More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1810 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  100 
 
 		 2380 aa  4694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 		 2257 aa  1275    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  48.09 
 
 		 1909 aa  503  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  55.1 
 
 		 3173 aa  483  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  48.92 
 
 		 1424 aa  479  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  52.46 
 
 		 1302 aa  476  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  50.58 
 
 		 2604 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  50.4 
 
 		 3163 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  51.82 
 
 		 1911 aa  469  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  49.51 
 
 		 1582 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  49.51 
 
 		 3089 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  45.34 
 
 		 1653 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  50.49 
 
 		 2498 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  49.15 
 
 		 1466 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  43.22 
 
 		 3235 aa  450  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  47.51 
 
 		 3194 aa  447  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  48.92 
 
 		 4646 aa  443  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  45.22 
 
 		 1646 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  48.13 
 
 		 3335 aa  436  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  49 
 
 		 2684 aa  436  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  47.43 
 
 		 3275 aa  436  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  47.23 
 
 		 995 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  46.73 
 
 		 995 aa  434  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  47.56 
 
 		 3093 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  47.06 
 
 		 3090 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  48.17 
 
 		 1520 aa  427  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  47.58 
 
 		 1574 aa  426  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  43.71 
 
 		 1612 aa  422  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  48.59 
 
 		 2896 aa  424  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  45.47 
 
 		 2710 aa  423  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  43.9 
 
 		 1612 aa  423  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  42.97 
 
 		 1000 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 		 1408 aa  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  46.3 
 
 		 2150 aa  415  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  46.36 
 
 		 3108 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  44.51 
 
 		 2679 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  46.92 
 
 		 2093 aa  417  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 		 1535 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  50.21 
 
 		 2454 aa  409  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  47.08 
 
 		 1560 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  46.24 
 
 		 3130 aa  407  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  48.19 
 
 		 926 aa  407  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  47.49 
 
 		 1472 aa  406  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  47.49 
 
 		 1472 aa  406  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  42.45 
 
 		 1833 aa  406  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  47.49 
 
 		 1472 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  40.35 
 
 		 2316 aa  399  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  46.05 
 
 		 1329 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  45.97 
 
 		 1353 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  46.27 
 
 		 1488 aa  398  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2363  polyketide synthase  47.18 
 
 		 1525 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  46.25 
 
 		 1329 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  43.27 
 
 		 4186 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  44.27 
 
 		 2682 aa  396  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  43.65 
 
 		 1370 aa  393  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.05 
 
 		 1795 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  45.19 
 
 		 1489 aa  393  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  47.74 
 
 		 1497 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  45.54 
 
 		 1466 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  44.55 
 
 		 4647 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2366  polyketide synthase  43.26 
 
 		 1560 aa  386  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  44.55 
 
 		 974 aa  383  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  45.36 
 
 		 1416 aa  383  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  41.68 
 
 		 2176 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  43.81 
 
 		 2273 aa  384  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  43.85 
 
 		 1470 aa  383  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  35.75 
 
 		 1272 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  49.16 
 
 		 3133 aa  377  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  43.74 
 
 		 1528 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  49.16 
 
 		 4239 aa  377  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  45.85 
 
 		 1524 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  49.16 
 
 		 4265 aa  377  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  49.16 
 
 		 4265 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  49.16 
 
 		 3127 aa  377  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  44.49 
 
 		 1530 aa  371  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  44.49 
 
 		 1530 aa  371  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  46.14 
 
 		 2226 aa  367  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  44.89 
 
 		 1486 aa  365  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  34.65 
 
 		 2508 aa  365  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3070  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.2 
 
 		 1208 aa  365  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  43.56 
 
 		 1465 aa  365  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  45.45 
 
 		 2243 aa  360  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.85 
 
 		 1087 aa  360  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  35.69 
 
 		 2006 aa  359  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 		 1656 aa  358  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  38.43 
 
 		 1613 aa  357  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6994  Beta-ketoacyl synthase  42.56 
 
 		 1276 aa  357  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  41.7 
 
 		 1939 aa  355  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  34.35 
 
 		 5854 aa  355  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  40.54 
 
 		 2333 aa  354  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 2551 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.51 
 
 		 1160 aa  352  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.9 
 
 		 2232 aa  351  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  43.69 
 
 		 2835 aa  350  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1237  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.65 
 
 		 779 aa  349  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.27 
 
 		 2839 aa  348  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  43.27 
 
 		 2832 aa  348  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.27 
 
 		 2832 aa  348  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.27 
 
 		 2839 aa  348  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.97 
 
 		 2792 aa  348  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>