More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2600 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 		 3173 aa  6430    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  52.24 
 
 		 3163 aa  3066    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  37.12 
 
 		 1424 aa  767    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  35.5 
 
 		 3194 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  41.49 
 
 		 1909 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  55.29 
 
 		 3275 aa  3227    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.52 
 
 		 2604 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  39.91 
 
 		 1653 aa  635  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  42.52 
 
 		 1302 aa  626  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 		 2498 aa  622  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  41.51 
 
 		 1520 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  40.13 
 
 		 1574 aa  595  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  43.64 
 
 		 1466 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  43.26 
 
 		 1911 aa  592  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.48 
 
 		 1795 aa  580  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 3089 aa  579  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 		 1535 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 3090 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 		 995 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  38.15 
 
 		 2710 aa  567  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  39.15 
 
 		 995 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  42.91 
 
 		 4265 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  40.38 
 
 		 2682 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.91 
 
 		 4239 aa  563  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  42.91 
 
 		 4265 aa  564  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  39.69 
 
 		 4646 aa  563  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  40.7 
 
 		 2093 aa  563  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  37.81 
 
 		 1646 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 1408 aa  560  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.35 
 
 		 3133 aa  552  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.94 
 
 		 3127 aa  552  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  39.2 
 
 		 3093 aa  549  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.35 
 
 		 3335 aa  551  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  38.16 
 
 		 1489 aa  550  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  40.9 
 
 		 4186 aa  547  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  38.08 
 
 		 1582 aa  546  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 		 1416 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  38.12 
 
 		 1470 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  39.12 
 
 		 2684 aa  545  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  36.12 
 
 		 1833 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  36.36 
 
 		 2273 aa  544  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  36 
 
 		 1612 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  36 
 
 		 1612 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  35.37 
 
 		 2316 aa  532  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 1472 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 		 2679 aa  532  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  38.96 
 
 		 1466 aa  534  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 1472 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  35.03 
 
 		 2176 aa  533  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  36.47 
 
 		 1472 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 		 1656 aa  529  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  39.38 
 
 		 2454 aa  530  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 		 2150 aa  529  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.59 
 
 		 1087 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 		 3108 aa  527  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 		 2551 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 		 1560 aa  526  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.52 
 
 		 1354 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  36.75 
 
 		 1488 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 2551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  40.07 
 
 		 1497 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 3130 aa  518  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.83 
 
 		 1559 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.61 
 
 		 1559 aa  513  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 		 4647 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 		 2226 aa  513  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  38.12 
 
 		 2243 aa  510  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.04 
 
 		 1939 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  39.26 
 
 		 3337 aa  506  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 1874 aa  506  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.15 
 
 		 1587 aa  507  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 		 4478 aa  506  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.44 
 
 		 2232 aa  506  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  39.35 
 
 		 3427 aa  502  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.83 
 
 		 1349 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 2762 aa  500  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  48.38 
 
 		 2257 aa  500  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.8 
 
 		 950 aa  501  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.91 
 
 		 1337 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  39.08 
 
 		 1486 aa  495  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.72 
 
 		 1349 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  53.77 
 
 		 2380 aa  493  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 		 3676 aa  492  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  37.87 
 
 		 3424 aa  490  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.62 
 
 		 2066 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.98 
 
 		 4151 aa  487  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.01 
 
 		 3645 aa  484  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 5400 aa  484  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.4 
 
 		 1372 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  37.26 
 
 		 4165 aa  480  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 3693 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 3693 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 3702 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 3176 aa  478  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  36.64 
 
 		 3099 aa  476  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  36.46 
 
 		 1017 aa  476  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 3092 aa  477  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  36.59 
 
 		 1602 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.37 
 
 		 2462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  37.01 
 
 		 3045 aa  473  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>