Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Strop_2778 |
Symbol | |
ID | 5059241 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Salinispora tropica CNB-440 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_009380 |
Strand | - |
Start bp | 3149691 |
End bp | 3160826 |
Gene Length | 11136 bp |
Protein Length | 3711 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 70% |
IMG OID | 640475032 |
Product | beta-ketoacyl synthase |
Protein accession | YP_001159598 |
Protein GI | 145595301 |
COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
COG ID | [COG3321] Polyketide synthase modules and related proteins |
TIGRFAM ID | [TIGR00128] malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 4 |
Fosmid unclonability p-value | 0.00772657 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | decreased coverage |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGGCGAACG AAGAGAAGCT CCTCGACTAT CTGAAGCGGG TTACTGCCGA TCTGCACCGC ACCCGGGAAC GGCTGCGCGA GGTCGAGTCG CAGGAGCAGG ACCCGATCGC GATCATCGGG ATGGCCTGCC GCTACCCGGG CGGGGTCAGT TCGCCCGAGG ATCTGTGGCG GCTGGTCGCC GACGGCGTCG ACGCCATCGG TGACTTCCCG ACCGACCGGG GCTGGGACAC CGCAGCTCTC TACGACGCCG ACCCGGACGC CGCCGGCAGC AGCTACGTCC GGCAGGGCGG CTTCGTCCAC GACGCCGCCA AGTTCGACGC CGAGTTCTTC GGCATCTCGC CCCGCGAGGC ATTGGCCATG GACCCGCAGC AGCGGCTGGT GCTGGAGTCG AGTTGGGAGG CGTGTGAGCG GGCCGGCATC AACCCCGACT CGCTACGCGG CGGCCCTGTC GGCGTCTTCG TCGGCTGCGG CGGCCAGGAC TACTGGGACC GGCTCACGGT GCTGCCCGAA CCCGTCGAGG CGTACATGAG CACCGGCAGC GCCGGTGCGG TCATCTCCGG GCGGGTTGCG TACAGCCTCG GGCTGGAGGG GCCAGCCGTC ACCGTCAACA CCGCGTGCTC GTCGTCGCTG GTCGCCCTGC ACCTGGCCGC GCACGCGCTG CGTCAGCGGG AGTGCGGCCT GGCGCTGGCC GGCGGCGTCA CCGTCATGTC GACCCCTGGC GCGTTCGTCG CCTTCAGCCG GCAGCGTGGC CTGGCCTCCG ACGGCCGCTG CAAGCCCTTC TCCGATGACG CCGATGGTAC CGGCTGGGGT GAGGGAGTCG GCATGCTGCT GCTGGAACGC CTCTCCGACG CCCAGCGCAA CGGCCACCCG GTGCTCGCCG TCATCCGCGG TTCGGCGATC AACCAGGACG GCGCGTCCAA CGGCCTGACC GCTCCGAACG GGGTGGCCCA GCAGCGAGTC ATTCGTCAAG CCCTCGCCAA CGCCGGGCTC GCCTCGACCG ACGTCGACCT GATCGAGGCG CACGGTACCG GCACCACCCT CGGCGACCCG