More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7002 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
5400 aa  1253    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.6 
 
 
4111 aa  1042    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.34 
 
 
1837 aa  1187    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.65 
 
 
4882 aa  1154    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  52.46 
 
 
1143 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  52.73 
 
 
3254 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  50.53 
 
 
7210 aa  1495    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  46.43 
 
 
3463 aa  1247    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 
1835 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.03 
 
 
4840 aa  1148    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  45.92 
 
 
4080 aa  1216    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.98 
 
 
2719 aa  998    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.22 
 
 
2066 aa  1017    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  39.1 
 
 
2225 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  54.59 
 
 
1584 aa  918    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
1816 aa  1253    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  47.45 
 
 
3494 aa  1289    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 
4930 aa  1132    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
1874 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.38 
 
 
2890 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  47.17 
 
 
1573 aa  698    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 
2367 aa  921    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 
3092 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  46.49 
 
 
2374 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.76 
 
 
2126 aa  1126    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.28 
 
 
4607 aa  968    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.75 
 
 
3930 aa  1321    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  46.95 
 
 
6768 aa  1039    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  50.21 
 
 
3493 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  47.19 
 
 
1924 aa  1191    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.85 
 
 
2333 aa  695    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.66 
 
 
1832 aa  837    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.63 
 
 
1789 aa  1357    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.8 
 
 
2081 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.06 
 
 
3111 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.33 
 
 
2966 aa  1068    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  45.96 
 
 
1831 aa  1318    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.96 
 
 
3158 aa  950    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.12 
 
 
2020 aa  947    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  43.31 
 
 
3670 aa  1072    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
3693 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.78 
 
 
2078 aa  737    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.85 
 
 
3449 aa  1229    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
3874 aa  1236    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  43.8 
 
 
2113 aa  1117    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.12 
 
 
2232 aa  713    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  45.28 
 
 
1602 aa  942    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.69 
 
 
1867 aa  1325    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.83 
 
 
3508 aa  1349    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.91 
 
 
1101 aa  737    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 
2060 aa  812    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  47.9 
 
 
5255 aa  1361    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  46.69 
 
 
1071 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.65 
 
 
2277 aa  1247    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  47.34 
 
 
2108 aa  1070    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  100 
 
 
1820 aa  3575    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
3693 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.19 
 
 
4183 aa  705    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  51.86 
 
 
2846 aa  1537    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52.32 
 
 
1601 aa  863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  44.99 
 
 
2090 aa  1194    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  44.22 
 
 
2107 aa  1062    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.7 
 
 
1939 aa  825    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 
3676 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  50.38 
 
 
1114 aa  836    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  46.44 
 
 
1548 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  46.7 
 
 
1077 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.02 
 
 
1593 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.37 
 
 
7279 aa  1462    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  42.96 
 
 
2847 aa  1095    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.93 
 
 
3355 aa  1283    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.07 
 
 
3711 aa  1292    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  48.92 
 
 
3033 aa  737    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.99 
 
 
4575 aa  969    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.4 
 
 
1909 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.81 
 
 
1126 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  47.39 
 
 
4151 aa  1076    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.78 
 
 
3148 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.45 
 
 
3702 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.81 
 
 
1822 aa  809    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.27 
 
 
3176 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  46.36 
 
 
4264 aa  693    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  38.32 
 
 
3281 aa  910    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 
2230 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  46.71 
 
 
5154 aa  1216    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 
7110 aa  1417    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  48.76 
 
 
3408 aa  1266    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 
3679 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  47.07 
 
 
2376 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.91 
 
 
2136 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.32 
 
 
1305 aa  832    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  45.07 
 
 
1955 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  37.17 
 
 
2220 aa  635  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.13 
 
 
2551 aa  632  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  38.34 
 
 
1827 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.19 
 
 
3696 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  43.74 
 
 
3424 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.95 
 
 
1144 aa  621  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.49 
 
 
3101 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  36.7 
 
 
2085 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>