More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5779 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.6 
 
 		 1087 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.26 
 
 		 3645 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.83 
 
 		 1559 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  41.07 
 
 		 2762 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  41.38 
 
 		 7210 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  36.74 
 
 		 2134 aa  951    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.7 
 
 		 1337 aa  708    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 		 2551 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 1874 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 		 1656 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 		 1587 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 		 2462 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2047 aa  4029    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.44 
 
 		 1349 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 		 3693 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 7110 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 2551 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.04 
 
 		 1354 aa  718    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.33 
 
 		 4478 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 		 3693 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  43.08 
 
 		 3676 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  42.62 
 
 		 3696 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.27 
 
 		 1349 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 		 1816 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.89 
 
 		 1101 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.95 
 
 		 3176 aa  750    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.06 
 
 		 1372 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.78 
 
 		 3702 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.7 
 
 		 1559 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42.02 
 
 		 1602 aa  633  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 5400 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.89 
 
 		 3252 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  41.39 
 
 		 3158 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 		 5154 aa  636  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  42.13 
 
 		 3679 aa  631  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  42.02 
 
 		 2081 aa  625  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  42.78 
 
 		 1548 aa  622  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.91 
 
 		 1804 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.36 
 
 		 3337 aa  619  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  41.09 
 
 		 7279 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.04 
 
 		 2880 aa  619  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 3130 aa  612  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  38.31 
 
 		 2604 aa  611  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  42.95 
 
 		 4080 aa  612  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  33.18 
 
 		 2232 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.02 
 
 		 4151 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 		 3092 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  41.2 
 
 		 1402 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.78 
 
 		 950 aa  603  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.33 
 
 		 2066 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.37 
 
 		 2113 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  42.42 
 
 		 1955 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  38.62 
 
 		 2367 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  42.12 
 
 		 3254 aa  595  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.66 
 
 		 2890 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.27 
 
 		 1867 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.63 
 
 		 1939 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.56 
 
 		 3427 aa  592  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  37.85 
 
 		 3930 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.25 
 
 		 1144 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  40.78 
 
 		 3670 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 		 2333 aa  586  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  40.73 
 
 		 3424 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  39.21 
 
 		 3463 aa  583  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 3711 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 		 1909 aa  582  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  42.87 
 
 		 2374 aa  582  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.27 
 
 		 2966 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  42.17 
 
 		 2376 aa  579  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41 
 
 		 2477 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.47 
 
 		 3449 aa  576  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  38.23 
 
 		 3494 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.68 
 
 		 1126 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  35.65 
 
 		 3718 aa  568  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.93 
 
 		 2136 aa  570  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  38.5 
 
 		 3099 aa  570  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  39.53 
 
 		 4607 aa  567  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 		 4840 aa  565  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  37.77 
 
 		 3408 aa  567  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 		 2230 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  34.52 
 
 		 4882 aa  562  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  38.67 
 
 		 2090 aa  563  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 		 2985 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.58 
 
 		 2078 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  33.29 
 
 		 2719 aa  557  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  40.06 
 
 		 2024 aa  556  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  40.58 
 
 		 3033 aa  555  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  38.23 
 
 		 3508 aa  555  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.66 
 
 		 6889 aa  553  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 1837 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  39.8 
 
 		 4165 aa  553  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  32.44 
 
 		 2225 aa  551  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 		 1520 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 		 1520 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  35.95 
 
 		 2277 aa  553  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  40.92 
 
 		 1071 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  38.41 
 
 		 1114 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 		 4111 aa  546  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.48 
 
 		 1789 aa  542  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  40.28 
 
 		 1795 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>