More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1609 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.48 
 
 
3470 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.76 
 
 
1087 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.95 
 
 
1349 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  42.45 
 
 
4268 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  41.67 
 
 
2006 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  38.13 
 
 
3337 aa  717    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.61 
 
 
6889 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  41.4 
 
 
3739 aa  931    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  37.41 
 
 
1514 aa  833    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  29.33 
 
 
2151 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  38.63 
 
 
4151 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.44 
 
 
2230 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
2333 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  27.45 
 
 
3432 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  26.52 
 
 
7168 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.94 
 
 
7210 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.07 
 
 
4531 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.31 
 
 
2156 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  35.49 
 
 
2345 aa  957    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  27.21 
 
 
4960 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  26.88 
 
 
7122 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.38 
 
 
4968 aa  679    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.6 
 
 
3021 aa  1097    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.1 
 
 
4960 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  29.42 
 
 
2154 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  28.14 
 
 
5328 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
5400 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  28.29 
 
 
9498 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  41.01 
 
 
1559 aa  717    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  28.43 
 
 
5213 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  28.28 
 
 
13537 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.81 
 
 
6676 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  34.58 
 
 
3293 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  39.76 
 
 
2619 aa  1005    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  28.07 
 
 
3308 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.07 
 
 
3498 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
2551 aa  770    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
1874 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.73 
 
 
1656 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.3 
 
 
1144 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 
1587 aa  767    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  43.29 
 
 
2706 aa  837    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  26.92 
 
 
2193 aa  673    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  41.44 
 
 
1157 aa  846    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.44 
 
 
2156 aa  698    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.16 
 
 
4502 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  37.38 
 
 
1402 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  35.74 
 
 
2336 aa  971    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  33.58 
 
 
3002 aa  1100    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  39.81 
 
 
3099 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  28.39 
 
 
6403 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  36.76 
 
 
1104 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.18 
 
 
3194 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  100 
 
 
3252 aa  6709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  40.1 
 
 
4080 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  27.18 
 
 
3086 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  27.87 
 
 
4991 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 
1939 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  29.63 
 
 
2164 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
7110 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  41.11 
 
 
4165 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  30.63 
 
 
1837 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.01 
 
 
3645 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.98 
 
 
1372 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  39.6 
 
 
1862 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 
3693 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  37.98 
 
 
1321 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  42.39 
 
 
1734 aa  716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 
2551 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
2880 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.93 
 
 
1354 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  29.75 
 
 
2581 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  34.52 
 
 
3875 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.65 
 
 
4478 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.38 
 
 
3086 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  35.4 
 
 
2338 aa  962    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
3176 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  43.63 
 
 
2762 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  27.86 
 
 
2448 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.94 
 
 
1487 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.06 
 
 
1113 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  39.12 
 
 
2230 aa  1487    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 
3679 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  43 
 
 
2232 aa  680    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 
3693 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.37 
 
 
2462 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  37.57 
 
 
2174 aa  1228    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.7 
 
 
3676 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  33.18 
 
 
2477 aa  1006    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.45 
 
 
3696 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.37 
 
 
2156 aa  689    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.49 
 
 
950 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  45.4 
 
 
1337 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  42.05 
 
 
1157 aa  849    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  25.35 
 
 
3695 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.98 
 
 
3291 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.87 
 
 
1349 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 
3702 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  28.99 
 
 
4747 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  37.14 
 
 
2896 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>