More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4838 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 1837 aa  926    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  54.09 
 
 		 1584 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  47.31 
 
 		 3494 aa  2514    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.89 
 
 		 1101 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.83 
 
 		 2126 aa  1067    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 1816 aa  1286    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53.84 
 
 		 1593 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.76 
 
 		 1126 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.32 
 
 		 1071 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  49.25 
 
 		 3355 aa  1280    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  43.97 
 
 		 1602 aa  937    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.94 
 
 		 2719 aa  1010    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.6 
 
 		 2066 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 		 2230 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.15 
 
 		 4575 aa  1184    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.78 
 
 		 6768 aa  2001    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.76 
 
 		 2232 aa  712    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  45.97 
 
 		 1955 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  48.21 
 
 		 4607 aa  1010    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  36.67 
 
 		 3281 aa  951    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 		 1874 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  39.35 
 
 		 3427 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.35 
 
 		 2890 aa  732    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 		 1548 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  43.78 
 
 		 2060 aa  844    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  39.85 
 
 		 4264 aa  805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  46.55 
 
 		 2376 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  39.17 
 
 		 4882 aa  1708    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 		 7110 aa  2886    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 		 3645 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  56.24 
 
 		 1143 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.49 
 
 		 3493 aa  1075    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.92 
 
 		 2367 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.76 
 
 		 3158 aa  1189    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.32 
 
 		 2081 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.3 
 
 		 2090 aa  1201    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 		 3092 aa  871    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  44.35 
 
 		 2024 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  51.02 
 
 		 1831 aa  1427    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  45.59 
 
 		 3711 aa  2361    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 		 3176 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 3693 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.04 
 
 		 3930 aa  1511    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.19 
 
 		 3408 aa  2056    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  41.22 
 
 		 2085 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.26 
 
 		 1305 aa  759    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 5154 aa  2140    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  45.76 
 
 		 4151 aa  1265    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.64 
 
 		 2966 aa  1292    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.59 
 
 		 4080 aa  1974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  43.55 
 
 		 1820 aa  1191    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  42.15 
 
 		 4840 aa  1482    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  49.3 
 
 		 1114 aa  812    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  48.32 
 
 		 1573 aa  713    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  47.23 
 
 		 5255 aa  2826    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  44.85 
 
 		 1077 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  57.97 
 
 		 1924 aa  1641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.77 
 
 		 4478 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.06 
 
 		 2880 aa  716    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  47.03 
 
 		 3033 aa  878    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 3693 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.56 
 
 		 2277 aa  1306    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.7 
 
 		 1867 aa  1179    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 		 3874 aa  1453    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  41.22 
 
 		 2085 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  42.36 
 
 		 2846 aa  1117    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 4930 aa  9418    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 3676 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.41 
 
 		 3696 aa  750    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  46.73 
 
 		 3148 aa  898    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.57 
 
 		 2113 aa  1040    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 		 5400 aa  2556    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.79 
 
 		 1828 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  44.04 
 
 		 2107 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.01 
 
 		 4111 aa  1786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  45.5 
 
 		 7279 aa  2126    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.25 
 
 		 4183 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.05 
 
 		 2374 aa  757    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.79 
 
 		 1939 aa  756    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  48.04 
 
 		 3254 aa  954    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  45.7 
 
 		 7210 aa  2876    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.77 
 
 		 1822 aa  727    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 3702 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.06 
 
 		 3449 aa  1291    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  42.52 
 
 		 2847 aa  1078    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  41.05 
 
 		 2085 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  43.27 
 
 		 3670 aa  1304    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  51.29 
 
 		 1789 aa  1457    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52.68 
 
 		 1601 aa  807    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  45.42 
 
 		 3463 aa  2348    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  47.92 
 
 		 2108 aa  1063    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.14 
 
 		 3679 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.22 
 
 		 2078 aa  928    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.18 
 
 		 3508 aa  2344    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.37 
 
 		 2136 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  43.89 
 
 		 2020 aa  925    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  38.11 
 
 		 1827 aa  637  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.84 
 
 		 2225 aa  635  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.94 
 
 		 1909 aa  635  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 		 1805 aa  630  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>