ATCGAGGCGG AGGCGCTGAT CGCCACGTAT GGCCACGACC GGCCGGCGGA CCGGCCCCTC TGGTTGGGCT CGGTGAAGTC CAACATCGGC CACGCCCAGG CCGCCGCCGC CGTCAGCGGC GTGATCAAGA TGGTGATGGC GCTGCGCAAC GGCGTGCTGC CCAAGAGCCT GCACGTCTCG GAACCCTCCT CGCACGTCGA CTGGTCGGCC GGCGCGGTGC ACCTGCTCAC CGAGGCGCGG CAGTGGCCGG ACCACGGCCA ACCGCGCCGG GGCGGGGTGT CGTCGTTCGG TGTGAGCGGC ACCAACGGGC ACGTGATCCT GGAGCAGGCT CCGTTGGTTG GTGACGAGGA GTCGGTGGGG TTGGTGGAGG TGGTGGATCC GCCGGTGGTG TTGTGGCCTG TGTCGGGGCG TTCGTTGGAG GGGCTTGCTG GTCAGGCGGG TCGTGTGGCG GGGTTTTGTG GTGGGGTTGG TGTGCGTGCG GTGGATGTGG GGTTGTCGTT GGGTGTGGGT CGGGCGGGGT TGGAGTTTCG GGGTGTGGCG GTGGGTCGGG AGGTGTCGGA GCTTTCTGCT GGTTTGGAGG TGGTGGCTGC TGGTGGTGGT GTGTCGGGGC GGGTGAGTTC GGGTCGTACT GCTGTTTTGT TTTCGGGTCA GGGTGCGCAG TGGGTGGGGA TGGGTCGGGA GTTGGCGGGG GCGTTTCCGG TGTTTGCGGG GGCGTTGGCG GAGGTGTGTG GGGTGTTTGG GCCGTTGTTG 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GGGCAGGGTA ACTACGCGGC GGCTAACGCT TTCCTGGACG CGTTGGCCGT GACGCGTCGT CGGGCGGGTT TGCCTGGTGT GTCGTTGGCG TGGGGGCTGT GGGGTCAGGG CTCGGCGATG ACCGAGAAAC TGTCTGATGT GGACCGCGAG CGGATGGCGC GCGGCGGGGT ACTGCCGCTG ACGACCGAGG AGGGGCTCGC CCTGCTCGAC GCCGCCGTCG CCGGCGAGCA GGCCACGCTC ATTCCGGCCC GGCTCGACGT GACGGCCCTG CGTACCCTCG GCGACCACCT GCCGCCGGTG CTGCGCGGTC TGACCGGCCC GACCCGGCGC GCCGTCGCCA CCGCCGCGAC CGCCGACCGG CCGCAGAGCG ACTGGCTGGC CGCCCTACCG GAGAACGAGC GGACCGACGC CGTCCGGCAC CTGGTCAACA CCCACGTCGC CGCCGTGCTC GGCCTCTCCG GGCCGGACGC GGTCGAGGCG GAGCGGACCT TCCAGAGCCT CGGCTTCGAC TCCCTCACCG CGGTCGAGCT GCGCAACGCG CTCTCCACGG CCGCCGGCCT GCGGCTGCCC GCCACCCTGA TCTTCGACTA CCCGACACCG CTCGCCCTTA CCGAACTCCT GCACCGCGAC CTGACCGGTG CTCTCGACGT ACCGCAGATC CGGCAGACCG TCACCACCAC GGCCGGTATC GACGAGCCGG TGGCGATCGT GGGGATGGCC TGCCGGTATC CCGGTGGTGT TTCGTCGCCG GAGGACTTGT GGCGGCTGGT CGCTGAGGGT GTCGATGCCA TCGATGGTTT TCCTGTCGAT CGGGGTTGGG ATCTCGACCG CCTCTATGAC CCGTCGGGCA GCCGTCCCGA CACCAGCTAT GCCGCCGAGG GGGGCTTCCT GCCGGGTGCG GGCGAGTTCG 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TCGTTGGGGG TGTGGACGCG GCGGTTGCGG GTGTCGCATG CGTTTCATTC GCGGTTGATG GATCCGATGG TGGCGGATTT TGGGCGGGTT GTGGGTGGGG TGCGGGGGCG