More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2423 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  45.78 
 
 
1489 aa  708    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  46.51 
 
 
1466 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  46.58 
 
 
4265 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  45.72 
 
 
6889 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  49.94 
 
 
2498 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  41.58 
 
 
4647 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  47.96 
 
 
2684 aa  754    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  35.12 
 
 
2316 aa  775    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  42.75 
 
 
4186 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  48.65 
 
 
1424 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
2551 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 
2762 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  48.06 
 
 
1646 aa  811    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  47.16 
 
 
2604 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  35.38 
 
 
1833 aa  1041    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.58 
 
 
4239 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.65 
 
 
1559 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  34.15 
 
 
1612 aa  793    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.6 
 
 
1559 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  43.95 
 
 
1574 aa  1025    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 
2226 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  45.21 
 
 
1911 aa  880    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  43.18 
 
 
995 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.41 
 
 
1520 aa  978    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  41.5 
 
 
1497 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  44.23 
 
 
3093 aa  909    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  43.99 
 
 
3090 aa  926    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  34.22 
 
 
1612 aa  793    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
1795 aa  3550    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 
2150 aa  1088    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  45.4 
 
 
1472 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  43.94 
 
 
1560 aa  863    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  37.39 
 
 
1416 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  47.77 
 
 
2454 aa  712    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  45.48 
 
 
2679 aa  724    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 
2551 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  46.99 
 
 
1909 aa  820    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  42.98 
 
 
1408 aa  744    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  38.83 
 
 
1486 aa  736    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  44.08 
 
 
4646 aa  928    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 
2093 aa  995    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  45.4 
 
 
1472 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  44.47 
 
 
3108 aa  931    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 
2243 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.2 
 
 
3676 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  44.33 
 
 
1470 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  44.78 
 
 
2682 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  43.15 
 
 
2273 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.16 
 
 
1582 aa  976    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
3130 aa  937    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  43.97 
 
 
1535 aa  934    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  45.83 
 
 
1302 aa  757    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  44.96 
 
 
974 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  47.02 
 
 
3335 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  44.62 
 
 
1488 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  39.87 
 
 
1466 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  44.04 
 
 
2710 aa  736    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 
995 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  46.87 
 
 
4265 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  45.52 
 
 
1472 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  41.76 
 
 
2176 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  44.44 
 
 
3089 aa  925    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.68 
 
 
1087 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 
1653 aa  1209    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.4 
 
 
3133 aa  632  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.72 
 
 
1354 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.4 
 
 
3127 aa  633  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
2462 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  34.01 
 
 
1465 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  40.27 
 
 
3194 aa  626  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.74 
 
 
3427 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.89 
 
 
1337 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.64 
 
 
3679 aa  621  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.45 
 
 
1587 aa  613  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 
1656 aa  608  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 
1658 aa  608  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.32 
 
 
3696 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  44.56 
 
 
1000 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
1874 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
3092 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.76 
 
 
3099 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.64 
 
 
3337 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.91 
 
 
3176 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.43 
 
 
1101 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.44 
 
 
2880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.8 
 
 
3693 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.02 
 
 
3424 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.8 
 
 
3693 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.91 
 
 
3702 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  40.94 
 
 
3173 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.99 
 
 
4478 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  39.23 
 
 
3163 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  34.09 
 
 
1524 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.9 
 
 
1349 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.9 
 
 
1349 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  34.89 
 
 
1577 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.49 
 
 
2477 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42.43 
 
 
3463 aa  549  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.15 
 
 
1372 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.07 
 
 
4165 aa  546  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>