More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2034 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  42.71 
 
 
1302 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  44.54 
 
 
4646 aa  754    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.13 
 
 
6889 aa  1069    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  41.04 
 
 
4647 aa  745    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  41.05 
 
 
1560 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  42.5 
 
 
3090 aa  760    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.56 
 
 
3133 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.88 
 
 
2839 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  36.06 
 
 
2316 aa  926    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  36.18 
 
 
4186 aa  899    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  38.89 
 
 
1416 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  44.58 
 
 
1466 aa  690    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  43.47 
 
 
3108 aa  771    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  40.55 
 
 
2682 aa  1132    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  47.03 
 
 
1424 aa  823    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.65 
 
 
1582 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  44.94 
 
 
2498 aa  742    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 
995 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.02 
 
 
1656 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
2176 aa  4493    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.99 
 
 
3335 aa  1434    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  49.51 
 
 
1646 aa  1575    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  44.18 
 
 
1911 aa  724    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.58 
 
 
4239 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  35.76 
 
 
1612 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  35.66 
 
 
1612 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.11 
 
 
2832 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  36.58 
 
 
4265 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  40.94 
 
 
1486 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  40.18 
 
 
1489 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 
995 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  44.9 
 
 
1574 aa  743    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  32.72 
 
 
3044 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.3 
 
 
2792 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  50.24 
 
 
2273 aa  2245    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  42.77 
 
 
3093 aa  767    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  43.07 
 
 
1833 aa  721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  33.14 
 
 
2943 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.85 
 
 
3718 aa  881    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  40.42 
 
 
2150 aa  680    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  46.59 
 
 
1653 aa  794    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 
1472 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  40.9 
 
 
2710 aa  1216    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  41.42 
 
 
2679 aa  1159    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  43.61 
 
 
1909 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  43.44 
 
 
3089 aa  759    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  41.18 
 
 
3235 aa  835    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  41.75 
 
 
2454 aa  1648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 
2093 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 
1472 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.76 
 
 
1795 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  44.02 
 
 
1520 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 
1470 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 
3130 aa  780    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 
1535 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.42 
 
 
2762 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 
974 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.56 
 
 
3127 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.88 
 
 
2839 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  31.73 
 
 
2835 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  43.18 
 
 
2684 aa  809    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  36.58 
 
 
4265 aa  881    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  42.15 
 
 
2604 aa  706    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  37.56 
 
 
1472 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 
1408 aa  727    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  32.11 
 
 
2832 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  40.07 
 
 
3194 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  38.78 
 
 
1497 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  38.61 
 
 
1488 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 
1466 aa  610  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  29.82 
 
 
2374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.14 
 
 
2376 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.96 
 
 
1087 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.73 
 
 
1587 aa  598  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.55 
 
 
1160 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 
2462 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.89 
 
 
2551 aa  588  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 
4478 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.28 
 
 
3099 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.6 
 
 
1354 aa  582  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
2551 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  32.1 
 
 
2063 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  38.27 
 
 
2243 aa  572  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 
2226 aa  569  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  29.54 
 
 
4165 aa  562  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
5154 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.94 
 
 
1337 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
1874 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 
1559 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.37 
 
 
1559 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.77 
 
 
3676 aa  550  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 
3176 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 
3693 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 
3693 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  34.56 
 
 
4183 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  42.79 
 
 
1000 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.12 
 
 
3702 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  33.8 
 
 
4874 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  33.8 
 
 
5023 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  33.8 
 
 
5021 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>