TGTGGGGGGT GTGGCGGTGG TGTCGACGGT TACGGGTGAG GTGGTGACGG ATGAGGTGTT GGGGTCGGTG GGGTATTGGC AGGGGCAGGT GCGGGGGACG GTGCGGTTTG CGGATGCGGT GGCGACGTTG GTGGAGCGTG GGGTGACGCG GTTTGTGGAG GTTGGTCCGG ACAGTGTGTT GACGGGGTTG GTGGCGGAGT GTGTGCCGGA GGCGGCGGTG GTGGTGGGGT TGCAGCGGCG TGGTGGTGAT CAGGTGCGGG CGTTTGCGGC GGGGATGGGG CGGGTGTGGG CTGCTGGTGT TGATCTGGAT TGGGCTGTGG TGCATCCGGG TGGGCGGCAG GTTGATTTGC CGACGTATGC CTTCCAACAC CAGCACTACT GGCTGCACGA CACCGGAGCC GACAACGTCA CCGCTGCCGG CCTGCTCGAC GCCGAACACC CGCTGCTGTC AGCCGTCACC ACTCTCCCCG ACACCGACGG GCTTATCGCC ACTGGCCGCC TGTCCCGGCG CACCCACCCG TGGCTGGCCG ACCACGCGCT CGGCGAGACG GTCGTGCTGC CCGGCACCGG CCTGGTCGAA CTCGCCGTCC ACGCCGGTGC CCAGGTCGGC TGCGACCGGT TGGCCGAACT CGTCCTCCAG GCCCCGCTGG TCGTACCCGA CGATGGCGGG ATACAGGTGC AGGTCGCCGT CGGTGCGCCC GGCGCCGACG GCGCGCGGCC GGTCACCGTC TACTCCCGGC ACCAGGACGA GCCGTGGACC CGGCACGCCA GCGGACTGGT CGCTCCGGCC CCGCCGACCC 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CCACGACGAG TCGGCACTGG CCCTTCCGGC CGTGCTGGCC GGCGGCGAAC CGCAACTGGT CCTCCGCGAG GGCGTCGCTC ACGCCGCCCG GCTGGTGACC GCCGGCGACC CCGACGGCAC CTCCGGCAGC ACCCTCACCG CCGACGGCAC CGTCCTGCTC ACCGGCGCCG GTGGCACCCT CGGCCGGTTC GTCGCCCGGC ACCTGGTCGA GACACACGGG GTGCGGCACC TGCTGCTGGC CAGCCGGCGC GGGCCCGACG CGGACGGCAT GGCCGCGCTG CGCGCCGACC TCACCGCGCG CGGTGCCGAG GTCACCGTCG CCGCGTGCGA CCTGGCCGAC CGGGACGCGG TCGCCGCGCT GCTCGCCGGG GTGTCCGCCG ACCACCCGCT GACCGGGGTG GTGCACGCCG CCGGGCTGCT CGACGACGGA ACCATCCCCT CGCTGACCCG GGAACGCCTC GACGCGGTGC TCCGTCCCAA GGTCGACGCC GCCACCCACC TGCACGAGCT GACCCGCGAC GCAGACCTCA CCGCGTTCGT GCTCTTCTCC TCGGCGGCCG GCGTGCTCGG CGGGCCAGGC CAGGGCAACT ACGCGGCGGC GAACGCCTTC CTCGACGCGC TCGCGAACGC CCGTCGGGCG GCCGGGCTTC CCGCCCAGTC CCTCGCCTGG GGGCCGTGGG CCGGCGGCGG CATGGCCGAC AACCTCGGCG GCACCGACCG GGCCCGGATG TCCCGGGGCG GGGTGCTGTC GATGTCCAGC GAGGAGGGGC TGGACCTGCT CGACGCGGCC TTGTCCCGTA CCGACGCGGT GCTCGTGCCG GTCAAGGCTG ACCTGCGTGC CCCGGCGGCG GGAGAGGTAC CGCCGATCCT CCGCGCGCTC GTCAGCCCGG CCCGGCGGAG TGCGTCCGGC 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|
