More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4356 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  45.27 
 
 		 3711 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  44.03 
 
 		 2374 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.31 
 
 		 3033 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  44.28 
 
 		 5154 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  46.25 
 
 		 3463 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  43.82 
 
 		 2376 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 		 7279 aa  1162    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  47.59 
 
 		 4080 aa  725    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  45.7 
 
 		 3254 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 		 5400 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.29 
 
 		 1101 aa  678    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  45.46 
 
 		 3670 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  44.56 
 
 		 4151 aa  704    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.32 
 
 		 2367 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.72 
 
 		 3092 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 		 7210 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  39.19 
 
 		 6768 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  42.99 
 
 		 4882 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 		 7110 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.88 
 
 		 1816 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  100 
 
 		 3400 aa  6467    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.12 
 
 		 1548 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.73 
 
 		 3158 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  48.38 
 
 		 2113 aa  637  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  40.18 
 
 		 1584 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  44.85 
 
 		 3148 aa  628  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  44.26 
 
 		 3408 aa  630  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  37.76 
 
 		 4264 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.88 
 
 		 3494 aa  620  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  42.6 
 
 		 1955 aa  615  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.42 
 
 		 4840 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  36.11 
 
 		 3281 aa  612  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  45.07 
 
 		 2066 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  46.3 
 
 		 1602 aa  612  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.21 
 
 		 4111 aa  610  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.56 
 
 		 3493 aa  606  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.09 
 
 		 3508 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  45.26 
 
 		 2126 aa  595  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 		 2880 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  39.75 
 
 		 4930 aa  596  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.37 
 
 		 2081 aa  592  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  42.99 
 
 		 2847 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.38 
 
 		 1126 aa  590  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.41 
 
 		 4575 aa  587  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.54 
 
 		 2762 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  39.53 
 
 		 2277 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  30.65 
 
 		 1559 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.38 
 
 		 2107 aa  583  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  43.16 
 
 		 5255 aa  579  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  46.06 
 
 		 2966 aa  579  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.47 
 
 		 1559 aa  576  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  46.42 
 
 		 3355 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 		 1837 aa  570  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.3 
 
 		 3930 aa  567  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  43.5 
 
 		 1601 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  40.79 
 
 		 1114 aa  566  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 3874 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  47.51 
 
 		 2060 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  40.53 
 
 		 2024 aa  567  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.06 
 
 		 2090 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  42.51 
 
 		 1789 aa  559  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  41.15 
 
 		 3449 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  44.83 
 
 		 1071 aa  552  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.02 
 
 		 4478 aa  552  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.08 
 
 		 4607 aa  553  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.2 
 
 		 1867 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 3702 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.92 
 
 		 2719 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.55 
 
 		 1305 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.35 
 
 		 1402 aa  545  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  41.81 
 
 		 2108 aa  546  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 		 3693 aa  544  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 		 3693 aa  544  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  43.6 
 
 		 1820 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 2551 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 		 1831 aa  537  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  44.82 
 
 		 1593 aa  533  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 		 3676 aa  530  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  43.6 
 
 		 1924 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  40.94 
 
 		 2846 aa  523  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  42.66 
 
 		 2020 aa  522  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 		 3679 aa  524  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  41.47 
 
 		 1143 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.92 
 
 		 3696 aa  513  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  33.75 
 
 		 4165 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.69 
 
 		 2078 aa  510  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  40.14 
 
 		 1017 aa  506  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 1874 aa  504  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  34.23 
 
 		 1354 aa  503  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.73 
 
 		 3176 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.81 
 
 		 1587 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.21 
 
 		 1656 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.26 
 
 		 1349 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.26 
 
 		 1349 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.76 
 
 		 1372 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.04 
 
 		 2477 aa  480  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  37.72 
 
 		 2047 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  40.11 
 
 		 1573 aa  469  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3890  erythronolide synthase  47.35 
 
 		 765 aa  467  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000750553  normal  0.261243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  39.52 
 
 		 3045 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>