More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4055 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  44.96 
 
 
1911 aa  673    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
974 aa  1970    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  45.46 
 
 
4646 aa  729    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  43.53 
 
 
1653 aa  758    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  45.24 
 
 
1424 aa  801    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  41.68 
 
 
1646 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  39.01 
 
 
1612 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  43.91 
 
 
1466 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 
1582 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  46.59 
 
 
1574 aa  782    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  38.5 
 
 
2176 aa  668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.29 
 
 
1520 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  44.02 
 
 
3089 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  40.82 
 
 
1833 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  43.38 
 
 
3090 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.71 
 
 
3130 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  43.91 
 
 
2150 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  46.77 
 
 
2498 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.84 
 
 
995 aa  747    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  41.15 
 
 
995 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  39.58 
 
 
2273 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  40.75 
 
 
1909 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  42.2 
 
 
3108 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  39.72 
 
 
2684 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  44.68 
 
 
3093 aa  701    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  42.79 
 
 
2093 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  39.12 
 
 
1612 aa  649    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 
1470 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 
1302 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  38.58 
 
 
2710 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  46.3 
 
 
1535 aa  727    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  38.89 
 
 
1408 aa  715    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.96 
 
 
1795 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  40.73 
 
 
1488 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 
1489 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  45.47 
 
 
1560 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  38.18 
 
 
2679 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  41.83 
 
 
1486 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  43.46 
 
 
1466 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  42.81 
 
 
2604 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  42.42 
 
 
4647 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  40.36 
 
 
1472 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
1472 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
1472 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.34 
 
 
3335 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  40.51 
 
 
2454 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  38.28 
 
 
2682 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  40.18 
 
 
4186 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.75 
 
 
1087 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.66 
 
 
6889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.55 
 
 
2462 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  41.58 
 
 
1465 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  39.41 
 
 
1416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  42.74 
 
 
1497 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  35.5 
 
 
2316 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
2551 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.16 
 
 
1656 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.58 
 
 
3194 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.02 
 
 
1337 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  41.1 
 
 
4265 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.74 
 
 
1587 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.1 
 
 
4239 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  43.95 
 
 
1000 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  41.1 
 
 
4265 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.3 
 
 
2551 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
1874 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 
3679 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.75 
 
 
3676 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  40.33 
 
 
2226 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.41 
 
 
1354 aa  539  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.92 
 
 
1349 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 
2762 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  35.81 
 
 
1349 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
2243 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.94 
 
 
3424 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.76 
 
 
3133 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 
3693 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.55 
 
 
3693 aa  532  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  37.14 
 
 
2477 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.76 
 
 
3127 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 
3702 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 
1559 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  35.8 
 
 
3337 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.01 
 
 
3696 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.05 
 
 
1559 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.49 
 
 
1101 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  36.81 
 
 
1402 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.12 
 
 
4478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  39.56 
 
 
1602 aa  515  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  34.2 
 
 
3252 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.92 
 
 
3670 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
7110 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.36 
 
 
1372 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 
3176 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  38.49 
 
 
7210 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
1816 aa  512  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  39.96 
 
 
3254 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  40.16 
 
 
4080 aa  505  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 
3463 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 
7279 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>