More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4134 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  56.31 
 
 		 3033 aa  880    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  50.82 
 
 		 2376 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.11 
 
 		 2966 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.18 
 
 		 5400 aa  994    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.18 
 
 		 1305 aa  887    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  49.14 
 
 		 2847 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  45.7 
 
 		 2719 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  50.54 
 
 		 2066 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  52.37 
 
 		 2367 aa  893    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  54.71 
 
 		 4151 aa  907    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  52.53 
 
 		 2108 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  40.7 
 
 		 1349 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  53.54 
 
 		 2107 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 2551 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 1874 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 		 1656 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.34 
 
 		 2078 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.58 
 
 		 1587 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 		 1837 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  56.59 
 
 		 3494 aa  931    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  56.24 
 
 		 1602 aa  936    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  44.14 
 
 		 1143 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  53.35 
 
 		 1955 aa  867    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  43.89 
 
 		 2047 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.24 
 
 		 3092 aa  954    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.22 
 
 		 3252 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.16 
 
 		 4607 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 		 2462 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 		 3176 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  48.81 
 
 		 2846 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  44.07 
 
 		 1402 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  52.41 
 
 		 2081 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  53.91 
 
 		 3148 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  51.08 
 
 		 2277 aa  806    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.05 
 
 		 1867 aa  776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  46.94 
 
 		 3449 aa  766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.51 
 
 		 3493 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  46.19 
 
 		 3281 aa  709    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  45.12 
 
 		 3693 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  43.46 
 
 		 3424 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.3 
 
 		 6768 aa  807    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.53 
 
 		 3355 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.52 
 
 		 1559 aa  698    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.18 
 
 		 2374 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  55.2 
 
 		 7210 aa  958    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  50.38 
 
 		 3408 aa  812    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  47.57 
 
 		 4930 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  38.69 
 
 		 2551 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.42 
 
 		 2090 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 		 1354 aa  758    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  45.53 
 
 		 1114 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  46.6 
 
 		 2020 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  40.05 
 
 		 1077 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  48.92 
 
 		 1601 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.18 
 
 		 4478 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.51 
 
 		 1087 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  54.4 
 
 		 5154 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  45.12 
 
 		 3693 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  58.51 
 
 		 3254 aa  953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  46.06 
 
 		 3400 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  51.41 
 
 		 4575 aa  783    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.9 
 
 		 1337 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  52.58 
 
 		 4882 aa  851    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  49.25 
 
 		 1584 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.16 
 
 		 1831 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  44.8 
 
 		 3676 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.59 
 
 		 2477 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  46.28 
 
 		 3696 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.03 
 
 		 1071 aa  945    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  100 
 
 		 1101 aa  2217    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  55.76 
 
 		 2113 aa  929    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.6 
 
 		 1820 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 		 3874 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.91 
 
 		 1349 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  52.74 
 
 		 4840 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  53.05 
 
 		 1548 aa  906    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  49.95 
 
 		 2126 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  43.06 
 
 		 1017 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  48.54 
 
 		 3508 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  50 
 
 		 1789 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  55.03 
 
 		 3711 aa  921    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  47.45 
 
 		 1924 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  48.77 
 
 		 4111 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  53.01 
 
 		 2060 aa  810    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 		 3702 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  52.94 
 
 		 3158 aa  915    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.95 
 
 		 7110 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.67 
 
 		 1816 aa  941    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  55.76 
 
 		 7279 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  54.26 
 
 		 3463 aa  879    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  49.75 
 
 		 2024 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.34 
 
 		 5255 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  41.67 
 
 		 3337 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.38 
 
 		 1593 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.35 
 
 		 1559 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  44.38 
 
 		 3679 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 		 2880 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47.32 
 
 		 3930 aa  753    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  51.74 
 
 		 3670 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  58.49 
 
 		 4080 aa  927    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>