Protein sequence | MANEEKLLDY LKRVTADLHR TRERLREVES QEQDPIAIIG MACRYPGGVS SPEDLWRLVA DGVDAIGDFP TDRGWDTAAL YDADPDAAGS SYVRQGGFVH DAAKFDAEFF GISPREALAM DPQQRLVLES SWEACERAGI NPDSLRGGPV GVFVGCGGQD YWDRLTVLPE PVEAYMSTGS AGAVISGRVA YSLGLEGPAV TVNTACSSSL VALHLAAHAL RQRECGLALA GGVTVMSTPG AFVAFSRQRG LASDGRCKPF SDDADGTGWG EGVGMLLLER LSDAQRNGHP VLAVIRGSAI NQDGASNGLT APNGVAQQRV IRQALANAGL ASTDVDLIEA HGTGTTLGDP IEAEALIATY GHDRPADRPL WLGSVKSNIG HAQAAAAVSG VIKMVMALRN GVLPKSLHVS EPSSHVDWSA GAVHLLTEAR QWPDHGQPRR GGVSSFGVSG TNGHVILEQA PLVGDEESVG LVEVVDPPVV LWPVSGRSLE GLAGQAGRVA GFCGGVGVRA VDVGLSLGVG RAGLEFRGVA VGREVSELSA GLEVVAAGGG VSGRVSSGRT AVLFSGQGAQ WVGMGRELAG AFPVFAGALA EVCGVFGPLL GGDLREVMFV DGGGVLDRTG WAQPALFAVE VALFRLAESW GLVPDFVVGH SVGELVAAYV SGVWSLEDAC RVVAARGGLM EGLPGGAMLA VGGSVGELEL GGVDVAAVNG PRSVVVSGTE EEIAGLEGSL GVWTRRLRVS HAFHSRLMDP MVADFGRVVG GVRGRVGGVA VVSTVTGEVV TDEVLGSVGY WQGQVRGTVR FADAVATLVE RGVTRFVEVG PDSVLTGLVA ECVPEAAVVV GLQRRGGDQV RAFAAGMGRV WAAGVDLDWA AVHPGGRQVD LPTYAFQHQH YWIDAPADPG DATAMGLDSA DHPLLGAAVT LANADSAVLT GRLSLDRHPW LADHVVDGAV VFPGTGYVEL ALHAGAQVGA ETVDELTIET PLVLPERGAV QLQVVVGAAD AGQARSIQVY ARSADTDARW TRHASGLLTT GRRSTGTVLT EWPPTGAEPV TTDDLYHHLA TGGLVYGPVF QGLRRVWRRD DEFYAEVSLP EDVEADGFGL HPAVLDAGLH ALGLADGDTF RGLPFAWSGI TLHATGAAGV RIRLTPVGSG VRVAVADGVG APVATVDSLV LRPVQAHRAG AIADALFDLA WQEIGTPTVV TDPDWAYHSA ARPELAPTGT AQAVPSADPL ARDGATAAAL LVLTAGLGAD VAGPQAVHDE VNRVLGLVQE WLAGPNTHRL AVLTRGAVGD DVTDLAGAAV WGLLRSAQAE NPDRFLLVDA DTDQLSDVLS LALAAGEPQV RVRGGVVSVP RLVRQAVASS SVDASLFGTG VVLVTGATGA LGSVVARHLV AAHGVRRLLL LSRSGMAASG AADLVAELSA AGARVELAAC DVADRVQLAA VLAGASDLSA VVHTAGVLDD GVVSSLSAAR VSGVLRPKVD AAWLLDELTR DRELSAFVLF SSMSGVLGAP GQGNYAAANA FLDALAVTRR RAGLPGVSLA WGLWGQGSAM TEKLSDVDRE RMARGGVLPL TTEEGLALLD AAVAGEQATL IPARLDVTAL RTLGDHLPPV LRGLTGPTRR AVATAATADR PQSDWLAALP ENERTDAVRH LVNTHVAAVL GLSGPDAVEA ERTFQSLGFD SLTAVELRNA LSTAAGLRLP ATLIFDYPTP LALTELLHRD LTGALDVPQI RQTVTTTAGI DEPVAIVGMA CRYPGGVSSP EDLWRLVAEG VDAIDGFPVD RGWDLDRLYD PSGSRPDTSY AAEGGFLPGA GEFDPVFFGI SPREAVLMDP QQRQLLEVSW EAFERAGIDP ASVRGSATGV FAGVMYHDYV SGHSAGSVVS GRISYTFGLE GPAVSVDTAC