More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12961 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  73.88 
 
 
1602 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12961  polyketide synthase pks15  100 
 
 
496 aa  993    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.914056  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  71.55 
 
 
2126 aa  663    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  68.19 
 
 
4151 aa  624  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  69.79 
 
 
5154 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  64.81 
 
 
2108 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  64.64 
 
 
3463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  66.59 
 
 
2113 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  65.38 
 
 
3670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  63.38 
 
 
1071 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  68.54 
 
 
4840 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  66.74 
 
 
3494 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  63.48 
 
 
3711 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  63.54 
 
 
1867 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  65.25 
 
 
1584 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  65.43 
 
 
3408 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  65.78 
 
 
2107 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.6 
 
 
5400 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  63.82 
 
 
1101 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  65.24 
 
 
1831 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  65.81 
 
 
1789 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  66.96 
 
 
2966 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  69.68 
 
 
5255 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  65.45 
 
 
4111 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.29 
 
 
7110 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  65.81 
 
 
3493 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  66.74 
 
 
2081 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  62.55 
 
 
3449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  69.72 
 
 
3254 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  63.62 
 
 
3930 aa  578  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.45 
 
 
1816 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  67.82 
 
 
7210 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  65.84 
 
 
4080 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.13 
 
 
3092 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  62.77 
 
 
1593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  66.67 
 
 
7279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  62.53 
 
 
3355 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  64.75 
 
 
2277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  65.44 
 
 
2024 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  65.09 
 
 
1955 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  63.56 
 
 
1143 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  62.98 
 
 
3033 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  67.22 
 
 
6768 aa  568  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  63.86 
 
 
1601 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  61.82 
 
 
1305 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  65.3 
 
 
3148 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  63.74 
 
 
4930 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  62.96 
 
 
2078 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  61.34 
 
 
1820 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  65.35 
 
 
4575 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.09 
 
 
1837 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  60.35 
 
 
1548 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  58.9 
 
 
1114 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  63.56 
 
 
3158 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.73 
 
 
3874 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  60.93 
 
 
3508 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  62.39 
 
 
2719 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  59.96 
 
 
2090 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  64.16 
 
 
2374 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  63.21 
 
 
2376 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  63.32 
 
 
2367 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  59.88 
 
 
1924 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  64.25 
 
 
2846 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  60.17 
 
 
1126 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  56.77 
 
 
2066 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  62.31 
 
 
2060 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  56.02 
 
 
3281 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  60.56 
 
 
2847 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  59.11 
 
 
4882 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  58.41 
 
 
1077 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  60.14 
 
 
4607 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  59.53 
 
 
2020 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3890  erythronolide synthase  58.45 
 
 
765 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000750553  normal  0.261243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  58.31 
 
 
4264 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  53.35 
 
 
3693 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  53.35 
 
 
3693 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  55.56 
 
 
3696 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  53.61 
 
 
1573 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 
2551 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  57.84 
 
 
2666 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  53.47 
 
 
3676 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  53.85 
 
 
3702 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  55.25 
 
 
4478 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  53.03 
 
 
3679 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  47.29 
 
 
1587 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  53.29 
 
 
2880 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  48.89 
 
 
1559 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  54.42 
 
 
2477 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  53.08 
 
 
1805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.22 
 
 
1559 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.42 
 
 
1372 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  51.55 
 
 
3130 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
1874 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  48.5 
 
 
2230 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.46 
 
 
1909 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  50.81 
 
 
1656 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.56 
 
 
1349 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  50.64 
 
 
1580 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  51.33 
 
 
1876 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  48.56 
 
 
1349 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>