Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Strop_2768 |
Symbol | |
ID | 5059231 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Salinispora tropica CNB-440 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_009380 |
Strand | - |
Start bp | 3117970 |
End bp | 3139602 |
Gene Length | 21633 bp |
Protein Length | 7210 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 71% |
IMG OID | 640475022 |
Product | beta-ketoacyl synthase |
Protein accession | YP_001159588 |
Protein GI | 145595291 |
COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
COG ID | [COG3321] Polyketide synthase modules and related proteins |
TIGRFAM ID | [TIGR00128] malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase [TIGR00517] acyl carrier protein |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 4 |
Fosmid unclonability p-value | 0.1197 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | GTGAGCCTTG CCGGTTGCCG CGAGGCCGCC GCGACCGGTC CCCCTACCGG TCCCGGCGGC CTCGCCGTGA CCGGGCGCCG AAGCCGACAC ACCGACCCGG GCGCCGAACC CGGAGACCTA GTGGAGCGTG CCATGAGCGA GTCCGCGAAT CCCACCAGTG CCGAGCTCGG CGCGCTGTCG GCGCTGCGGC GGCGACTGGA GGGCCGCACG GCCGAGGAGC AGGACCGGGC GCTCATCGCT CTGGTCCGGG AGCAGGCCCG CGACGTGCTG CGGACCGTGC TGCCGGACGG TCCGGAGGCC GTCGAGCCGG GCCGGCCCTT CCGCGATCTG GGCTTCGACT CGCTCGCCGC AGTCGAGCTG CACCGTCGCC TCATCGCCGC CACCGGCCTC GACCTTCCGG TCACCCTGAT CTTCGACCAT CCGACGCCGC AGGCGGTCGG GCGGCTGCTG CGGACGCTAC TCGGCGGCGA CGCCGCCCCC GCCCCGGCCG CCGCGCCGCT GCGCCGGCCC GACGACGAGC CGATCGCTGT GGTCGGCATC GGCTGTCGCT ACCCTGGCCA CAGCACCTCC GCCGAGGACC TGTGGCGGCT GGTGTCCGAG GGCCGGCACG TCATCTCCGA CTTCCCGACC GACCGGGGCT GGGACATCGA GGGGCTATAC GATCCCGATC CGGGCAAGCC GGGCAAGACC TACGTCCGTC AGGGCGGGTT CCTGGAGGAC GCGGCCGCGT TCGACGCGGA CTTCTTCGGC ATCAGCCCGC GCGAGGCCAT GACGATGGAC CCCCAACAGC GGCTGGTGCT GGAGACCGCC TGGGAGGCCC TGGAGGACGC CGGCATCGAC ACGGCGTCGC TGCATGGTAG CCAGACCGGC GTCTTCATCG GCGCCGAGCC 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GCGAAGGGGC GGGCGGCGCT GGAGCGGCGG GCGGTCGTCG TCGGCGACGC CACCGACCTC CTGGCCGGCG CGGACGCCCT GGTCGCGGGC GCACCGGTTC CCACTCCGCT GCACGGCGGC TCCGGCACTG TCTTTGTTTT TCCGGGGCAG GGGTCGCAGT GGTTGGGCAT GGCGGTGGAG TTGTTGGATT CGTCGCCGGT GTTCGCGGAG CGGATGGGTG AGTGTGCTGC GGCGTTGGAT GAGTTTGTGT CGTGGCGGCT GGTTGACGTG TTGCGTGGTG TGGAGGGCGC GCCGTCGCTG GACCGGGAGG ATGTGGTGCA GCCGGTTCTG TGGGCGGTGA TGGTGTCGCT TGCGGGGTTG TGGCGTTCGT TTGGTGTGGA GCCGGATGCG GTGGTTGGTC ATTCGCAGGG TGAGATCGCG GCTGCGGTGG TGGCGGGTGG TCTGTCGTTG CGTGATGGTG CGTTGGTGGT GGCGTTGCGT AGTTCGGTGA TCGCGGAGGT TTTGGCGGGT CGGGGTGGGA TGGCCTCGGT GGGTCTGTCG GAGCGTCAGG TGCTTGATCG TCTGGGTGCG TATGACGGTC GGTTGTCGGT GGCGACGGTC AATGGTGCGT CGTCGGTGGT GGTGACGGGT GATCGGGATG CGGTGGACGA TCTGATCGCG ACGTTGAGCG CCGAGGATGT GCGGGCCAGG CGGGTGAACA TCGACTATGC GTCGCATTCG GCGCAGGTGG AGTTGATTGA GCAGCGGTTG TTGGAGGTGT TGGCGGGGGT GGTGCCTCGG TCGTCGAGTG TGCCGTTCTA TTCGACGGTG ACCGGGGGTG TGGTGGACAC CGTTGGGTTG GATGCCGGTT ACTGGTTTGC GAATTTGCGG CGGAGGGTGC GGTTCGAGGA GGCGACCCGG GTGTTGCTCG 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GTTGGATGCG GCGTTGCAGG CTGTTGGGAT CGGTGAGCCG GTGTCGGCGG ATCGTCCGCC GTACCTGCCG TTCGTGTGGA CCGATGTCAC GTTGCATGCC GCCGGTGCCA CTGCTCTGCG GGTGAAGATC ACTGCGAGTG GGCCGGAGGC CGTCACCCTG CACCTGGCTG ATCCCGAGGG GACCCCGGTT GCCGTCGTTG GTTCGCTGGT GTCCCGTCCG GTCCAGCTCA GCACCGCCGT ACCGACCGAC GGTGATCTCT ACCGCGTCGA CTGGACCGCC GTTCCCACCG GCACCGCTCC TGAGTCGTGG GGTTACCTGG AGGGGCTCGG CCTCGGCGTA CCCGATGTCG TGCTCGCCCC GCTCACCCGG GCCGGCGACG CCACCGACCC GGCCACCGCC GCCCGTACGG TGGCGGGGCA GACCCTAGCC ATTCTCCAGT CCTGGCTGGC CGATCCGGCC CAGGCCGCCG CTCGGCTGGT GGTGATCACC GACGGTGCTG TTGATGGTGG TACCGATCTG GTTTATGCCC CGGTGTGGGG TCTGGTGCGT GCTGCTCAGG CGGAGAATCC GGGTCAGTTC GTGTTGGTTG ATGCGGATCC GGGGACTCCG GTGGAGGAGG TTCTGGCGGC GGTGGGTACT GGGGAGCCGG AGTTGTCGTT GCGGGGTGGG CAGGTGCGGG TGCCGCGGTT GGCTCGTGTG GTGGGGGGTG GTGTGTGGCG GGCCGGGGGC ACGGTGTTGG TTACTGGTGG TACTGGTGTG TTGGGTGCGT TGGTGGCTCG GCATTTGGTG GTTGGGCATG GTGTTCGGGA GTTGGTGTTG GCCTCTCGGC GTGGCCTGGC CGCGCCGGGT GCGGTGGAGT TGCGTGACGA GTTGATCGGG CTTGGTGCGG TGGTTGAGGT GGTTGCGTGT 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