More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2681 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.47 
 
 		 4183 aa  685    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  59.6 
 
 		 3254 aa  947    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.82 
 
 		 3101 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.39 
 
 		 2126 aa  1074    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  51.29 
 
 		 1584 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  50.88 
 
 		 4151 aa  1227    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 		 1837 aa  1214    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.92 
 
 		 3408 aa  1353    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  55.17 
 
 		 2376 aa  857    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  53.94 
 
 		 7210 aa  1688    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.8 
 
 		 1831 aa  1347    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  52.13 
 
 		 2367 aa  1237    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  46.98 
 
 		 3930 aa  1367    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.05 
 
 		 2719 aa  949    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  45.77 
 
 		 2066 aa  911    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 		 2230 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  57.8 
 
 		 3463 aa  1769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  54.76 
 
 		 4080 aa  1523    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  48.59 
 
 		 3400 aa  670    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.63 
 
 		 3508 aa  1337    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 2551 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 		 1874 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 		 1656 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.3 
 
 		 1559 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.45 
 
 		 1587 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 		 4930 aa  1198    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.03 
 
 		 1939 aa  774    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.73 
 
 		 1071 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 		 2762 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  57.07 
 
 		 1548 aa  926    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.26 
 
 		 2060 aa  1065    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.38 
 
 		 1114 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  47.75 
 
 		 5154 aa  1220    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 		 4111 aa  1034    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.62 
 
 		 1349 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.3 
 
 		 5255 aa  1406    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  53.02 
 
 		 3711 aa  1565    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.94 
 
 		 1602 aa  1212    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  52.91 
 
 		 2081 aa  879    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.86 
 
 		 3111 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  50.32 
 
 		 1593 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.84 
 
 		 3449 aa  1232    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  41.84 
 
 		 1559 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52.75 
 
 		 1601 aa  804    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  47.34 
 
 		 1789 aa  1330    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.57 
 
 		 3693 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.9 
 
 		 1337 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.14 
 
 		 3874 aa  1275    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  49.18 
 
 		 3355 aa  1272    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.05 
 
 		 1087 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.33 
 
 		 2090 aa  1224    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.13 
 
 		 2113 aa  1325    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.54 
 
 		 1349 aa  747    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.48 
 
 		 2551 aa  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  37.6 
 
 		 1909 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1354 aa  766    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.59 
 
 		 3092 aa  1129    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  41.73 
 
 		 2047 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  50.52 
 
 		 1143 aa  757    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  48.2 
 
 		 4840 aa  1356    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  47.49 
 
 		 4478 aa  722    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.41 
 
 		 3494 aa  1442    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 		 7110 aa  1672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.57 
 
 		 3693 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  46.79 
 
 		 1402 aa  737    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.1 
 
 		 4575 aa  1216    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.44 
 
 		 5400 aa  1685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 		 2232 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.05 
 
 		 1867 aa  1394    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.93 
 
 		 2847 aa  1318    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.17 
 
 		 3676 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  45.42 
 
 		 2477 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.03 
 
 		 3696 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  44.77 
 
 		 1616 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.34 
 
 		 6768 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  47.4 
 
 		 1924 aa  1254    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.85 
 
 		 2846 aa  1174    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  57.74 
 
 		 3148 aa  864    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.69 
 
 		 1820 aa  1274    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 		 3645 aa  831    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.71 
 
 		 2890 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.66 
 
 		 2966 aa  1041    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 		 3176 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  56.64 
 
 		 2374 aa  877    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.72 
 
 		 3493 aa  1238    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  54.01 
 
 		 1955 aa  846    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.83 
 
 		 2333 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 3702 aa  810    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.88 
 
 		 2107 aa  1277    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 1816 aa  3549    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.77 
 
 		 7279 aa  1387    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.3 
 
 		 1372 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  47.47 
 
 		 3670 aa  1256    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  57.53 
 
 		 3033 aa  964    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  50.48 
 
 		 2024 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.84 
 
 		 3158 aa  946    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  46.33 
 
 		 2880 aa  660    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 3679 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.85 
 
 		 4607 aa  926    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  36.51 
 
 		 2604 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>