More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0495 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  55.19 
 
 
7210 aa  908    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.96 
 
 
3711 aa  773    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  50.11 
 
 
2367 aa  751    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  50.7 
 
 
2060 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  49.26 
 
 
1071 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  52.23 
 
 
3158 aa  822    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  45.88 
 
 
1584 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  54.15 
 
 
3148 aa  770    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  50.91 
 
 
2107 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.07 
 
 
1114 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.65 
 
 
2719 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  49.04 
 
 
2066 aa  808    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.4 
 
 
3355 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  53.43 
 
 
1602 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  46.21 
 
 
2020 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.34 
 
 
1559 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  54.47 
 
 
7279 aa  820    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
2551 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
1874 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.29 
 
 
1656 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.76 
 
 
2090 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 
1587 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 
2762 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 
4930 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  45.93 
 
 
1924 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  50.77 
 
 
3408 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  49.08 
 
 
3508 aa  708    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.65 
 
 
1087 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.55 
 
 
1831 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.45 
 
 
3463 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  48.14 
 
 
5255 aa  675    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  51.53 
 
 
2081 aa  795    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  100 
 
 
1126 aa  2190    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  43.76 
 
 
3281 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.27 
 
 
2846 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  46.83 
 
 
1143 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.63 
 
 
2966 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  43.72 
 
 
3693 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  47.41 
 
 
2376 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  53.46 
 
 
4575 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  53.83 
 
 
4151 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.26 
 
 
4111 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.16 
 
 
1837 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  46.32 
 
 
2108 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  37.2 
 
 
1354 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.24 
 
 
1559 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.71 
 
 
3176 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  54 
 
 
5154 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.09 
 
 
4478 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.21 
 
 
2113 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.09 
 
 
3874 aa  778    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  43.72 
 
 
3693 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  50.99 
 
 
4882 aa  771    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  46.44 
 
 
3449 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.96 
 
 
1101 aa  939    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  47.05 
 
 
2277 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  53.85 
 
 
1955 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  50.47 
 
 
2847 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47 
 
 
3930 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  56.6 
 
 
4080 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  48.47 
 
 
1789 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.95 
 
 
1816 aa  853    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  50.11 
 
 
6768 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  50.53 
 
 
2024 aa  767    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.97 
 
 
3092 aa  832    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.05 
 
 
3033 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.72 
 
 
2126 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  46.43 
 
 
1601 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  41.12 
 
 
1349 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  52.58 
 
 
3494 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.97 
 
 
1305 aa  711    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.99 
 
 
5400 aa  859    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  43.39 
 
 
3702 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.63 
 
 
1402 aa  723    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  50.83 
 
 
3670 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  47.26 
 
 
2374 aa  830    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.36 
 
 
7110 aa  873    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  51.24 
 
 
1548 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  56.23 
 
 
3254 aa  883    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.89 
 
 
2078 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  51.91 
 
 
4840 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  46.79 
 
 
1593 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.39 
 
 
1867 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.91 
 
 
3493 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.12 
 
 
1349 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  47.52 
 
 
4607 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  40.67 
 
 
1017 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  43.65 
 
 
3676 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  44.25 
 
 
3424 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  44.51 
 
 
1820 aa  631  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  43.54 
 
 
3679 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.99 
 
 
3337 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.25 
 
 
4264 aa  619  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  40.33 
 
 
2477 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  35.97 
 
 
3252 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  37.38 
 
 
2551 aa  612  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.39 
 
 
3696 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.29 
 
 
1337 aa  609  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  41.19 
 
 
3645 aa  609  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 
2462 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>