More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3293 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  49.74 
 
 		 3463 aa  1250    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.07 
 
 		 4151 aa  1133    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.33 
 
 		 3711 aa  2134    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  54.35 
 
 		 2966 aa  1910    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  51.84 
 
 		 3670 aa  1145    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  46.64 
 
 		 3033 aa  985    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.53 
 
 		 2847 aa  1098    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.62 
 
 		 2333 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 		 2462 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  58.17 
 
 		 1584 aa  1033    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.21 
 
 		 2719 aa  983    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.58 
 
 		 2066 aa  1024    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.61 
 
 		 2230 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  52.12 
 
 		 1114 aa  910    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 		 3092 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  52.56 
 
 		 2126 aa  1187    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  58.62 
 
 		 1593 aa  899    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  54.58 
 
 		 5255 aa  2491    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.71 
 
 		 1143 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.8 
 
 		 2090 aa  1295    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 1874 aa  842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.72 
 
 		 1909 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  44.36 
 
 		 4882 aa  1431    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  51.1 
 
 		 1077 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  44.05 
 
 		 2024 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.6 
 
 		 2232 aa  729    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.48 
 
 		 2890 aa  695    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  53.06 
 
 		 4575 aa  1072    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  47.61 
 
 		 2367 aa  996    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  45.06 
 
 		 4840 aa  1111    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.78 
 
 		 1804 aa  736    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 		 5400 aa  2098    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  48.45 
 
 		 1573 aa  744    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.45 
 
 		 3874 aa  1699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  54.14 
 
 		 7210 aa  2379    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  47.92 
 
 		 3254 aa  1035    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  46.83 
 
 		 2081 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39.65 
 
 		 3281 aa  888    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  52.46 
 
 		 1789 aa  1487    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  49.6 
 
 		 1924 aa  1300    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  52.03 
 
 		 1831 aa  1460    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.19 
 
 		 3158 aa  1117    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.85 
 
 		 3176 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 3693 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  53.57 
 
 		 3494 aa  2310    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  50 
 
 		 2108 aa  1143    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.43 
 
 		 4183 aa  880    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  100 
 
 		 3408 aa  6539    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.77 
 
 		 2078 aa  1023    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  47.05 
 
 		 2107 aa  1118    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  62.31 
 
 		 6768 aa  1451    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  50.47 
 
 		 3508 aa  2156    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.65 
 
 		 2136 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  51.84 
 
 		 5154 aa  2171    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.96 
 
 		 4930 aa  2024    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.81 
 
 		 3493 aa  1255    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.41 
 
 		 7110 aa  2531    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  46.43 
 
 		 4111 aa  1996    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.91 
 
 		 1955 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.46 
 
 		 4478 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 		 3645 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.81 
 
 		 1602 aa  1025    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 3693 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  45.34 
 
 		 3449 aa  1263    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.67 
 
 		 1822 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.35 
 
 		 2225 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  55.42 
 
 		 3148 aa  845    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  50.09 
 
 		 2277 aa  1346    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.71 
 
 		 1126 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.65 
 
 		 3676 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  47.83 
 
 		 4607 aa  988    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 		 3696 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47 
 
 		 1867 aa  1353    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  55.82 
 
 		 3355 aa  1966    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  47.18 
 
 		 2020 aa  974    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.21 
 
 		 2880 aa  715    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.59 
 
 		 1305 aa  877    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 1837 aa  1004    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.78 
 
 		 1816 aa  1380    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.06 
 
 		 7279 aa  2232    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  49.16 
 
 		 2376 aa  779    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  49.6 
 
 		 2374 aa  781    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.2 
 
 		 2060 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 1832 aa  776    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  47.48 
 
 		 4264 aa  727    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  48.95 
 
 		 1820 aa  1306    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 3702 aa  747    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  50.27 
 
 		 1548 aa  777    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.21 
 
 		 2846 aa  1187    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  57.4 
 
 		 1601 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.33 
 
 		 1101 aa  814    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 		 1704 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  50.62 
 
 		 1071 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.99 
 
 		 2113 aa  1195    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 1939 aa  796    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 		 3679 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.95 
 
 		 1966 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  38.78 
 
 		 1827 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47.3 
 
 		 3930 aa  1355    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  51.39 
 
 		 4080 aa  2124    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>