More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4604 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.08 
 
 		 3470 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.65 
 
 		 4317 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  31.76 
 
 		 5953 aa  776    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.12 
 
 		 6889 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.55 
 
 		 2385 aa  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.03 
 
 		 4336 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  33.57 
 
 		 2350 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  47.58 
 
 		 4930 aa  994    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.38 
 
 		 5929 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.56 
 
 		 3432 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.79 
 
 		 2719 aa  1457    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.23 
 
 		 2066 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.37 
 
 		 4531 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.67 
 
 		 2385 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.82 
 
 		 2385 aa  735    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.56 
 
 		 2385 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.09 
 
 		 1831 aa  1055    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  32.76 
 
 		 3328 aa  700    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  49.33 
 
 		 1789 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.63 
 
 		 3021 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.38 
 
 		 4336 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  44.64 
 
 		 2060 aa  1228    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.09 
 
 		 5926 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.62 
 
 		 9498 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.99 
 
 		 5372 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  52.46 
 
 		 5154 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.72 
 
 		 13537 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.55 
 
 		 6676 aa  785    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.74 
 
 		 2867 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.13 
 
 		 2791 aa  834    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.04 
 
 		 3308 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  27.74 
 
 		 3498 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  29.72 
 
 		 2820 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 1874 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 1832 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.47 
 
 		 2604 aa  865    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.55 
 
 		 2232 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.6 
 
 		 2230 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.87 
 
 		 6072 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  29.82 
 
 		 4572 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  32.56 
 
 		 3291 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  29.4 
 
 		 4502 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  30.47 
 
 		 2136 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  31.76 
 
 		 5422 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.91 
 
 		 4882 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  33.31 
 
 		 3002 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.94 
 
 		 4332 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.69 
 
 		 2386 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.67 
 
 		 2385 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.29 
 
 		 4037 aa  700    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2106  amino acid adenylation domain-containing protein  33.29 
 
 		 1927 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  43.26 
 
 		 3711 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 		 8915 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.04 
 
 		 4489 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  45.57 
 
 		 2081 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  51.5 
 
 		 1143 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  49.44 
 
 		 3494 aa  1085    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  52.36 
 
 		 3254 aa  750    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.47 
 
 		 3291 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.97 
 
 		 6176 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  34.2 
 
 		 2188 aa  825    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.64 
 
 		 2085 aa  852    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.58 
 
 		 3508 aa  1051    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  31.04 
 
 		 3962 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  43.18 
 
 		 2352 aa  1632    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  30.79 
 
 		 4342 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  44.6 
 
 		 3463 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 		 3493 aa  950    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  29.21 
 
 		 2448 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  45.65 
 
 		 4111 aa  905    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  48.74 
 
 		 5255 aa  1064    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.05 
 
 		 1939 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.57 
 
 		 2370 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  32.56 
 
 		 5467 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 2085 aa  852    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  49.32 
 
 		 7279 aa  1078    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 		 2333 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.24 
 
 		 3158 aa  987    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  47.6 
 
 		 7210 aa  1080    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  54.42 
 
 		 1584 aa  843    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.32 
 
 		 8646 aa  774    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  44.61 
 
 		 4840 aa  862    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  49.45 
 
 		 2126 aa  1563    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  42.87 
 
 		 1616 aa  997    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  32.76 
 
 		 3352 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  46.02 
 
 		 1602 aa  1063    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  33.5 
 
 		 4383 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.36 
 
 		 6006 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.51 
 
 		 4151 aa  1680    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 		 5596 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.89 
 
 		 4317 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  35.77 
 
 		 2085 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.75 
 
 		 6081 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 		 6661 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  32.7 
 
 		 3348 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 		 8914 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.4 
 
 		 4991 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.43 
 
 		 1924 aa  901    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.5 
 
 		 2367 aa  1302    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.97 
 
 		 5328 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>