More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11679 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  50.04 
 
 
4111 aa  1061    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.42 
 
 
2376 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  51.96 
 
 
7210 aa  1242    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.69 
 
 
4607 aa  1598    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  57.31 
 
 
1584 aa  971    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.6 
 
 
1867 aa  1087    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
1832 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  51.8 
 
 
1831 aa  1192    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  52.31 
 
 
3033 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46 
 
 
4840 aa  959    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  54.04 
 
 
1789 aa  1191    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  52.83 
 
 
3408 aa  1201    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  40.1 
 
 
1827 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  47.21 
 
 
2367 aa  1484    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  48.96 
 
 
1820 aa  1122    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.3 
 
 
2719 aa  1550    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.1 
 
 
2066 aa  899    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  36.75 
 
 
1559 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.58 
 
 
1087 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  54.58 
 
 
1616 aa  1445    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  47.61 
 
 
1924 aa  996    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
2551 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
1874 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.63 
 
 
1656 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.13 
 
 
2136 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
1587 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  51.14 
 
 
3493 aa  1026    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 
3176 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  48.54 
 
 
4080 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  43.77 
 
 
1402 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.75 
 
 
7110 aa  1282    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  56.25 
 
 
1143 aa  920    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.1 
 
 
4882 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.87 
 
 
2060 aa  1358    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12961  polyketide synthase pks15  71.71 
 
 
496 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.914056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 
1939 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  61.38 
 
 
4151 aa  2212    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.59 
 
 
2604 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48.67 
 
 
2081 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.95 
 
 
3449 aa  1043    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  51.49 
 
 
2374 aa  788    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.97 
 
 
4930 aa  1045    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  51.18 
 
 
5154 aa  1089    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  34.11 
 
 
2188 aa  897    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  49.43 
 
 
4575 aa  1436    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.66 
 
 
3693 aa  1041    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.37 
 
 
2890 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  42.78 
 
 
3930 aa  1391    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.07 
 
 
3148 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  38.06 
 
 
2085 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.99 
 
 
7279 aa  1181    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.44 
 
 
2107 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.86 
 
 
2113 aa  906    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  48.14 
 
 
3508 aa  1103    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.04 
 
 
1354 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.65 
 
 
3463 aa  1063    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  51.47 
 
 
1548 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.24 
 
 
2024 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 
2230 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  54.35 
 
 
3158 aa  1065    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.17 
 
 
1349 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
3874 aa  1513    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  100 
 
 
2126 aa  4156    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.66 
 
 
3693 aa  1041    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.65 
 
 
1559 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  51.68 
 
 
1114 aa  873    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  54.3 
 
 
1593 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  38.06 
 
 
2085 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  52.07 
 
 
3494 aa  1214    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 
3676 aa  1038    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.78 
 
 
2846 aa  1029    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 
3696 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 
2333 aa  690    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 
1805 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.1 
 
 
1909 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.99 
 
 
1349 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  53.26 
 
 
3670 aa  1184    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  49 
 
 
1071 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.01 
 
 
2225 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.29 
 
 
3355 aa  1106    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  48.39 
 
 
3711 aa  1068    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  51.64 
 
 
6768 aa  1687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.1 
 
 
1816 aa  1065    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  44.54 
 
 
2847 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  51.41 
 
 
5255 aa  1187    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
1837 aa  932    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.27 
 
 
3092 aa  772    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.55 
 
 
3702 aa  1038    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.15 
 
 
4183 aa  716    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
5400 aa  1062    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  37.98 
 
 
2085 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  50.62 
 
 
2090 aa  1173    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.39 
 
 
1955 aa  730    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  61.77 
 
 
1602 aa  1691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  54.34 
 
 
1601 aa  903    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 
3679 aa  1011    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.73 
 
 
3254 aa  868    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.05 
 
 
2966 aa  1166    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 
1806 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  45.09 
 
 
1822 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>