More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0170 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  35.02 
 
 
1806 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  33.59 
 
 
3711 aa  846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.47 
 
 
1909 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  35.85 
 
 
3408 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.91 
 
 
1822 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.31 
 
 
1349 aa  833    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.61 
 
 
2126 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.56 
 
 
7210 aa  897    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
3645 aa  7225    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  46.6 
 
 
3337 aa  723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  38.28 
 
 
4151 aa  800    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.91 
 
 
2719 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  32.44 
 
 
2134 aa  646    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 
2230 aa  821    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.97 
 
 
2462 aa  1036    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  35.27 
 
 
4882 aa  946    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 
3493 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
1816 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 
2047 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  40.36 
 
 
3254 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
2551 aa  903    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 
1874 aa  1246    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.85 
 
 
1656 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 
1144 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  47.76 
 
 
1587 aa  821    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 
4840 aa  722    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.25 
 
 
3508 aa  1189    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.5 
 
 
1832 aa  867    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 
2880 aa  868    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  32.49 
 
 
4930 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.4 
 
 
3252 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  38.06 
 
 
2604 aa  776    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  38.89 
 
 
4575 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.87 
 
 
3101 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.73 
 
 
1349 aa  832    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.18 
 
 
950 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.43 
 
 
3111 aa  804    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.23 
 
 
2136 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
5154 aa  736    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.72 
 
 
4080 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  34.25 
 
 
2846 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  48.34 
 
 
1337 aa  817    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.47 
 
 
3693 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  45.86 
 
 
1087 aa  830    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.37 
 
 
2225 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.91 
 
 
3670 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 
2333 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  33.21 
 
 
1704 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 
3463 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  37.74 
 
 
2551 aa  833    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 
1909 aa  976    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  47.73 
 
 
1354 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  36.22 
 
 
3494 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.68 
 
 
2890 aa  872    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
5400 aa  1538    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5925  beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 
2644 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  46.39 
 
 
1559 aa  824    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 
3176 aa  1119    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.16 
 
 
4478 aa  1002    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.84 
 
 
1372 aa  705    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  45.74 
 
 
2762 aa  785    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  32.92 
 
 
1823 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.47 
 
 
3693 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  35.49 
 
 
3158 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  35.55 
 
 
1966 aa  885    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 
3874 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  37.07 
 
 
7279 aa  1295    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  37.17 
 
 
4264 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  33.21 
 
 
1704 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 
3676 aa  881    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  45.07 
 
 
2477 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.16 
 
 
3696 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  34.2 
 
 
1820 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
1805 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.6 
 
 
1804 aa  843    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
3092 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 
1828 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.52 
 
 
3930 aa  807    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  37.97 
 
 
1602 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.7 
 
 
3449 aa  809    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.78 
 
 
6768 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.32 
 
 
2090 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  42.07 
 
 
3099 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.93 
 
 
2232 aa  861    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.19 
 
 
2078 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
7110 aa  1516    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.42 
 
 
3702 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 
3033 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.43 
 
 
1867 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  45.42 
 
 
3424 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 
1704 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  32.69 
 
 
4183 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.02 
 
 
1939 aa  918    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 
3679 aa  872    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.28 
 
 
1559 aa  824    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 
5255 aa  1263    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  37.59 
 
 
1827 aa  635  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  34.32 
 
 
2220 aa  632  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.94 
 
 
2085 aa  632  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
2085 aa  632  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>