More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1248 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.78 
 
 
1305 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  56.65 
 
 
3254 aa  909    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.13 
 
 
4151 aa  1248    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.05 
 
 
4575 aa  1069    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.43 
 
 
2024 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  50.55 
 
 
1548 aa  766    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
1837 aa  974    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
5400 aa  1283    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.38 
 
 
1101 aa  794    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  47.96 
 
 
1071 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  49.64 
 
 
3711 aa  1380    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 
4111 aa  1048    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  74.62 
 
 
5255 aa  2325    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  50.67 
 
 
1924 aa  1340    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  42.91 
 
 
2847 aa  1051    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.67 
 
 
2719 aa  990    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.24 
 
 
2066 aa  1059    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.54 
 
 
1867 aa  1349    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  54.07 
 
 
3033 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.49 
 
 
2126 aa  1194    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  55.9 
 
 
1584 aa  929    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  71.86 
 
 
1789 aa  2358    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.54 
 
 
7279 aa  1473    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
2551 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.66 
 
 
1874 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.96 
 
 
2090 aa  1298    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  46.72 
 
 
1077 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.21 
 
 
1587 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 
4840 aa  1133    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.86 
 
 
3092 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.68 
 
 
1559 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
3874 aa  1362    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.13 
 
 
3355 aa  1356    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.81 
 
 
2376 aa  714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  52.09 
 
 
3408 aa  1414    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  49.54 
 
 
4930 aa  1349    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  57.12 
 
 
3158 aa  1164    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  52.66 
 
 
3148 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  46.53 
 
 
2277 aa  1323    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  48.14 
 
 
2108 aa  1118    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  47.54 
 
 
2081 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.51 
 
 
1822 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.75 
 
 
3508 aa  1436    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  67.35 
 
 
3494 aa  2095    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.81 
 
 
3493 aa  1297    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.07 
 
 
4882 aa  1166    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.02 
 
 
2107 aa  1110    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 
3693 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.93 
 
 
7210 aa  1543    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.02 
 
 
1820 aa  1308    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.55 
 
 
1126 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 
2232 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  47.3 
 
 
1573 aa  719    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  52.22 
 
 
1114 aa  888    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  43.56 
 
 
2113 aa  1115    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.84 
 
 
2136 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.37 
 
 
2374 aa  717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.55 
 
 
3449 aa  1246    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  57.94 
 
 
5154 aa  1676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1831 aa  3529    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 
1832 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  47.58 
 
 
1955 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.66 
 
 
3930 aa  1347    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.89 
 
 
6768 aa  1233    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
7110 aa  1506    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 
3693 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 
1939 aa  801    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  43.41 
 
 
3670 aa  1103    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.04 
 
 
1349 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 
2230 aa  734    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.1 
 
 
2078 aa  941    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.39 
 
 
2890 aa  733    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 
3676 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.47 
 
 
2966 aa  1315    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.25 
 
 
3696 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 
3176 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  39.64 
 
 
1805 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.33 
 
 
1804 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.77 
 
 
2333 aa  655    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  48.67 
 
 
4607 aa  1041    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  47.32 
 
 
2367 aa  976    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.72 
 
 
4264 aa  718    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.79 
 
 
1559 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  49.23 
 
 
3463 aa  1381    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.86 
 
 
1349 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.96 
 
 
4183 aa  718    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  46.29 
 
 
2020 aa  984    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  56.23 
 
 
1593 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  55.97 
 
 
1601 aa  899    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 
3702 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.14 
 
 
3101 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.4 
 
 
2846 aa  1201    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.01 
 
 
2060 aa  888    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39 
 
 
3281 aa  864    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.92 
 
 
2225 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  57.11 
 
 
1143 aa  924    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.44 
 
 
1835 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 
1816 aa  1333    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.73 
 
 
3679 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.74 
 
 
4080 aa  1216    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>