More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12960 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.2 
 
 		 2719 aa  926    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  53.91 
 
 		 2126 aa  1373    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 		 1816 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.87 
 
 		 3930 aa  1166    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  43.25 
 
 		 4607 aa  985    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 		 2060 aa  1023    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  47.17 
 
 		 2367 aa  1119    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  46.01 
 
 		 6768 aa  1042    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 		 3874 aa  1102    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  39.84 
 
 		 2020 aa  912    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 3693 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  51.64 
 
 		 4111 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  42.38 
 
 		 4575 aa  823    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 3693 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.23 
 
 		 5400 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  58.03 
 
 		 4151 aa  1661    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.94 
 
 		 3676 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  45.2 
 
 		 7210 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  59.21 
 
 		 1602 aa  1183    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  41.02 
 
 		 2108 aa  948    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  100 
 
 		 1616 aa  3160    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.23 
 
 		 3702 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 3679 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  46.7 
 
 		 3494 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.05 
 
 		 2604 aa  632  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  39.25 
 
 		 2666 aa  619  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 7110 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.84 
 
 		 4882 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  43.6 
 
 		 3463 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  44.03 
 
 		 3711 aa  555  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  37.43 
 
 		 5526 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  42.15 
 
 		 7279 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  43.82 
 
 		 4080 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 1837 aa  530  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  63.21 
 
 		 1017 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 5255 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  62.38 
 
 		 1402 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  40.21 
 
 		 4840 aa  486  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  31.8 
 
 		 2085 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  31.57 
 
 		 2085 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  31.57 
 
 		 2085 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  40.51 
 
 		 1789 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 		 1831 aa  475  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.53 
 
 		 3449 aa  459  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  37.89 
 
 		 2090 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  39.63 
 
 		 2847 aa  453  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  39.72 
 
 		 3408 aa  450  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  38.82 
 
 		 2113 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  58.24 
 
 		 502 aa  445  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.32 
 
 		 1867 aa  442  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  38.03 
 
 		 3670 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  30.07 
 
 		 2126 aa  439  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  39.33 
 
 		 3148 aa  432  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  37.26 
 
 		 3508 aa  427  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  30.15 
 
 		 2101 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.88 
 
 		 2966 aa  423  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  39.91 
 
 		 2107 aa  419  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  36.94 
 
 		 1820 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  28.49 
 
 		 3080 aa  406  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.75 
 
 		 3696 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  39.42 
 
 		 3355 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  36.2 
 
 		 2066 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.48 
 
 		 3176 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 		 4930 aa  396  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  36.05 
 
 		 1924 aa  394  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  31.46 
 
 		 1974 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 		 5154 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  50 
 
 		 1101 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.31 
 
 		 3158 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  34.95 
 
 		 2277 aa  377  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.89 
 
 		 2232 aa  362  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.43 
 
 		 2551 aa  362  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 		 3092 aa  361  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.58 
 
 		 2225 aa  357  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  39.35 
 
 		 3045 aa  355  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 		 2547 aa  355  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 		 3254 aa  352  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  33.73 
 
 		 2230 aa  347  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  50.59 
 
 		 1548 aa  342  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.36 
 
 		 1126 aa  333  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  34.36 
 
 		 2507 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  36.07 
 
 		 2846 aa  329  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  45.24 
 
 		 2376 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.75 
 
 		 2078 aa  329  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  34.54 
 
 		 2486 aa  328  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  34.54 
 
 		 2486 aa  328  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  35.66 
 
 		 2545 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  34.39 
 
 		 2134 aa  327  8.000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  46.96 
 
 		 2374 aa  327  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  35.07 
 
 		 2499 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 2543 aa  323  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.86 
 
 		 3645 aa  322  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 1874 aa  322  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.88 
 
 		 2462 aa  321  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  38.16 
 
 		 2220 aa  321  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 		 3493 aa  320  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  34.74 
 
 		 2111 aa  320  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 		 1909 aa  317  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  33.6 
 
 		 2556 aa  314  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  34.13 
 
 		 2543 aa  312  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>