More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0752 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  33.95 
 
 		 4268 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  35.68 
 
 		 1845 aa  1077    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  33.8 
 
 		 1809 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  28.74 
 
 		 1889 aa  821    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  38.77 
 
 		 3739 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 		 1862 aa  1035    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  41.97 
 
 		 1734 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  96.5 
 
 		 1888 aa  3776    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  41.38 
 
 		 1837 aa  688    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  32.59 
 
 		 1824 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  32.66 
 
 		 1884 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  33.7 
 
 		 4165 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  32.24 
 
 		 1825 aa  865    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 		 1825 aa  862    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  33.77 
 
 		 1809 aa  913    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1897 aa  3917    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  32.24 
 
 		 1825 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  38.6 
 
 		 1835 aa  1229    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  39.12 
 
 		 2084 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  39.02 
 
 		 2023 aa  629  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  38.99 
 
 		 2090 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  38.31 
 
 		 1157 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  38.48 
 
 		 1894 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  39.83 
 
 		 2350 aa  622  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  39.7 
 
 		 2258 aa  619  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  39.33 
 
 		 3002 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  37.81 
 
 		 1157 aa  613  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  38.03 
 
 		 2230 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  39.59 
 
 		 2706 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.4 
 
 		 3194 aa  609  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.85 
 
 		 3252 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.61 
 
 		 1487 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  36.18 
 
 		 1514 aa  606  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  38.69 
 
 		 3021 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  38.37 
 
 		 2619 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  38.24 
 
 		 3293 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  37.63 
 
 		 3875 aa  579  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  38.97 
 
 		 2006 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  26.53 
 
 		 1497 aa  561  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  38.48 
 
 		 1131 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  38.15 
 
 		 2310 aa  552  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  37.13 
 
 		 2200 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  37.1 
 
 		 2174 aa  546  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  38.47 
 
 		 2057 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  38.12 
 
 		 2035 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  36.01 
 
 		 1104 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  34.58 
 
 		 2336 aa  530  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 		 1174 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  34.64 
 
 		 2338 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  34.47 
 
 		 2345 aa  523  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  37.59 
 
 		 1678 aa  520  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.6 
 
 		 1113 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  34.84 
 
 		 2896 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  35.53 
 
 		 1321 aa  499  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  34.81 
 
 		 1469 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  36.78 
 
 		 1436 aa  493  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  32.77 
 
 		 1193 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  36.52 
 
 		 1438 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  35.9 
 
 		 1489 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  34.73 
 
 		 1457 aa  477  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  34.73 
 
 		 1457 aa  477  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  35.9 
 
 		 1501 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  34.12 
 
 		 1837 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  35.99 
 
 		 1457 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 		 1158 aa  470  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  34.97 
 
 		 1084 aa  469  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  36.54 
 
 		 1463 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  35.57 
 
 		 1511 aa  466  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  34.73 
 
 		 1152 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  34.8 
 
 		 1163 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  35.06 
 
 		 1326 aa  460  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  34.6 
 
 		 1149 aa  460  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  34.55 
 
 		 1414 aa  452  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  33.26 
 
 		 1167 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  33.26 
 
 		 1167 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  34.33 
 
 		 1317 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  33.15 
 
 		 1167 aa  447  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1042 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.72 
 
 		 1699 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 		 2454 aa  305  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 3275 aa  291  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.37 
 
 		 5328 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  27.01 
 
 		 2664 aa  282  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  27.01 
 
 		 3824 aa  281  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.35 
 
 		 2439 aa  280  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  29.35 
 
 		 1574 aa  281  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  38.24 
 
 		 3163 aa  279  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  28.82 
 
 		 1405 aa  278  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09690  Non-ribosomal peptide synthetase, with condensation, AMP binding and thioesterase modules  30.3 
 
 		 1388 aa  277  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1766  condensation domain protein  28.32 
 
 		 921 aa  273  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  38.54 
 
 		 1567 aa  272  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  38.57 
 
 		 1567 aa  271  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  38.43 
 
 		 1567 aa  271  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.04 
 
 		 2151 aa  271  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  28.59 
 
 		 1914 aa  268  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  27.92 
 
 		 1193 aa  267  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  27.92 
 
 		 1193 aa  267  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35 
 
 		 3173 aa  265  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  27.71 
 
 		 6676 aa  263  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  24.59 
 
 		 3695 aa  263  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>