
1825 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  31.12 
 
 
2727 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  25.49 
 
 
3695 aa  403  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.05 
 
 
3099 aa  397  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  28.06 
 
 
3718 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.32 
 
 
5328 aa  380  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  31.87 
 
 
1699 aa  381  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  31.19 
 
 
4101 aa  374  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  28.26 
 
 
5149 aa  364  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  27.69 
 
 
3291 aa  362  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  27.78 
 
 
3348 aa  360  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.59 
 
 
8646 aa  356  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  28.71 
 
 
3650 aa  355  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  26.12 
 
 
3086 aa  353  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.48 
 
 
2151 aa  351  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  28.05 
 
 
2154 aa  349  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  27.54 
 
 
4747 aa  349  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  26.04 
 
 
3086 aa  348  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>