More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0405 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 
3711 aa  852    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.61 
 
 
1349 aa  792    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 
3089 aa  1043    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.3 
 
 
2719 aa  974    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  36.58 
 
 
2066 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  34.09 
 
 
3093 aa  1055    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  33 
 
 
2101 aa  806    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  38.38 
 
 
3781 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  38.18 
 
 
5255 aa  814    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  38.7 
 
 
3780 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  38.05 
 
 
1601 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 
2230 aa  1044    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
2551 aa  868    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
1874 aa  924    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.65 
 
 
1656 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.92 
 
 
1144 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  45.75 
 
 
1587 aa  796    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 
1939 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.79 
 
 
3130 aa  1239    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.77 
 
 
3493 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  35.78 
 
 
1537 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  45.65 
 
 
1337 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  34.75 
 
 
4930 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.63 
 
 
3252 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 
1955 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  36.85 
 
 
3494 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.61 
 
 
3508 aa  749    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  39.46 
 
 
1548 aa  811    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 
2081 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.86 
 
 
3111 aa  656    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  38.91 
 
 
4165 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.4 
 
 
1816 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  37.57 
 
 
2367 aa  1013    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  31.53 
 
 
3080 aa  812    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 
1559 aa  972    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  81.54 
 
 
3693 aa  5955    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 
3033 aa  863    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 
1520 aa  722    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  41.12 
 
 
2374 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 
1580 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.5 
 
 
2085 aa  877    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.53 
 
 
1832 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42.42 
 
 
1602 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.7 
 
 
4151 aa  920    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.12 
 
 
2551 aa  787    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  33.09 
 
 
1909 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.59 
 
 
1354 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  40 
 
 
3148 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  38.83 
 
 
3355 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  38.52 
 
 
7210 aa  920    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
5400 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  38.06 
 
 
1789 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 
4111 aa  754    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 
1831 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.73 
 
 
4478 aa  1088    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 
3254 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.98 
 
 
2462 aa  810    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.06 
 
 
3158 aa  862    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  81.54 
 
 
3693 aa  5955    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 
3463 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  34.55 
 
 
1520 aa  722    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 
2333 aa  751    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 
1580 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
2085 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  38.34 
 
 
2090 aa  675    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  42.15 
 
 
2376 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  81.94 
 
 
3676 aa  5957    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  67.79 
 
 
2477 aa  1196    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  67.95 
 
 
3696 aa  4795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  33.97 
 
 
2111 aa  871    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.31 
 
 
1805 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  43.73 
 
 
2880 aa  903    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 
1581 aa  732    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
7110 aa  913    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.43 
 
 
1827 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  41.57 
 
 
7279 aa  1416    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.02 
 
 
2762 aa  921    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.8 
 
 
2108 aa  842    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.35 
 
 
3874 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 
3645 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
2232 aa  1154    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.47 
 
 
2024 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  33.61 
 
 
2126 aa  852    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  34.47 
 
 
3090 aa  1062    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  81.42 
 
 
3702 aa  5954    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  38.21 
 
 
1584 aa  747    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  41.46 
 
 
3099 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  34.96 
 
 
1580 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.59 
 
 
2085 aa  878    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  37.09 
 
 
2604 aa  1062    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  36.84 
 
 
2126 aa  981    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 
5154 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  39.85 
 
 
4840 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.74 
 
 
3176 aa  1223    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
3679 aa  7372    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  35.44 
 
 
2188 aa  947    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  34.46 
 
 
2220 aa  934    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 
3092 aa  1539    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  40.76 
 
 
4575 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.74 
 
 
1087 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>