More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1246 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  50.94 
 
 
2126 aa  1092    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  42.5 
 
 
2890 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  49.64 
 
 
1601 aa  1218    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  46.94 
 
 
3033 aa  1145    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.97 
 
 
3711 aa  2171    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.25 
 
 
3463 aa  2142    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.46 
 
 
2367 aa  929    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.58 
 
 
1593 aa  1216    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  50.68 
 
 
4151 aa  1313    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.32 
 
 
2719 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.6 
 
 
2066 aa  1056    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  45.43 
 
 
4575 aa  1108    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  53.42 
 
 
3670 aa  1139    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  49.97 
 
 
4840 aa  1215    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  41.95 
 
 
2024 aa  974    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  54.21 
 
 
1071 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  57.44 
 
 
1143 aa  920    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.9 
 
 
3408 aa  2123    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
2551 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
1874 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 
1656 aa  741    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 
1144 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1587 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  53.81 
 
 
3254 aa  1267    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.33 
 
 
3508 aa  1894    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
3092 aa  1234    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.49 
 
 
2880 aa  803    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  40.22 
 
 
1349 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.12 
 
 
2846 aa  1223    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.11 
 
 
2136 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.15 
 
 
1822 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.88 
 
 
7110 aa  2364    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.3 
 
 
1548 aa  1019    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
1816 aa  1202    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  41.1 
 
 
2081 aa  1015    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  51.47 
 
 
6768 aa  1358    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.93 
 
 
3449 aa  1256    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.63 
 
 
3355 aa  1828    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.48 
 
 
1820 aa  1204    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.63 
 
 
3930 aa  1370    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.21 
 
 
1087 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39 
 
 
3693 aa  820    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  53.12 
 
 
1114 aa  916    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 
1837 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.92 
 
 
1867 aa  1311    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
3874 aa  1375    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  53.05 
 
 
2966 aa  1805    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.31 
 
 
3494 aa  2288    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  50.92 
 
 
7210 aa  2521    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  38.09 
 
 
2551 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.48 
 
 
3427 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.81 
 
 
1354 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.11 
 
 
4930 aa  1320    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.97 
 
 
3176 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.16 
 
 
1602 aa  966    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
5154 aa  10100    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.04 
 
 
1955 aa  1044    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.94 
 
 
1349 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.74 
 
 
4478 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.4 
 
 
4882 aa  1539    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 
2762 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.1 
 
 
1305 aa  845    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39 
 
 
3693 aa  820    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  49.15 
 
 
1924 aa  1231    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  44.12 
 
 
2847 aa  1067    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.34 
 
 
1559 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  56.61 
 
 
3148 aa  915    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  46.5 
 
 
2107 aa  1105    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  55.8 
 
 
5255 aa  2725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 
3676 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.52 
 
 
2090 aa  1196    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 
3696 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 
2230 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  43.83 
 
 
2020 aa  881    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  44.91 
 
 
2113 aa  1097    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.69 
 
 
5400 aa  2284    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  50.4 
 
 
4080 aa  2156    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  57.31 
 
 
1831 aa  1640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.69 
 
 
2232 aa  695    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  51.83 
 
 
2060 aa  828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  50.63 
 
 
1584 aa  1286    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  47.06 
 
 
2277 aa  1245    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.93 
 
 
7279 aa  2308    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  54.93 
 
 
1101 aa  920    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 
1939 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.54 
 
 
1402 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  49.58 
 
 
2374 aa  1307    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
3702 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.51 
 
 
1823 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  42.97 
 
 
4183 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 
1559 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  43.9 
 
 
3400 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  59.77 
 
 
1789 aa  1732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.64 
 
 
3645 aa  757    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  45.96 
 
 
3158 aa  1189    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  50.32 
 
 
2376 aa  1313    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  52.56 
 
 
4607 aa  885    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 
3679 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.46 
 
 
1337 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  43.32 
 
 
3493 aa  989    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>