SSSLVAMHLA GQALRSGECD LALAGGVTVM ATPETFVEFS RQRGLAPDGR CKPFAAGADG TGWSEGVGVL VLERLSDARR NGHRVYGVVR GSAVNQDGAS NGLTAPNGPA QQRVIRQALG NAGVSAAEVD VVEAHGTGTT LGDPIEAQAI VATYGRDRDR PLWLGSVKSN IGHTQAAAGV AGVIKMVMAM EHGMVPRTLH VDEPTPHVDW SAGDVRLAID PVEWPAVDRP RRAGVSSFGI SGTNAHVVLE QAPLVGDEES VGLVEVVDPP VVLWPVSGRS LEGLAGQAGR VAGFCGGVGV RAVDVGLSLG VGRAGLEFRG VAVGREVSEL SAGLEVVAAG GGVSGRVSSG RTAVLFSGQG AQWVGMGREL AGAFPVFAGA LAEVCGVFGP LLGGDLREVM FVDGGGVLDR TGWAQPALFA VEVALFRLAE SWGLVPDFVV GHSVGELVAA YVSGVWSLED ACRVVAARGG LMEGLPGGAM LAVGGSVGEL ELGGVDVAAV NGPRSVVVSG TEEEIAGLEG SLGVWTRRLR VSHAFHSRLM DPMVADFGRV VGGVRGRVGG VAVVSTVTGE VVTDEVLGSV GYWQGQVRGT VRFADAVATL VERGVTRFVE VGPDSVLTGL VAECVPEAAV VVGLQRRGGD QVRAFAAGMG RVWAAGVDLD WAVVHPGGRQ VDLPTYAFQH QHYWLHDTGA DNVTAAGLLD AEHPLLSAVT TLPDTDGLIA TGRLSRRTHP WLADHALGET VVLPGTGLVE LAVHAGAQVG CDRLAELVLQ APLVVPDDGG IQVQVAVGAP GADGARPVTV YSRHQDEPWT RHASGLVAPA PPTPTADPPA PWPPAAATPV DLDGLYERMA DVGLVYGPVF QGLRAAWRHG DEVYAEVALP ADTTDADRFH LHPGLFDAAL HAIGLSRGEG TSAVPFSWTG VTVHATGAVA LRVTVTPTGP EQVALTLADE SGATVARVDS LVLREIDASQ LVAARGARQE HLYRVDWTPV PLPTTRATGR WALIGADEFK VAAALDTVGL AAEAHPGLDA LTAALDAGAA APDVLVASVQ PDCHDLAAGA RQTTGHLLAL LQTWLVDERL ASSRLMILTH GAQGTTVTEP AAAAAWGLAR SAQSENPGRI VLVDLDDHDE SALALPAVLA GGEPQLVLRE GVAHAARLVT AGDPDGTSGS TLTADGTVLL TGAGGTLGRF VARHLVETHG VRHLLLASRR GPDADGMAAL RADLTARGAE VTVAACDLAD RDAVAALLAG VSADHPLTGV VHAAGLLDDG TIPSLTRERL DAVLRPKVDA ATHLHELTRD ADLTAFVLFS SAAGVLGGPG QGNYAAANAF LDALANARRA AGLPAQSLAW GPWAGGGMAD NLGGTDRARM SRGGVLSMSS EEGLDLLDAA LSRTDAVLVP VKADLRAPAA GEVPPILRAL VSPARRSASG PTRPDPAALR RTLAGLDADG QGALLRDLVR TRAATVLGHT RPDDVDPALR FVELGFDSLT AMELRNALNE VTGLRLDTGV VFDHGSIAEL AALLRTELAA PPAEEDTGPT DAADTMSALF RSAVKGGRVQ QGLSLLHAVA DIRPTFDGPP DLPEIPAPRR LARGDQGPAI VCLPSPMALG GDQQYARFTA EFGGTRDVWT LPVPGFGRDE SLPASSDAAV RVFAEMVRPI AEQGPYVIVG YSSGGLFAHA TAGELERQGH GPTGVVLLDT YLTTGSTTAT FFTHMLDSLL DREATFGEFS SARLSAMGRY IRLLESCPID SIGTPVLFVR PQESIVAGDD DGWRATWETP HTLREVPGNH FTMMEGQVGA TASVVRDWIS Q
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