More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0836 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  45.35 
 
 		 1302 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  41.95 
 
 		 2682 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  39.96 
 
 		 3090 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  42.79 
 
 		 974 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.99 
 
 		 2316 aa  719    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  44.69 
 
 		 1424 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 2551 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  44.98 
 
 		 2684 aa  680    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  43.83 
 
 		 1646 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  37.83 
 
 		 1497 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  39.99 
 
 		 3093 aa  840    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 		 1574 aa  922    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  34.07 
 
 		 1833 aa  959    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 		 1489 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  47.99 
 
 		 2498 aa  758    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  43.93 
 
 		 2454 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  41.97 
 
 		 1520 aa  877    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  50.77 
 
 		 2150 aa  1968    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  43.78 
 
 		 1472 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  33.26 
 
 		 1612 aa  739    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  41.59 
 
 		 3089 aa  840    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 		 1416 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 1560 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  41.73 
 
 		 2679 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  40.4 
 
 		 1909 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 995 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  42.13 
 
 		 4646 aa  867    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  40.67 
 
 		 1911 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  33.36 
 
 		 1612 aa  737    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 		 4647 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2093 aa  4184    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  43.78 
 
 		 1472 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  42 
 
 		 1488 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 		 995 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  41.33 
 
 		 2273 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  44.26 
 
 		 1470 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.99 
 
 		 1408 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  40.46 
 
 		 2710 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  40.8 
 
 		 1582 aa  888    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 		 1535 aa  858    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 		 3108 aa  844    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.02 
 
 		 1795 aa  967    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  41.64 
 
 		 3130 aa  879    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  40.16 
 
 		 2176 aa  667    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 		 1466 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  35.99 
 
 		 1653 aa  1007    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 		 1472 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  43.75 
 
 		 1466 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.27 
 
 		 2604 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  41.11 
 
 		 3335 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  41.5 
 
 		 4186 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  34.79 
 
 		 1486 aa  625  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.82 
 
 		 2762 aa  609  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.96 
 
 		 3194 aa  599  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 		 2243 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.07 
 
 		 6889 aa  590  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 2226 aa  589  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.58 
 
 		 3099 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  42.04 
 
 		 4265 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.04 
 
 		 4239 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  41.99 
 
 		 4265 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.06 
 
 		 1559 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.43 
 
 		 3693 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.43 
 
 		 3693 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  28.88 
 
 		 1559 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.73 
 
 		 3173 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  41.94 
 
 		 1000 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 3676 aa  555  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.38 
 
 		 3702 aa  556  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.42 
 
 		 1087 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.31 
 
 		 3133 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  40.2 
 
 		 1465 aa  547  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.31 
 
 		 3127 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 1587 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.29 
 
 		 1337 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 		 1656 aa  542  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 2551 aa  543  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  38.5 
 
 		 3163 aa  540  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.35 
 
 		 1874 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.95 
 
 		 3679 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.04 
 
 		 2462 aa  530  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  32.58 
 
 		 1524 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.44 
 
 		 1354 aa  526  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.2 
 
 		 1349 aa  526  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.98 
 
 		 1349 aa  523  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  42.99 
 
 		 3235 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  46.7 
 
 		 926 aa  515  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 		 3696 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 1658 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  36.5 
 
 		 3275 aa  503  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  37.57 
 
 		 1402 aa  499  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.5 
 
 		 3427 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  33.95 
 
 		 1955 aa  496  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  33.92 
 
 		 1548 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 		 3092 aa  492  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  32.78 
 
 		 3158 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  36.5 
 
 		 1528 aa  493  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 		 1939 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  36.28 
 
 		 1530 aa  490  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 		 5400 aa  489  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>