More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2768 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  44.52 
 
 		 3400 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 7210 aa  14040    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  52.93 
 
 		 2126 aa  1222    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.57 
 
 		 3645 aa  913    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  52.32 
 
 		 3463 aa  3000    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.42 
 
 		 1823 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  59 
 
 		 1584 aa  999    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  48.94 
 
 		 2024 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  34.59 
 
 		 3101 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.26 
 
 		 1816 aa  1658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.15 
 
 		 2719 aa  1104    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  45.26 
 
 		 2066 aa  1262    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.15 
 
 		 3508 aa  2649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  47.83 
 
 		 3670 aa  1542    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  53.04 
 
 		 2374 aa  954    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.92 
 
 		 1827 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  52.85 
 
 		 1831 aa  1507    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.79 
 
 		 3254 aa  1298    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 		 2551 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.3 
 
 		 1874 aa  952    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.25 
 
 		 1656 aa  735    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  48.26 
 
 		 2846 aa  1392    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.35 
 
 		 1587 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  50.17 
 
 		 3158 aa  1302    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  55.47 
 
 		 1548 aa  935    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  52.98 
 
 		 1955 aa  963    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  48.95 
 
 		 3033 aa  1052    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 1939 aa  846    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.94 
 
 		 1924 aa  1301    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.51 
 
 		 3252 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.72 
 
 		 4930 aa  2745    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.1 
 
 		 4840 aa  1864    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.57 
 
 		 2090 aa  1364    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.9 
 
 		 2333 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  50.91 
 
 		 2081 aa  953    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.42 
 
 		 3111 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.97 
 
 		 2880 aa  769    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  51.82 
 
 		 5255 aa  4375    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 		 1559 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  50 
 
 		 1820 aa  1454    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.97 
 
 		 2060 aa  1013    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.72 
 
 		 3693 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 1837 aa  1172    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  59.54 
 
 		 1601 aa  964    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  54.82 
 
 		 3355 aa  1921    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.16 
 
 		 1087 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.13 
 
 		 2085 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  55.03 
 
 		 2966 aa  1191    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53.67 
 
 		 1593 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.97 
 
 		 2232 aa  734    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 		 2551 aa  740    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.66 
 
 		 3148 aa  1548    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 		 1354 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.2 
 
 		 3493 aa  1565    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.85 
 
 		 2762 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.22 
 
 		 4575 aa  1384    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  56.41 
 
 		 1143 aa  914    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.64 
 
 		 2604 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  50.92 
 
 		 5154 aa  2488    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.16 
 
 		 4478 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 		 1835 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.77 
 
 		 1602 aa  1146    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.72 
 
 		 3693 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 		 1806 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.23 
 
 		 3092 aa  1209    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.1 
 
 		 7110 aa  7492    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.87 
 
 		 3176 aa  829    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.13 
 
 		 2085 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.4 
 
 		 2107 aa  1241    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  44.2 
 
 		 1402 aa  722    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 		 3676 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  44.81 
 
 		 2477 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.58 
 
 		 3696 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  54.77 
 
 		 1071 aa  882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 		 1805 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.21 
 
 		 2847 aa  1372    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.26 
 
 		 4080 aa  2414    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.01 
 
 		 1828 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.86 
 
 		 2462 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.73 
 
 		 2376 aa  923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 		 1832 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  53.21 
 
 		 1789 aa  1558    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.44 
 
 		 3711 aa  2943    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  51.82 
 
 		 6768 aa  1475    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  52.06 
 
 		 3494 aa  2989    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.6 
 
 		 4111 aa  2147    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.88 
 
 		 3874 aa  1672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  52.22 
 
 		 7279 aa  3823    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 		 3702 aa  901    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.19 
 
 		 2113 aa  1323    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 		 5400 aa  4295    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 2230 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.13 
 
 		 2085 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  54.14 
 
 		 3408 aa  2336    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.22 
 
 		 1349 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  38.42 
 
 		 2220 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.41 
 
 		 1337 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  52.39 
 
 		 2367 aa  1238    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 		 3679 aa  901    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.94 
 
 		 4151 aa  1552    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>